Q92541  RTF1_HUMAN

Gene name: RTF1   Description: RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog

Length: 710    GTS: 3.501e-07   GTS percentile: 0.016     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 113      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRGRLCVGRAAAAAAAVAVPLAGGQEGSPGGGRRGSRGTTMVKKRKGRVVIDSDTEDSGSDENLDQELLSLAKRKRSDSEEKEPPVSQPAASSDSETSDS 100
gnomAD_SAV:                       S            W    E A                             Y             LLM   G          
Conservation:  7444444444444444444444444444444444440244432331312221321011010001017977999797454544416235756779979979
SS_PSIPRED:        EE   HHHHHHHHH                              EEEE           HHHHHHHH                             
SS_SPIDER3:       EEEE  HHHHH                                 EEE             HHHHHHHH                             
SS_PSSPRED:        EEE HHHHHHHHHHH                      EE      EE            HHHHHHHHH                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:            D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                          S T                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDEWTFGSNKNKKKGKARKIEKKGTMKKQANKTASSGSSDKDSSAESSAPEEGEVSDSDSNSSSSSSDSDSSSEDEEFHDGYGEDLMGDEEDRARLEQMT 200
gnomAD_SAV:              K     P  T     K    H       A E       DS     LV    N     E    L                D    H  R  
Conservation:  7699947439297947249159922177223747597793347945777967995974547554577554597977792979459797959775797999
SS_PSIPRED:                              HHHHHH                                                         HHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                                H                                                            HHHHHHH    
SS_PSSPRED:                       HHH     HHHH                                                          HHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKEREQELFNRIEKREVLKRRFEIKKKLKTAKKKEKKEKKKKQEEEQEKKKLTQIQESQVTSHNKERRSKRDEKLDKKSQAMEELKAEREKRKNRTAELL 300
gnomAD_SAV:            Y       L                              G R  I                 #                 *    S    F 
Conservation:  9999999979779577474496995779915957575474553575349742234472777997999945755745997999999799799777775775
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H  HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD                       DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD               DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKKQPLKTSEVYSDDEEEEEDDKSSEKSDRSSRTSSSDEEEEKEEIPPKSQPVSLPEELNRVRLSRHKLERWCHMPFFAKTVTGCFVRIGIGNHNSKPVY 400
gnomAD_SAV:                       K  IY     CL Q  L      R  M         SK    F  T     C  #        A     V  #    R   
Conservation:  7775997797799979977777599597545755594554774332357759959979977799994999799999993775599997777793449799
SS_PSIPRED:    HH                                    HHHHH            HHHHH  EE HHHHHHHH    HHHH    EEEEEE      EEE
SS_SPIDER3:    HH                                    HHHHH            HHHHH  EE HHHHHHHH    HHHH    EEEEE        EE
SS_PSSPRED:    HHH                                                    HHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHH  EEEEEE        EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RVAEITGVVETAKVYQLGGTRTNKGLQLRHGNDQRVFRLEFVSNQEFTESEFMKWKEAMFSAGMQLPTLDEINKKELSIKEALNYKFNDQDIEEIVKEKE 500
gnomAD_SAV:      TQVM AM   R                  S  H LC      R   A               H   VE    R                     N   
Conservation:  7777734977749797793579777957777352577997799775745377475545731749949979972797239959257999959995554495
SS_PSIPRED:    EEEEEEEEEE   EEE   EEEEEEEEEEE  EEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEEEEEE   EEEE  E EEEEEEEEE   EEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEEE  EE   EEE    E  EEEEEE      EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                      D DDDDDDD                                                                    DDD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RFRKAPPNYAMKKTQLLKEKAMAEDLGDQDKAKQIQDQLNELEERAEALDRQRTKNISAISYINQRNREWNIVESEKALVAESHNMKNQQMDPFTRRQCK 600
gnomAD_SAV:    K                         RYH   N# R   T                       K                   Y V              
Conservation:  5555994799799979575977975174455441773557575777757555577577757999999949977577777577557273499999979796
SS_PSIPRED:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH    
SS_SPIDER3:    H       HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  H            
SS_PSSPRED:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                   D   DDDD  DDDDDDD D
DO_SPOTD:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDD  DDDD   DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       D              DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTIVSNSRDPAVQAAILAQLNAKYGSGVLPDAPKEMSKGQGKDKDLNSKSASDLSEDLFKVHDFDVKIDLQVPSSESKALAITSKAPPAKDGAPRRSLNL 700
gnomAD_SAV:                   M           A S V   IT     G  S F                Y     H      ETSV#    L             
Conservation:  9779797977465776454774777474011220403112164391927242779777775777777779577475554755544433257457955949
SS_PSIPRED:     EEEE    HHHHHHHHHHHHHH          HHH                     HHHHHH   EEEEE                            H
SS_SPIDER3:       E     HHHHHHHHHHHHH                                HHHHHHH    EEEE E                            H
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHH                                   HHHHH    EEEE                             H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A:   DDDDDD                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                               S                       S    S                                         S   

                       10
AA:            EDYKKRRGLI 710
Conservation:  5755557753
SS_PSIPRED:    HHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDD    BB
DO_SPOTD:            DDDD
DO_IUPRED2A:   D