Q92973  TNPO1_HUMAN

Gene name: TNPO1   Description: Transportin-1

Length: 898    GTS: 8.722e-07   GTS percentile: 0.169     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 216      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIK 100
gnomAD_SAV:     MC L A#    CN                R    P  G#     K  S                     T      F  TY  Q    I   D    MR
Conservation:  3333333300330002100112110110010020000010001797776479777566485564644476445574766777999676367722653755
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:                           D           DDDD DD                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRS 200
gnomAD_SAV:    N        FC            AV FQE         TN YG    Q C I   S             V       C  S      I     N   M  
Conservation:  2567245663534444437797774535657527667693781453736454455666696677979675979739569964677766665563464364
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH  HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHH  HHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH  H HHHH HHHHHHHHHHH     HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV 300
gnomAD_SAV:         I           T Y  C S  I           Q    Q V I            VYYV          RE S T  S    PSS  RR    I
Conservation:  4453555554346446773467366547967629674995997955668955853655453544544688485663766647777766756665455333
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH  H  HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDEDGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRD 400
gnomAD_SAV:     IS  S  V    #      V   V  DE  D# M        # C Y#LTMM   D  G    DH     T     V E          V       C 
Conservation:  4123513635254358566434555369957697579977779485896967665363221233224543336594335665557776799979799656
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH                    HH HHHH                            HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHH                    HHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH                   HHHHHHHH                             HHHHHHHHHHHHHHHH H
DO_DISOPRED3:                           DDDDDDDDDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                      
DO_SPOTD:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       
DO_IUPRED2A:                                     DDDDDDDDD   DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDS 500
gnomAD_SAV:       QR  AV                      V    L S  A FA       R      S AC  A   F    #   G L  M           C   G
Conservation:  6793669669947996259569999997997657976967436967947794359444777957677979999776775776714977974699486654
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHH HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HH  H HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH      EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
SITE:                                                                             W                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS 600
gnomAD_SAV:      G         G      Y        CV               V      V    E   R           I    R   V        L        
Conservation:  5445335447466766767967799796679979979969979999797977577777799799553555466579774797497979777766469799
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLG 700
gnomAD_SAV:          C                 RNA V    HS R      A         G            V     Q D             R  Q C      
Conservation:  7996997996779577765864556646464455235853563777799999979999989998336738753667646365667626975455554446
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  H       HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQ 800
gnomAD_SAV:     F        EH    L  V      TV           V     P# MG R   AV F   L   T  S          V V H   I   AM L    
Conservation:  6455675255426433656479365665556776747664664436581234443245613766977564464564455455778753558654443542
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH  HH HHH HHHHHHHH    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
SITE:                                               W                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV 898
gnomAD_SAV:       L      SV  #       #      CM    I    M     I                        A N            A  G  TV    
Conservation:  63344524454545546685555535256235645525879686545345324324543343432233523231342124232261033333122143
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                        
DO_IUPRED2A: