Q8WXF1  PSPC1_HUMAN

Gene name: PSPC1   Description: Paraspeckle component 1

Length: 523    GTS: 7.122e-07   GTS percentile: 0.108     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 179      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESAVGESEPAAAAAMALALAGEPAPPAPAPPEDHPDEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKR 100
gnomAD_SAV:    #   #     #    L G  T  T    TKL  V  TV G# WKLVA VS   K QL   K#  VN  #     K          M S     M D    
Conservation:  2401022100000110110022222220000222200020020110222222222222000132313014233444154653133353342422322321
SS_PSIPRED:          EEEEEEEE          EE   HHHHHHHHHHHH                          HH            EEEEEE       HHHHHH
SS_SPIDER3:            EEEEEE          EE   HHHHHHHHHHHH                 HH     E HH      E    EEEEEEEE      HHHHHH
SS_PSSPRED:          EEEEEEE                HHHHHHHHHHHHH                     EEEE              EEEEE        HHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBB           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D                                  
DO_SPOTD:      DDDD                               D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                        
DO_IUPRED2A:                       DDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGF 200
gnomAD_SAV:    P         F  S        G A         T    I     SV#T  T    S SLR    F P            AL   I     H        
Conservation:  3514373223343322535233344554444665387831153573537556353568364663335565455467414825564332333455424564
SS_PSIPRED:    HHHHH   EEEEEE    EEEEEE  HHHHHHHHHHH   EE  EE EEEEE    EEEEE       HHHHHHHHHHH  EEEEEEEE     EEEEEE
SS_SPIDER3:    HHH H   EEEEEE    EEEEE   HHHHHHHHHHH   EE  EEEEEEEE     EEEE       HHHHHHHH     EEEEEEEE     EEEEEE
SS_PSSPRED:    HHHHH   EEEEEE     EEEE   HHHHHHHHHHH        EEEEEEE    EEEEE       HHHHHHHHHH   EEEEEEEE         EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                      D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREA 300
gnomAD_SAV:        G                   M# C       D   #    S   V            L H  R       C        G          T  G  
Conservation:  4553352363554534134444443384833486155262558557623264425333121243443444644554246557255559544484444455
SS_PSIPRED:    EEE   HHHHHHHHHH    EE      EEEEEE           HHHH                      HHHHHEEEEHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EE    HHHHHHHHHH            EEEEEE           HHH      HHH                HEH EEHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEE   HHHHHHHHHH    EE      EEEEE             HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                   D D DDDDD          
DO_SPOTD:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:   D                              DDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               DDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENREQEMRMGDMGPRG 400
gnomAD_SAV:                        K   #       H      P  * Q    P   A  QWH   I  Q QE   WQ   D  ASF A  K A# V  L  H 
Conservation:  3585826654633566435445343545654567883534644563322555586474377645343325424352433223512245364355543142
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDD     DDDDDD          DDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AINMGDAFSPAPAGNQGPPPMMGMNMNNRATIPGPPMGPGPAMGPEGAANMGTPMMPDNGAVHNDRFPQGPPSQMGSPMGSRTGSETPQAPMSGVGPVSG 500
gnomAD_SAV:      KI G#  Q  VA   LT   S    K   TS R   L L #A    TSV                      R   S     AC  H      IS    
Conservation:  2234232222223334222222233322422222222223331222322222212124231110323112101222212222222222222222222222
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:              S                                                               S   S                       

                       10        20   
AA:            GPGGFGRGSQGGNFEGPNKRRRY 523
gnomAD_SAV:    #   SD     S   A S HH  
Conservation:  22122123122324432022122
SS_PSIPRED:                           
SS_SPIDER3:                           
SS_PSSPRED:                           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:              S              
MODRES_M:            R