Q92834  RPGR_HUMAN

Gene name: RPGR   Description: X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator

Length: 1020    GTS: 5.069e-07   GTS percentile: 0.047     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 39      BenignSAV: 26      gnomAD_SAV: 318      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MREPEELMPDSGAVFTFGKSKFAENNPGKFWFKNDVPVHLSCGDEHSAVVTGNNKLYMFGSNNWGQLGLGSKSAISKPTCVKALKPEKVKLAACGRNHTL 100
PathogenicSAV:                                          W#        R       V    #  R                         R   QN 
BenignSAV:                                                                               VI                        
gnomAD_SAV:       L  Q  EL VM A           S       I              A                       V             L   S   S   
Conservation:  4110000022456465654436446184256573516104489469665483445654784834567843331221484355566264313459854856
SS_PSIPRED:        EEE      EEEE                    EEEEE   EEEEEE   EEEEEE                  EE HHH    EEEEEE   EEE
SS_SPIDER3:        EEEE     EEEE            E E    EEEEEE   EEEEEE   EEEEE               E E EE        EEEEEE    EE
SS_PSSPRED:          E      EEE                     EEEE    EEEEEE   EEEE                    EE        EEEEE    EEE
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDD D                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSTEGGNVYATGGNNEGQLGLGDTEERNTFHVISFFTSEHKIKQLSAGSNTSAALTEDGRLFMWGDNSEGQIGLKNVSNVCVPQQVTIGKPVSWISCGYY 200
PathogenicSAV:                           G  #                 R   L            D       R                        R  
BenignSAV:                                                            I                           H                
gnomAD_SAV:          S                IK      I      K E        D     # N                  IG     H                
Conservation:  4361141544382733665845502331482250382110144385443346876644819669968349865611211222823624633714679943
SS_PSIPRED:    EEE    EEEEE              EEE           EEEEEE     EEEEE    EEEEE              EEEEEE      EEEEE    
SS_SPIDER3:    EEE    EEEE                 EEEE        EEEEEEE    EEEEE    EEEE               EEEEEEE     E EEEE   
SS_PSSPRED:    EE     EEE                  EEEEEEE      EEEEE     EEEE     EE                     EEEE    EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                         D                                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:       DDDD   DDDDDDDDDDD                        DDD                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HSAFVTTDGELYVFGEPENGKLGLPNQLLGNHRTPQLVSEIPEKVIQVACGGEHTVVLTENAVYTFGLGQFGQLGLGTFLFETSEPKVIENIRDQTISYI 300
PathogenicSAV: L             V                   S              #D               # E     #         G               
BenignSAV:                                                                  G                                      
gnomAD_SAV:      G        CM   S     D SS    K          L      V           SG     Q R     R          R V S         
Conservation:  9976571382854899232956761014403342972802513282494998477456632145478395599995854255311841420311026114
SS_PSIPRED:    EEEEEE    EEEEE                    EE HH    EEEEEE   EEEEEE   EEEE                    EE       EEEEE
SS_SPIDER3:    EEEEEE    EEEE    H                EEE      EEEEEE    EEEEE   EEEE              H     EEE      EEEEE
SS_PSSPRED:    EEEEEE    EE                        E       EEEEE    EEEEEE    EE                     EEE       EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                           DD                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SCGENHTALITDIGLMYTFGDGRHGKLGLGLENFTNHFIPTLCSNFLRFIVKLVACGGCHMVVFAAPHRGVAKEIEFDEINDTCLSVATFLPYSSLTSGN 400
PathogenicSAV:  #     P   #       R                                                                                
BenignSAV:      S                                          D                I    A                                 
gnomAD_SAV:    AS      F     R     GS R     E   #      S   D              Q    V S CD T  V LA MSV    AGIL L  N A  S
Conservation:  1685464444420634667764747785342454333817446225224052243684264364613511001111123102102110011100201111
SS_PSIPRED:    EE   EEEEEE    EEEEE                    EE  HH   EEEEEE    EEEEEE                                  H
SS_SPIDER3:    EE    EEEEE    EEEE       E           E EE       EEEEEEE    EEEEE                                 HH
SS_PSSPRED:    E    EEEEEE    EEEE                     EEEHHH   EEEEEEE   EEEEEEE                                  
DO_DISOPRED3:                                                                                               DDDDD  
DO_SPOTD:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLQRTLSARMRRRERERSPDSFSMRRTLPPIEGTLGLSACFLPNSVFPRCSERNLQESVLSEQDLMQPEEPDYLLDEMTKEAEIDNSSTVESLGETTDIL 500
PathogenicSAV:                                    D                                                                
BenignSAV:                  Q          K     VD                       R          K                                 
gnomAD_SAV:    I     L H Q GQMKK Q    VK #VS VDEN  F      S    QR     RD    D GF#K   Q         D AV  P       D  G F
Conservation:  1302215552546253142211021223431101201300121131200120021111010100100101210011200100002202111033121313
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HHHH                                       HHH    HHH        HH     HHHH    HHH        HH
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HH H                                         H    HHHH         H H  HHH                  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH                                                                                           
DO_DISOPRED3:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                       S                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NMTHIMSLNSNEKSLKLSPVQKQKKQQTIGELTQDTALTENDDSDEYEEMSEMKEGKACKQHVSQGIFMTQPATTIEAFSDEEVGNDTGQVGPQADTDGE 600
BenignSAV:                                     M                                E   A   M                          
gnomAD_SAV:     VA  #G H S         E       V   M NI  I  NVG  F         E S   M RE  VA  VM V PC  A       R##S   I   
Conservation:  3323211033122110224313222221011012020022011000010100010110011001100001111110110101000000000212100000
SS_PSIPRED:    HHHHEE            HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH  HHHH                                        
SS_SPIDER3:      EEEE            HHHHHHHHH                  HHHH HHHHH  H                 HH                       
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHH                  HHH  HHH    HHH                                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                       S                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLQKEVYRHENNNGVDQLDAKEIEKESDGGHSQKESEAEEIDSEKETKLAEIAGMKDLREREKSTKKMSPFFGNLPDRGMNTESEENKDFVKKRESCKQD 700
gnomAD_SAV:     S  G #G  S  DIY F T  V    ER  T  D     T         G   V      K  A          LG      T        EK N   G
Conservation:  0000000000000000000000000000000000110002210012011121111011101020011000001101100100111111010010100101
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHH  HHHHHHHH                         HHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH       HH HHHHHHH       H HHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHH                    HHHHH H H        
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHH         HHHHHH                  HHHHHHHHH    HHHHHH                           HHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VIFDSERESVEKPDSYMEGASESQQGIADGFQQPEAIEFSSGEKEDDEVETDQNIRYGRKLIEQGNEKETKPIISKSMAKYDFKCDRLSEIPEEKEGAED 800
gnomAD_SAV:    G   R    AD    *V  SN   PA    V    SV    V   VN L   E VWC    T    K  I L    FI  *G   #HS    G    T V
Conservation:  0101121100020000010100001000110010111100000000000000000000020001101010101011001100010100121221121121
SS_PSIPRED:                         HHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH  HHHHHHHHHHHH           HH     
SS_SPIDER3:                                                    H H HHHHH HH  HH  H      HHHHHHH                    
SS_PSSPRED:                                                        HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKGNGIEEQEVEANEENVKVHGGRKEKTEILSDDLTDKAEDHEFSKTEELKLEDVDEEINAENVESKKKTVGDDESVPTGYHSKTEGAERTNDDSSAETI 900
gnomAD_SAV:     R I MG         I   R E    I    H   H   YD Y     V    M          N      H    S S  N   A    S    #   
Conservation:  1121111121131022121002213121212100002120111000210211120002001010221110022111000001000010000001211111
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHH      HHHHHHHH  HHHHHHHHH         HHHH HHHHHH HH                                HHH
SS_SPIDER3:           HHHHH  H          HHHHH             H     H H    HH  H                                   HHHH
SS_PSSPRED:                                           HHH                                                       HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKKEKANLEERAICEYNENPKGYMLDDADSSSLEILENSETTPSKDMKKTKKIFLFKRVPSINQKIVKNNNEPLPEIKSIGDQIILKSDNKDADQNHMSQ 1000
BenignSAV:                         E                                       L           T      #             N      
gnomAD_SAV:         T    QV#F      E HTH    R T G      A       T    S  N   LV    I  SSKTIL M  V E M  R   E  N   # R
Conservation:  1111000023010020102121000000012111001011111111011101000000000000100101121111001011111011110100110000
SS_PSIPRED:    HHHHHH HHHHHHH                  HHHH            HHHHHEEEE       HHH               EE                
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH                   HHHH                EEEE EE                  EE   EE E              
SS_PSSPRED:    HHHHH HHHHHHHHH                                  HHHHHHH                          EEEE              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20
AA:            NHQNIPPTNTERRSKSCTIL 1020
gnomAD_SAV:                K   S V 
Conservation:  00000000101021103122
SS_PSIPRED:                    EEE 
SS_SPIDER3:                        
SS_PSSPRED:                    EEE 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
PROPEP:                         TIL
LIPID:                         C