Q92878  RAD50_HUMAN

Gene name: RAD50   Description: DNA repair protein RAD50

Length: 1312    GTS: 1.686e-06   GTS percentile: 0.531     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 15      gnomAD_SAV: 593      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSRIEKMSILGVRSFGIEDKDKQIITFFSPLTILVGPNGAGKTTIIECLKYICTGDFPPGTKGNTFVHDPKVAQETDVRAQIRLQFRDVNGELIAVQRSM 100
PathogenicSAV: #                                                                                                   
BenignSAV:                                                                                                  L      
gnomAD_SAV:    I L K      L  L  G# EQ*     N#     E # SENMS N Y  C    VL S  N K C  N  FT   G    MH KCL ID   L     #
Conservation:  9249465664647559546644656363153454667676654776979774557679776692499766656567466799493727457404276654
SS_PSIPRED:       EEEEEEE EE         EEEEE   EEEEE      HHHHHHHHHHHHH                       EEEEEEEEEE     EEEEEEEE
SS_SPIDER3:      EEEEEEEEEE E       EEEEEE   EEEEE      HHHHHHHHHHHHH          EEE   HH   EEEEEEEEEEEE     EEEEEEEE
SS_PSSPRED:      EEEEEEE             EEEEE   EEEEE      HHHHHHHHHHHHH                        EEEEEEEEE     EEEEEEEE
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                  DDDDDD                               
NP_BIND:                                          GPNGAGKT                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VCTQKSKKTEFKTLEGVITRTKHGEKVSLSSKCAEIDREMISSLGVSKAVLNNVIFCHQEDSNWPLSEGKALKQKFDEIFSATRYIKALETLRQVRQTQG 200
BenignSAV:                               I                                                               I W       
gnomAD_SAV:     R  EC RA   A G  T * R    I  CPR VK GQKK GY #FA    Y IVCY   Y   #S    S   Q   V  E    NV  I WLGC  # 
Conservation:  2646535214676664474606473426453995746467635799745775497999997799995967279169949965766486544542682232
SS_PSIPRED:    EEEE     EEEEEEEEEEE     EEEEEEEHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE   E EEE EEEEEEE     EEE EHHHHHHHHHHHHH    HHHH H EE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEE    HHEHHHHEEEEEE    EEEEEHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QKVKEYQMELKYLKQYKEKACEIRDQITSKEAQLTSSKEIVKSYENELDPLKNRLKEIEHNLSKIMKLDNEIKALDSRKKQMEKDNSELEEKMEKVFQGT 300
BenignSAV:                            H                                                                            
gnomAD_SAV:       N  HIQ  C     K  RV GN*SA# #DH  FL Q  E C     L T H  *   DR E   V     # A *      NS  RKK  V I   A
Conservation:  0164276267469548876523653151167168259532711444373665226026505814533674646686875469637827943765558884
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H
DO_DISOPRED3:                                                                                             DD  D    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEQLNDLYHNHQRTVREKERKLVDCHRELEKLNKESRLLNQEKSELLVEQGRLQLQADRHQEHIRARDSLIQSLATQLELDGFERGPFSERQIKNFHKLV 400
BenignSAV:                   L                                                                                     
gnomAD_SAV:    N     V QS    L  #   WLH  H  ##    #S  H Q L RFI RV# RR  G    Y Q * A  *C S#ER     QC SLN    Q  L  E
Conservation:  5449332828994263596345262456455315643446235468946478772676352224119843544762284458744287423631492064
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                             DD  DDDDDDDDDDDDDD DDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDD  DDDDDD   D DDDD    DD      DDD             DDDD    DDD     DD                               DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RERQEGEAKTANQLMNDFAEKETLKQKQIDEIRDKKTGLGRIIELKSEILSKKQNELKNVKYELQQLEGSSDRILELDQELIKAERELSKAEKNSNVETL 500
BenignSAV:                S                                                        A                               
gnomAD_SAV:    #  R R     S#     T      R  LV   V   E       E *  T  *S #  M CD RP KA    F   G   K   H   Q       #  
Conservation:  1476425132213231441366127722585499485675445478143306840856354059439655638537761661533268126332454418
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:           DDDDD DDD                                     D  D   D  D                     DDDDDDDDDD D 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDD DD       DDD                             DDD                      D DD  DDDDD  DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KMEVISLQNEKADLDRTLRKLDQEMEQLNHHTTTRTQMEMLTKDKADKDEQIRKIKSRHSDELTSLLGYFPNKKQLEDWLHSKSKEINQTRDRLAKLNKE 600
gnomAD_SAV:        V  E K SV GG VL    QV H   YKA H L  I  R# T R GE   V CG##   # P     S Q      RN P  L RSG S   F   
Conservation:  5066019614822762166399368417815634575575635481456666443545836393264546958468686642413362327525214475
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:   DD             D  D          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD DD         D                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDD      DDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LASSEQNKNHINNELKRKEEQLSSYEDKLFDVCGSQDFESDLDRLKEEIEKSSKQRAMLAGATAVYSQFITQLTDENQSCCPVCQRVFQTEAELQEVISD 700
BenignSAV:                    E                                                                                A   
gnomAD_SAV:    # P DR  SRT D    R K  F *K E  NIY  HEL   V        T *  *   SA   I T  VI*  GK   Y  I  TA    T VE# V  
Conservation:  9663843556121565268354203834463898557752771582577662698696749887666997638564124998485808356277677746
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDD        D   DD D      D   D                                          DDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDD  D   D                                               
METAL:                                                                                         C  C                
MODRES_P:                                        S                                                      T          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQSKLRLAPDKLKSTESELKKKEKRRDEMLGLVPMRQSIIDLKEKEIPELRNKLQNVNRDIQRLKNDIEEQETLLGTIMPEEESAKVCLTDVTIMERFQM 800
gnomAD_SAV:      Y  #               R  WHE   R M LKE  V    N   Q    MR  S   RH R G   EKP  # M#   G V     #  VT   H 
Conservation:  7869969697897479179676947667753959383362342445583675655154663329514365744251223555336516745644666463
SS_PSIPRED:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D D                                                                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                  DDDDDD  DDDDD                        D        D         DDDDDD                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELKDVERKIAQQAAKLQGIDLDRTVQQVNQEKQEKQHKLDTVSSKIELNRKLIQDQQEQIQHLKSTTNELKSEKLQISTNLQRRQQLEEQTVELSTEVQS 900
BenignSAV:                                              A                                                          
gnomAD_SAV:     F  I    V       RM   G L*P  EG  G   *S IA N  D  H    VK  H  R   AAS*   K         CH   K    K TA    
Conservation:  6657276544533478354462563355447744264136543566655662393664468087503663446484634348534684463563465432
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH     H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDD        D                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                             DD DDDDDDDDDDDD                DD   DDDD   DDD DDD    D     DDDD          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYREIKDAKEQVSPLETTLEKFQQEKEELINKKNTSNKIAQDKLNDIKEKVKNIHGYMKDIENYIQDGKDDYKKQKETELNKVIAQLSECEKHKEKINED 1000
BenignSAV:                                                                    H        M        E                  
gnomAD_SAV:    F  GR   E   R   K     H   A   H      R V*    VT        #CV  T  C   E NN N           T        *A VH V
Conservation:  7055535546630781133244536633530350220222656432438638150042548239323462267447815721310461538426725345
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                              DDDDD  D                                          D                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:               DD DDDD   DD DDD DDDDDDDDDDDDDDDDD   D              DDDDDDDDD DDDDD   DDDD    D   DDDDDD
MODRES_A:                                                                K                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRLMRQDIDTQKIQERWLQDNLTLRKRNEELKEVEEERKQHLKEMGQMQVLQMKSEHQKLEENIDNIKRNHNLALGRQKGYEEEIIHFKKELREPQFRDA 1100
BenignSAV:                                          G                                                              
gnomAD_SAV:    #  V P # A R   SR * D I* Q   K         HR   RA  R         RM   TN   IS S    *   D  #V P   GV#    W  
Conservation:  4313679688795499585888788561558526112520215446274524732433022123423834432326683766556434446934337139
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:    D      D                                  DD  DDDDDDDD                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDD                     DDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDD DDDD    DDDDDD                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEKYREMMIVMRTTELVNKDLDIYYKTLDQAIMKFHSMKMEEINKIIRDLWRSTYRGQDIEYIEIRSDADENVSASDKRRNYNYRVVMLKGDTALDMRGR 1200
gnomAD_SAV:    GDQH DVVM  W #  L  H   *   F           I   S   H#  QN HH      T VQ A NV#   FA  #  S Q M         R* *
Conservation:  6636555794588988455996396678945765776579479975777996569777796967757647662472257737799977367753679777
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE                EEEEEEEE  EEEE    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE               EEEEEEEEE   EEE    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE               EEEEEEEE   EEEE    
DO_DISOPRED3:                                                                          D    D                      
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDDD                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CSAGQKVLASLIIRLALAETFCLNCGIIALDEPTTNLDRENIESLAHALVEIIKSRSQQRNFQLLVITHDEDFVELLGRSEYVEKFYRIKKNIDQCSEIV 1300
gnomAD_SAV:    R T  N  P    # G       S  VV    T  S  QQ T   VL       N#A  H  HF I   Y H MG SRHCK        T  VN*S    
Conservation:  7797776977976766766357536956767797667776764776467446654722756777679996779979657737542779637616779592
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE  HHHHHHH       EEEEEEE     EEEE
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE  HHHHHHH       EEEEEEE     EEEE
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE HHHHHHHHHH      EEEEEE     EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10  
AA:            KCSVSSLGFNVH 1312
gnomAD_SAV:    N #   V  TIR
Conservation:  545226524222
SS_PSIPRED:    EEEHHH      
SS_SPIDER3:    EEE         
SS_PSSPRED:    EEEE        
DO_DISOPRED3:    DDDDD  DDD
DO_SPOTD:              DDDD
DO_IUPRED2A: