Q8WXF7  ATLA1_HUMAN

Gene name: ATL1   Description: Atlastin-1

Length: 558    GTS: 7.044e-07   GTS percentile: 0.105     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 41      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 168      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAKNRRDRNSWGGFSEKTYEWSSEEEEPVKKAGPVQVLIVKDDHSFELDETALNRILLSEAVRDKEVVAVSVAGAFRKGKSFLMDFMLRYMYNQESVDWV 100
PathogenicSAV:                                                                  Q                                  
BenignSAV:             K                                 E                                                         
gnomAD_SAV:       S KG S CD LL    KG LQ#   L   A     V   V  S        WT FL V    KA  L IT T           I  HI SP      
Conservation:  0000022002222222222222222100011325455513332315084203721475121444324656565858466855466545642201000095
SS_PSIPRED:                                      EEEEEE     EEE HHHHHHHH         EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:                                      EEEEEE     EEE HHHHHHHH  H     EEEEEEEE      HHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:                                      EEEEEE     EEE HHHHHHHHH HH     EEEEEEE       HHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_IUPRED2A:     D                     DD                                                                          
NP_BIND:                                                                                GAFRKGKS                   
MODRES_P:               S           SS                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDYNEPLTGFSWRGGSERETTGIQIWSEIFLINKPDGKKVAVLLMDTQGTFDSQSTLRDSATVFALSTMISSIQVYNLSQNVQEDDLQHLQLFTEYGRLA 200
PathogenicSAV:                  Q                                   E IW   P A               Y        R  R    C SQ 
BenignSAV:      E                                                                                          C       
gnomAD_SAV:     E S L A     S   *      M    L MD   S   S   T I            L                  P  I                  
Conservation:  8102377288388765656848544643552315134145554834566486345457565647667644583656556454555764355332375533
SS_PSIPRED:                          EEEE EEEEEE      EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                        E EEEE EEEEEE      EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                          EEEEEEEEEE       EEEEEE              HHHHHHHHHHHH   EE       HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                     DD                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                        RET                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEETFLKPFQSLIFLVRDWSFPYEFSYGADGGAKFLEKRLKVSGNQHEELQNVRKHIHSCFTNISCFLLPHPGLKVATNPNFDGKLKEIDDEFIKNLKIL 300
PathogenicSAV:                 Q                     #       P     I    R#                                         
gnomAD_SAV:           S  R    I*   Y       GN   R  V H  F    Q               S                LKV    #    Q  R    M
Conservation:  3432115554254755576545854075218600672544453015545453562653367214176878488537675505263514720694118007
SS_PSIPRED:    HHHH        EEEEE              HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH     EEE       HHH       HHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH        EEEEEEE             HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHH             HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH  HHHHEEEEEEE             HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH     EEE                     HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                       RD                                                         VATN                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IPWLLSPESLDIKEINGNKITCRGLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAVATAKDTYNKKMEEICGGDKPFLAPNDLQTKHLQLKEESVK 400
PathogenicSAV:                                                  T E  KK                              S          Y  
gnomAD_SAV:     #  F T#N      S I T  WD  Q   V VRF                        M ISE I        F  HT                 D   
Conservation:  5505804218259784733668449556886956877853895766884976687775756265417141551336943974571293026011110540
SS_PSIPRED:    HHHHH       EEE  EEEEHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH   H  EEEEE  EEE HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH       EEE   EEE HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                DD                                                     
MODRES_A:                                                                                                    K     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFRGVKKMGGEEFSRRYLQQLESEIDELYIQYIKHNDSKNIFHAARTPATLFVVIFITYVIAGVTGFIGLDIIASLCNMIMGLTLITLCTWAYIRYSGEY 500
PathogenicSAV:  L   E ##R  V #C                   K   T                                                      W     
gnomAD_SAV:      #RM         #CF RR  # T    L #     T    Y   PQV VS            N    VGS  G #         I       W A   
Conservation:  0613499998236513941584055132513618692588671557788486334324742644423474113513362245335335329464776844
STMI:                                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:    HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        
AA:            RELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYKLYSAAATHRHLYHQAFPTPKSESTEQSEKKKM 558
gnomAD_SAV:    G  E #T    SV  #  N    FH     #  Y   N  T     L PIQ       
Conservation:  3237138802632455511022110011000022222200222222220212222020
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHH    
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                  DDDDDDDDDDD