Q8WZA2  RPGF4_HUMAN

Gene name: RAPGEF4   Description: Rap guanine nucleotide exchange factor 4

Length: 1011    GTS: 1.5e-06   GTS percentile: 0.447     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 450      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVAAHAAHSSSSAEWIACLDKRPLERSSEDVDIIFTRLKEVKAFEKFHPNLLHQICLCGYYENLEKGITLFRQGDIGTNWYAVLAGSLDVKVSETSSHQD 100
gnomAD_SAV:                D   G        *   E # V PL   #         V   M S R         I  H SE#    C    E    Q   S  Y V
Conservation:  1111111111111111111111101211211111011211111111111111111110111111111111111110100112101121221111111111
SS_PSIPRED:      HHHH      HHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHHHHHHHHH EEEEE    EEEE      EEEEEEE EEEEEE        
SS_SPIDER3:      HHHH      HHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHHHHHHH E EEEEE   EEEE        EEEEEE EEEEEE        
SS_PSSPRED:    HHHHHHH     HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHE     EEEE      EEEEEEE EEEEEE        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD                                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                 AFEKFHPNLLHQICLCGYYENLEKGITLFRQGDIGTNWYAVLAGSLDVKVSETSSHQD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVTICTLGIGTAFGESILDNTPRHATIVTRESSELLRIEQKDFKALWEKYRQYMAGLLAPPYGVMETGSNNDRIPDKENTPLIEPHVPLRPANTITKVPS 200
gnomAD_SAV:      S       M    T   S  CQ  VI   R V  CVA  G  P   N Q CV EF    S IT M  #S MM NR#T   V T A  H        RT
Conservation:  1111111111111111112101201000211111111111111101111100011421030112011001211011242111112301012211115312
SS_PSIPRED:     EEEEE         HH        EEE     EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHH                                             
SS_SPIDER3:     EEEEE    HH          EEEEEE     EEEEEEHHHHHHHHHHHHHH          E                                    
SS_PSSPRED:      EEEE                  EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                           
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:                          D                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D D         
NP_BIND:       AVTICTLGIGTAFGESILDNTPRHATIVTRESSELLRIEQKDFKALWEKYRQYMAGLLAPPYGVME                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKILRAGKILRNAILSRAPHMIRDRKYHLKTYRQCCVGTELVDWMMQQTPCVHSRTQAVGMWQVLLEDGVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLP 300
gnomAD_SAV:     N I  E #SQ TV  Q  DVV N      AH R S E       KPE  RI  #P  # I#  V  V   SP G   N    C  CQ  GN QKHD   
Conservation:  3341355504101422116144666645632375834836788542112022227154474475654543516553301649745868812250111212
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHH    HHHHHHH           HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH  EE      EEEEE EEEEEE           
SS_SPIDER3:    HHHHHH HHHHHHHH     HHHHHH    E  E    HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    E      E EEE EEEEEE           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH       HHHHHHH        HHHHHHHHHHHH                 EE              
DO_DISOPRED3:                                                                                                DDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHMRMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQGEEGTSWYIILKG 400
BenignSAV:            R                                                                                            
gnomAD_SAV:    A QG EQR  V R SVQ  P     T I    # # S K    I VFC  V    V#CR   I  *   C FM    T    M        N   T    
Conservation:  0001103035652634349263654745333636151483055354536854553543486256453744453653403365764244533367775445
SS_PSIPRED:     HHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE        EEEE  
SS_SPIDER3:     HHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEE    E   EEEE E 
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHEE     EEE        EEEEE  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD                     D  D                                                                   
NP_BIND:                                                              ALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQGEEGTSWYIILKG

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRVDKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTV 500
gnomAD_SAV:           #       N R   D IT  H T QTT VI   NY      A  N SW   #M V       Y#E       I    G    EK *   N A 
Conservation:  5536444456453554686656566465435645565635324444455543553555666859589495233865554211110110121211215926
SS_PSIPRED:     EEEEE    EEEEEE                 EEEEE    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHEEEEEE  EEEEEEEEE                  EE
SS_SPIDER3:      EEEE    EEEEE       E          EEEEE    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH  EEEE  EEEEEEEEEE                   
SS_PSSPRED:     EEEEE    EEEEEE                 EEEEE    EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEEE                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_SPOTD:                                                                                         DDDDDDDDDDDDD    
DO_IUPRED2A:                                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDD
NP_BIND:       SVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRVDKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLV                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSGTPEKILEHFLETIRLEATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMDYALNNKRRVIRLVLQWAAMYGDLLQEDDVSMA 600
BenignSAV:                    V                                                                                    
gnomAD_SAV:           N       VS           A  Y   T#   VAS   YLV  TQ  THAT SA *   GCV SS  Q  C A    T#H    R   M V 
Conservation:  5393669597659635537211132141131474535147462246522821564323325353731273422655441541374232401731510300
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH   EE       HHHHHHH        HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHH H H          HHHHHH  EE      HHHHHHEHH        HHHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHH   HH   HHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH   EE     HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D                                                       DD   DDDDDDDD                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIVKQISEDAKAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVISAVA 700
BenignSAV:                                           V                                                             
gnomAD_SAV:     V    L LL G QT  #   K      T   T #Y  VSR T EF    LSM NKK E #   CS       AHWVAQS    Q    SL E  SN   
Conservation:  7452410042071221114463225443213002522110246132020353005511120144420844333653153313322436044625530443
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHH                    EEEEEE    EEEEEEE    HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H     HHHHHHHHHH    HH            EEEEEEE    EEEEEEE    HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH                     EEEEE     EEEEEE    HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                               
DO_SPOTD:                                         DDD                                                              
DO_IUPRED2A:                                                            DDD D                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DKLGSGEGLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHT 800
BenignSAV:          R                                                                                              
gnomAD_SAV:    NR   RK  N    N RRGT  FQA  I    MV   #H   SLQ  LN  SH   *K  S  A EAS  IR     H L TC C     MR    V  I
Conservation:  0112112423431246365311432231564346449566735112341051541583662144121452454875715470388389124553755645
SS_PSIPRED:    HHH      EEEEEE    EEEE      HHHHHHH        HHHH                 HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH      EEEEEE    EEEE HHH HHHHHHHH     E  HHHH                   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH      EEEEEE    EEE         EEEE         HHH                   EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                        D                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FGRHNFKKTTANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLM 900
gnomAD_SAV:      #   EQS#    VL          IIA     F P  LG     C  V  Q       S V G I    IIVL H   M       IE L V  K   
Conservation:  3623131244576673346774583983684778113136415768557372245545989496764676473763981399655627366352238436
SS_PSIPRED:    H           HHHHHHH HH HH HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                HHHHHHHH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQRTLS 1000
gnomAD_SAV:    Y L DL T      N  S     I      V L L   TA T         #IT  M      C     #S            LCCA# FIM#   KS  
Conservation:  5645585257433443157347446654543553346513023255553543343443223214442101332311253211210334331326344142
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHH          HHHH           HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH    HHHHHHHHHH      HHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHH         HHHHHHHHEHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH    HHHHHHHHH       HHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                         DDDDDDDDDDD     DD         DDD

                       10 
AA:            QMSHRLEPRRP 1011
gnomAD_SAV:     V  KF  HG 
Conservation:  23620442232
SS_PSIPRED:    HHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHH      
DO_DISOPRED3:           DB
DO_SPOTD:              DDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDD