Q92696  PGTA_HUMAN

Gene name: RABGGTA   Description: Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha

Length: 567    GTS: 2.62e-06   GTS percentile: 0.834     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 311      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYQSATQAVFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCL 100
gnomAD_SAV:    VQ#   GNMAG  V  #K  Q R V     S R L # S  RKP  #M     # M  TRN  #    ##    H K   CS    S  E          
Conservation:  5434443456335354453558489437333415471981151174548275233533887666498399446314312522361212312581834167
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD DDDDD D                                                                                    
MODRES_P:                                                                                                       S  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RVNPKSYGTWHHRCWLLGRLPEPNWTRELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVATQAAVPPAEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHPQPDSGPQ 200
gnomAD_SAV:    W           *     # S  Y  * R #R CS DM  Q    * F#Q #VP   MLA    VV A   #Q        Y C   S #    L     
Conservation:  3558868839476396414272534246818823493195988878659927520509321399266329744799977596464266725241210010
SS_PSIPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHEEHHHH          
SS_SPIDER3:    HH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH HH          
SS_PSSPRED:    HH     HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                                                                 DD   
DO_SPOTD:                                                                                                    DDDDD 
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GRLPEDVLLKELELVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALRCLHVSRDEACLTVSFSRPLLVGSRMEILLLMVDDSPLIVEWRTPDGRNRPSHVW 300
gnomAD_SAV:     H   N P# A   A        SV  V    C    Q  L VV H     #NK     C CQLF  C TV  F #IANA # F  * N   S Q     
Conservation:  2455722652976766797997747667757596796764424152854455412264628844616031112735347234405193532320324147
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHEEE     EEEEEE          EEEEEEE     EEEEE          EE
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH      HHEEEEEEE    EEEEEE  EEEE  EEEEEEEEE  EEEEEEEE      E   EE
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH    HHHHHHH       EEEEEE        HHHHHHHHH     EEEEE          EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LCDLPAASLNDQLPQHTFRVIWTAGDVQKECVLLKGRQEGWCRDSTTDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLY 400
gnomAD_SAV:    VG PL    #N  S R# HI   #DN     M   SCKDS  Q  M  K      V     AGP  G D Y # *  Q  S S  FSLV   WT NS   
Conservation:  4526631232310332241528122133456383372053524545442446525762454378644424425645588265675765457545459535
SS_PSIPRED:    EE              EEEEEEE     EEEEEE                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH HHHH
SS_SPIDER3:    HE              EEEEEEEE   EEEEEEEE   E E           H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    E              EEEEEEEE     HHHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKETLQYFQTLKAVDPMRATYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRTLPPALAALRCLEVLQASDNAIES 500
BenignSAV:                        A                                                                                
gnomAD_SAV:    #E  V    #  VMGALQTMH  EVSGR F A  M  R   KMC   M #  V  P R KR F  IR     SH * V #SMTV C   M   NND  V 
Conservation:  5342614514652465363374385466844572465886853434252031751545654543555437317171057124336466354554370421
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE          HHHHHHH  EEE         HHHHHHHH   EEE        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE    E EE  HHHHHE EEEE          HHHHH   EEEEE      EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE          HHHHHH HHH          HHHHHHHHH  EE         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60       
AA:            LDGVTNLPRLQELLLCNNRLQQPAVLQPLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGILEQLAELLPSVSSVLT 567
gnomAD_SAV:     GSI   LQ     VF  C KHSS  HL TFF   FV      LV  VM#    RG  Q  D NI#N
Conservation:  4263014526346171161501111412322331611417335532100110105103550500221
SS_PSIPRED:               EEE        HHHHH HH      EEE     HH    HHHHHHHH         
SS_SPIDER3:               EEE    E   HHHHHHH H   E EEE           HHHHHHHH     EEEE
SS_PSSPRED:               EE         HHHHHHHH      EEE           HHHHHHHH    EEE  
DO_DISOPRED3:                                                                     
DO_SPOTD:                                                                         
DO_IUPRED2A: