Q92560  BAP1_HUMAN

Gene name: BAP1   Description: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1

Length: 729    GTS: 1.191e-06   GTS percentile: 0.307     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 279      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNKGWLELESDPGLFTLLVEDFGVKGVQVEEIYDLQSKCQGPVYGFIFLFKWIEERRSRRKVSTLVDDTSVIDDDIVNNMFFAHQLIPNSCATHALLSVL 100
PathogenicSAV: T                                                                                           A       
gnomAD_SAV:    T      V     V S  L   V R               S    L       K C     FFAVLA M M        I L Y        A       
Conservation:  3010000211113684665569656766677779966664599999999979979779779757659799977777996999797977999999799777
SS_PSIPRED:         EE    HHHHHHHHHH     EEEEEEE   HHH    EEEEEEEE  HHHHHHH              HH      HHHH  HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEE    HHHHHHHHHH      EEEEEE   H      EEEEEEEE    HHH                     HHEHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:           E   HHHHHHHHHHH    EEEEEEE   HHH     EEEEEEE  HHHHHH                      HHHH   HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DB                                                          DDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                                                                                                C         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNCSSVDLGPTLSRMKDFTKGFSPESKGYAIGNAPELAKAHNSHARPEPRHLPEKQNGLSAVRTMEAFHFVSYVPITGRLFELDGLKVYPIDHGPWGEDE 200
gnomAD_SAV:      #N M       H N  SE   S          LA                          W            VI          #  L    CR   
Conservation:  7774574773567569577699699677777777779777679979979999997999776979999999999997667999999996797997666656
SS_PSIPRED:    H        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH          HH           EEEEEEEEE  EEEEE                H
SS_SPIDER3:    H        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH                       EEEEEEEEE  EEEEE   E   EE       H
SS_PSSPRED:    H        HHHHHHHHHH    HHHHHHHH   HHHHHHHHHH                      EEEEEEEEE   EEEEE                H
DO_DISOPRED3:                                                     DDDDDDDDDD                                       
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDDDDDDDDD                                     
DO_IUPRED2A:                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           
SITE:                                                                                             D                
ACT_SITE:                                                                          H                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EWTDKARRVIMERIGLATAGEPYHDIRFNLMAVVPDRRIKYEARLHVLKVNRQTVLEALQQLIRVTQPELIQTHKSQESQLPEESKSASNKSPLVLEANR 300
BenignSAV:                                                                                    K         S          
gnomAD_SAV:                 V    S  T              H   C V Q M    GK      R* V  I  G    P  K LK L    LG S  L       
Conservation:  7799776777767667666669767797697779777959994793499397967996997495469464364493442432642323225232114221
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H       HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                           D             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:    DD                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                 S        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APAASEGNHTDGAEEAAGSCAQAPSHSPPNKPKLVVKPPGSSLNGVHPNPTPIVQRLPAFLDNHNYAKSPMQEEEDLAAGVGRSRVPVRPPQQYSDDEDD 400
BenignSAV:                   A                                                                                     
gnomAD_SAV:     L#  K S R    AV         Y S K LR  A   S  #SE   D I TI Q L  Q      R    K  Y   R SHRQ Q HT  #    QN 
Conservation:  2212322223123221111012101234222242114332121562221436436579779766777799798498554534336242233224565654
SS_PSIPRED:    HHHHH     HHHHHHHHHH                                     HHH            HHHHHH                      
SS_SPIDER3:    HHHH      HHHHHHH                                        HHH         HHHHHHHHH                      
SS_PSSPRED:    HHH      HHHHHHHHHHH                                                    HHHHHH                      
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                                       NHNY                                  
MODRES_P:                                                                          S                         S     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YEDDEEDDVQNTNSALRYKGKGTGKPGALSGSADGQLSVLQPNTINVLAEKLKESQKDLSIPLSIKTSSGAGSPAVAVPTHSQPSPTPSNESTDTASEIG 500
BenignSAV:                           K                                                                             
gnomAD_SAV:    # GN #N M  N  T GC E RKR SVT RSF G   L  R IATDI T N R#      TL    S  RG GL A   #NL       S        V 
Conservation:  3556754221322321445562234221123222333446564363794657464577343794679355555334333346799997956667479979
SS_PSIPRED:                 HHHEEE                          HHHHHHHHH          EE                                  
SS_SPIDER3:                     E                            HHHHHHHH          E                                HH 
SS_PSSPRED:                  HHHH                              HHHHHH          EE                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                  T       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SAFNSPLRSPIRSANPTRPSSPVTSHISKVLFGEDDSLLRVDCIRYNRAVRDLGPVISTGLLHLAEDGVLSPLALTEGGKGSSPSIRPIQGSQGSSSPVE 600
PathogenicSAV:                                                                                                T    
BenignSAV:                                                                                                    G    
gnomAD_SAV:      LTL  C TMHP HLMWA    P Q A      GNG  HI Y #  #  C   T VI#S  Q   G A  H V I VE S  H   # L   A GNL  
Conservation:  9996777779477745979999754565665877663457694475776676973267333859256824254212122132212122121121111141
SS_PSIPRED:                               HH          EEEHHH               HHH     EEE                          HHH
SS_SPIDER3:                               HHH         EEEEEE    EH         HHEE     E                            HH
SS_PSSPRED:                                             EHHHH                       EE                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DD                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  D DDD DDDD     D        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                          S               S                                               S           S   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KEVVEATDSREKTGMVRPGEPLSGEKYSPKELLALLKCVEAEIANYEACLKEEVEKRKKFKIDDQRRTHNYDEFICTFISMLAQEGMLANLVEQNISVRR 700
BenignSAV:                 M  E                                                                                    
gnomAD_SAV:    EV M  M GGD ARV K  K  N     L        YM  D V # VY       K    T  R   Y  N  F    F   *  V             
Conservation:  3411511313331111321222186885985596794556555343544858759797656667777956666697697566678958653555645556
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       DDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   DDDD                                     

                       10        20        3
AA:            RQGVSIGRLHKQRKPDRRKRSRPYKAKRQ 729
gnomAD_SAV:          S         Q# C       L 
Conservation:  44645544654334655655666643332
SS_PSIPRED:         HHHH               HH   
SS_SPIDER3:                                 
SS_PSSPRED:                           HHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDBDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                         RRKRSR