Q92574  TSC1_HUMAN

Gene name: TSC1   Description: Hamartin

Length: 1164    GTS: 7.935e-07   GTS percentile: 0.137     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 16      BenignSAV: 83      gnomAD_SAV: 483      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQQANVGELLAMLDSPMLGVRDDVTAVFKENLNSDRGPMLVNTLVDYYLETSSQPALHILTTLQEPHDKHLLDRINEYVGKAATRLSILSLLGHVIRLQ 100
PathogenicSAV:                      W                   E                  R          P                            
BenignSAV:                          Q                     A      D    S  L                        T                
gnomAD_SAV:       *   R F  #  C  Q  Q        D    VH R F  A      #  C L  L           QF          #T C    L    AL   
Conservation:  8545233254533756518143334333534381456744564288646555371363267344596757386785864525223963363697646638
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:          HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD                                                                          
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                               D                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PSWKHKLSQAPLLPSLLKCLKMDTDVVVLTTGVLVLITMLPMIPQSGKQHLLDFFDIFGRLSSWCLKKPGHVAEVYLVHLHASVYALFHRLYGMYPCNFV 200
PathogenicSAV:                 P   N                                                          P         P#         
BenignSAV:                            A I   I                                             C    R        #          
gnomAD_SAV:        R  P  S  S V       S AI  IAAI  F NV     H   E  P L A   H   R    Q  #V AC I  #    T   C   T   S I
Conservation:  8694864462478268778983736544956769876456867773564452669479779447415437433233669965659776999997768675
SS_PSIPRED:      HHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH HHHHHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:       HHHH    HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SFLRSHYSMKENLETFEEVVKPMMEHVRIHPELVTGSKDHELDPRRWKRLETHDVVIECAKISLDPTEASYEDGYSVSHQISARFPHRSADVTTSPYADT 300
PathogenicSAV:    C                   R                                                                            
BenignSAV:        P                                        Q           N                   A       V               
gnomAD_SAV:       H   RV Q  G     I   LKR Q  L      E Q    Q         LLTK#GRM      D   #S PA YR   CVRYC  N I TS   #
Conservation:  6677569579975579566779975599599997797573977826873484897569967689973957586422242121131123112112122121
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HH HH HHHHHHHHHHHH   HHHH           HH     HHHHHHHHH                                       
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH     HHHH           H     H HHHHHHH                                        
SS_PSSPRED:    HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHE  HHH                    HHHHHHHH                                       
DO_DISOPRED3:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:               DDDDDDDDDD                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                     D        DD                                        D  DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QNSYGCATSTPYSTSRLMLLNMPGQLPQTLSSPSTRLITEPPQATLWSPSMVCGMTTPPTSPGNVPPDLSHPYSKVFGTTAGGKGTPLGTPATSPPPAPL 400
BenignSAV:           V              T           L #               I       #                                    L   
gnomAD_SAV:    H    YV   T FMTW     T# EP       L Q  S  S    R A VI       N S   LA   #    FCS   #    LPE T I   L LF
Conservation:  2222322222402213223211331221012212002233314422989521975699948842232333232341132314551552232313543112
SS_PSIPRED:                    EE                                                                                  
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D DDDD D        DDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CHSDDYVHISLPQATVTPPRKEERMDSARPCLHRQHHLLNDRGSEEPPGSKGSVTLSDLPGFLGDLASEEDSIEKDKEEAAISRELSEITTAEAEPVVPR 500
PathogenicSAV:                                                                                                    Q
BenignSAV:          CM           R                            S                                                L   
gnomAD_SAV:      L  CM  T#   A KH#     VY      Q     V   R  DLS   A    R   A  R        #       E     C     D   L   
Conservation:  3134531214112234232273331310200113312112232141001101332314421341132214232645223335224312341111321222
SS_PSIPRED:                                  HHH                    EEHHH   HHH        HHHHHHHHHHHHHHHH            
SS_SPIDER3:                         HHHH                              HHH    H         HHHHHHHHHH HHH              
SS_PSSPRED:                                 HHHHHH                         HHH             HHHHHHHHHH H            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                            S             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGFDSPFYRDSLPGSQRKTHSAASSSQGASVNPEPLHSSLDKLGPDTPKQAFTPIDLPCGSADESPAGDRECQTSLETSIFTPSPCKIPPPTRVGFGSGQ 600
BenignSAV:             QN      W     P TF  T              E     E                V         D         R   # G       
gnomAD_SAV:       Y    QN P  C Q   L P T R TTMY DLS       ELYI  ET        D G    V     KS       A TSRR S #M     GR 
Conservation:  2412345223123212011122121011110222120312332210013114575313020000111212101121011122235173433211033211
SS_PSIPRED:                                                                         HH                             
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:          S     S         S                                                                            S  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPPYDHLFEVALPKTAHHFVIRKTEELLKKAKGNTEEDGVPSTSPMEVLDRLIQQGADAHSKELNKLPLPSKSVDWTHFGGSPPSDEIRTLRDQLLLLHN 700
PathogenicSAV:                                                      E                                              
BenignSAV:       L  Q                                       V            V      R        N I  #                    
gnomAD_SAV:    L L VQ          D   L  I  V  Q  R   K D S A LV A     L   EV     KR L  GNY HRI# RS  S    HA QH       
Conservation:  2218616844689457146513662541231111122100121885449756623924382329464632543364332673332683327446739464
SS_PSIPRED:        HHHHHHH  HHH HHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHH   HHHHHH HHH HHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDD 
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDD    DD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLLYERFKRQQHALRNRRLLRKVIKAAALEEHNAAMKDQLKLQEKDIQMWKVSLQKEQARYNQLQEQRDTMVTKLHSQIRQLQHDREEFYNQSQELQTKL 800
PathogenicSAV:                          E                                                                          
BenignSAV:                                    Y                                      V                             
gnomAD_SAV:       C   #    G Q     #          R  #  G        T I  I     K  HD     H  V N F       RR     C R K   M  
Conservation:  8647995887988496979886553565658442658387257317412450771298162115425231141373174448532532223225376447
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:       DD   D   DDDD    D                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                     DD DD                     D DDDDDD      DDDD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDCRNMIAELRIELKKANNKVCHTELLLSQVSQKLSNSESVQQQMEFLNRQLLVLGEVNELYLEQLQNKHSDTTKEVEMMKAAYRKELEKNRSHVLQQTQ 900
BenignSAV:            VQ                   R                                                     T         R       
gnomAD_SAV:          TVQV#V       R     Q  R L         F E I        I     K          L#  # L T   TCQ K #R    IIL S 
Conservation:  2633223235534863764453445458475428635672355543566689667384553322343121111038215431411561422511233529
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                               D       DD   DD                        
DO_SPOTD:                                                                       DDDDDDD                            
DO_IUPRED2A:                                                                    D  D  DDDDDDDDDDDDD          DDDDD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLDTSQKRILELESHLAKKDHLLLEQKKYLEDVKLQARGQLQAAESRYEAQKRITQVFELEILDLYGRLEKDGLLKKLEEEKAEAAEAAEERLDCCNDGC 1000
BenignSAV:            Q                                                                    R    R                  
gnomAD_SAV:     FH    Q    D  P RQ      E           #V   STV S       N     GV  IC        Q R# D R      SKQ P YY  RW
Conservation:  3874543842788256458745535796578548145425637563751565244717627592765433020113311311011201103102000131
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                           DD                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                           DD   DD                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SDSMVGHNEEASGHNGETKTPRPSSARGSSGSRGGGGSSSSSSELSTPEKPPHQRAGPFSSRWETTMGEASASIPTTVGSLPSSKSFLGMKARELFRNKS 1100
BenignSAV:                           L  T        S  G   N  F I       M  T      M                               H   
gnomAD_SAV:    PV T RYK G T   DD E  TS  TW I R   SE GR RI  V I     # M S #  W  M    V V         R  EN  D# SQ   C   
Conservation:  1130110021101121210121012113213222231111122112222221138111442110120233322253457759353868544454566434
SS_PSIPRED:                                                                                        HHH  HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                                                                                           HHHHHHHH     
SS_PSSPRED:                                                                                              HHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                         S

                       10        20        30        40        50        60    
AA:            ESQCDEDGMTSSLSESLKTELGKDLGVEAKIPLNLDGPHPSPPTPDSVGQLHIMDYNETHHEHS 1164
BenignSAV:           NS          I                          Y                  
gnomAD_SAV:    D# Y  NS   RI  NP I  S   V  V  R     HPLCSA AHG              D G
Conservation:  4633421200021121221511131011101110100001110012223263788863333325
SS_PSIPRED:    HHH           HHH                                   EE          
SS_SPIDER3:                  H H                                   E           
SS_PSSPRED:                                                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD