Q92922  SMRC1_HUMAN

Gene name: SMARCC1   Description: SWI/SNF complex subunit SMARCC1

Length: 1105    GTS: 9.214e-07   GTS percentile: 0.190     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 440      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLGKHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPA 100
gnomAD_SAV:    V        Q A GAV   V TTE S   I  P Y    P    IA   T     P C    CR  I V T  S I    M L      E    YF  S 
Conservation:  2222222222222222222222222222222222222200000101001100120100001001222212353223532322346546632375232142
SS_PSIPRED:                        HHHHH               HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:                         HHHH      E     E  HH   HHHHHHHHHHHHHHHHH H H       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H
SS_PSSPRED:                           HHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_IUPRED2A:   DDD                                     DDDD                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FTKLPAKCFMDFKAGGALCHILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTFTDEKS 200
gnomAD_SAV:    V#R  TER TH  T  T  YV  P          W   V  R Q      V   V  A  RDS  SG   CV        TK F  TV QQE  VMG   
Conservation:  3333423343434365253445432464526555766868666825884655125454625453322624541424624523753277368585345751
SS_PSIPRED:         HHH        HHHHHHHHHHHHHHHH         HHH  HHHHHHHHHHHHHHH       EEEE     HHHHHHHHHHHHH   EEE  HH
SS_SPIDER3:    H H  HHE        HHHHHHHHHHHHHHH            H  HHHHHHHHHHHHHHH       EEEE     HHHHHHHHHHHHH   EEE  H 
SS_PSSPRED:        HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE     HHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI 300
gnomAD_SAV:    RS Y   R C  R# G    LL     H  AL       C      S     T     S     F GE    AGV S          G   TR#  #RQ 
Conservation:  1667353412131555584656553544444686136355525421365342466371235435744585475717999978999454624231229456
SS_PSIPRED:    H EEEEE           EEEEEE   EEEEEEEE HHH  EEEEHHH               EEEEEEEEEHHHHHHH  HHH                
SS_SPIDER3:      EEEEE          EEEEEEE   EEEEEEE        EE                  EEEEEEEEE H HHHHH                     
SS_PSSPRED:       EEE        HHHHHHHHH    EEEEEEE                            EEEEEEEEEE                            
DO_DISOPRED3:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DD          D                            D DDDD DDDDD                       DDDD DDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STKNEEPVRSPERRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPV 400
gnomAD_SAV:      N             RT   VQ    * L S#LI AV #R        #  ERCT      K   V  V    S ITSV  A              I  
Conservation:  1343662375453452411231788545542642242536692286623323164555465625763685477566473385412483252888474685
SS_PSIPRED:              HHH    HHH                                          HHH                                   
SS_SPIDER3:               HHH HHHH HH                                     HHHHH HH            HHH                  
SS_PSSPRED:               HHH                                                HHH                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:               S                 S S    T              S      S                                        T  
MODRES_A:                                                  KK       K    K                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGGTVADLDEQDEETVTAGGKEDEDPAKGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRL 500
gnomAD_SAV:         V#    N  I IG        G   R LT#  EKVI       V   N  L     Y R   WHS S   K R     L  C           H 
Conservation:  6853446365365533123357773227261161162377655997797659544767556334234546686665766666576557997976777776
SS_PSIPRED:                HHHH                                EE         HHH  HHHHHH HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             H  HH                                  EE         HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                            D                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFG 600
PathogenicSAV:                          P                                                                          
gnomAD_SAV:                   S          V  G#   I     L    V V  L A      S  #    S P Q    L D  IQ     IEG AAY #TL 
Conservation:  7766696665777674867663364534676797677977577792445787656635945383452743244232443544425343045531547556
SS_PSIPRED:           HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  EE    HHH             EEE                  HHHHH             HHH  
SS_SPIDER3:         EEHHHH       HHHHHHHHHHHHH   E EE    H             EEE                  HHHHH              H   
SS_PSSPRED:           HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH                         EE                  HHHHH                  
DO_DISOPRED3:                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                             DDDDDDDDDDDDD  DDD         DDD       DDDDDDDDD D   D      
MODRES_P:                                                                              S                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVA 700
gnomAD_SAV:    V        S V N           E      Q   I  N    A# R R C           F    S     V     W    #         T    
Conservation:  6624252542212242213262414455464646976556797797675767577697969979779977695225379996699799965669777699
SS_PSIPRED:       HHH  HHHHH           HHHHHHHHHHHHH    HHHHHH      HHHHHHHHH                          HH    HHHHHH
SS_SPIDER3:           HH               HHHHHHHHHHHHH    HHHE        H H HEEEEE                              HHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHH              HHHHHHHHHHHHHH   HHHHH        HHHHHHHH                                HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDD             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   DDD                          D                              D    DDD                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEKMEADPDGQQPEKAENKVENE 800
gnomAD_SAV:    Y      SCM      V  KG F# Q G          REA  GT*T  E   ACSV  R  G    A       D       NS    L   K# G  V
Conservation:  9977776695543555464489654486683666563427325221033317437666465558533723752221113234222313111222122225
SS_PSIPRED:    HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HH  HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHH         HHHH   HHHHHH        HHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHH  HHHH          HHHHHH     
DO_DISOPRED3:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   DD   D          DDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKELTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLV 900
gnomAD_SAV:    MG V  G GRGD      KR           # # K    RA  REDS N A  EE  Y   K H    T       V       S              
Conservation:  2130121101101201423122500110211402243114012002123021134216264264544477755545344457544575454343454764
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHH  HHHHH HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H HHHHHH H HHH  HHHH  H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                   HHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            
MODRES_P:                           S  S                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYP 1000
gnomAD_SAV:               #         E     PD   HE    # K      R# Q QT #    H    KR            V R  TE   I  YK T SCR
Conservation:  5654464653657666757776774557735664564794479399755664533543525242322221222222221122213021212211122212
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      H                                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                         
DO_DISOPRED3:                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_A:                                                     K                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQQPPPPPPADGVPPPPAPGPP 1100
BenignSAV:                                                                               H                         
gnomAD_SAV:     R  R LLSN S         TV RR N A CI T       L E DS  SSV      F   QAH   HDST HS S   SLSA #T AG L S SDL 
Conservation:  1200222112322211022222113121112111211122222222222132123122222233212223331112222222224121111002220121
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:                                                                     R                                    

                    
AA:            ASAAP 1105
gnomAD_SAV:    # TVS
Conservation:  10122
SS_PSIPRED:         
SS_SPIDER3:         
SS_PSSPRED:         
DO_DISOPRED3:  DDDDD
DO_SPOTD:      DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDD