Q969P6  TOP1M_HUMAN

Gene name: TOP1MT   Description: DNA topoisomerase I, mitochondrial

Length: 601    GTS: 3.49e-06   GTS percentile: 0.954     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 406      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRVVRLLRLRAALTLLGEVPRRPASRGVPGSRRTQKGSGARWEKEKHEDGVKWRQLEHKGPYFAPPYEPLPDGVRFFYEGRPVRLSVAAEEVATFYGRML 100
gnomAD_SAV:    # L   PW#QVTMR     #CH   WR L L  M*  RRT C  K* K R  *   D#NDR  STS#K FSNRAL SC   H    M V KIT    TLV
Conservation:  2101022222100200101010011102210011213012354532112336824777378253426454521515362732327421488554676655
STMI:          TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT                                                  
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHH                                       EEEEEE                EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:          HH H                                        E  EEEEE E E            EEEE  EEE   HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHH                                     EEEEE                 EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  BBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    D    D                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DHEYTTKEVFRKNFFNDWRKEMAVEEREVIKSLDKCDFTEIHRYFVDKAAARKVLSREEKQKLKEEAEKLQQEFGYCILDGHQEKIGNFKIEPPGLFRGR 200
gnomAD_SAV:    N  H   * LQ K   # Q  TTG#K V FMN      MD Q     RPT G     KK    E V GE H#  #CYTVAC # N# I #TAL  F C C
Conservation:  3565656248528861873467513751272271585922432462232445724454454236253335224785725836486767663987565485
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHH           HHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEE  EEEEE  EE          
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHH       E   HH    HHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE  EEEEEE EE      E   
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEE  EEE                
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                 D                                 D   
SITE:                                                             R                                               R

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDHPKMGMLKRRITPEDVVINCSRDSKIPEPPAGHQWKEVRSDNTVTWLAAWTESVQNSIKYIMLNPCSKLKGETAWQKFETARRLRGFVDEIRSQYRAD 300
BenignSAV:                                                            I                                            
gnomAD_SAV:    SN   V K     M  H#  HSGS    AK#LV  H*  LH G  IM    S #NI  P ECTV KT LR  W      S   *# WV   K H  FQV 
Conservation:  8468657368375254555788445522917816339746546369789759386663229864986586577768749884963952262187138215
SS_PSIPRED:                  HHHEEEE                 EEEE    EEEEEEE      EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     E       EEE  HHH EEE                EEEEE    EEEEEEEE    EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                     EEEE                 EEEE    EEEEEEE       EEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:   BDBDBD                                                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    D    DDD              DDD    DDDDDDDDD                                                             
REGION:                                                                    KY                                      
SITE:                                                         W                              K                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WKSREMKTRQRAVALYFIDKLALRAGNEKEDGEAADTVGCCSLRVEHVQLHPEADGCQHVVEFDFLGKDCIRYYNRVPVEKPVYKNLQLFMENKDPRDDL 400
gnomAD_SAV:    # CQ V P  QVMT  V NE    T S E#VC  VH L  RPFC DQI* YL  H  * # K VL   EYVHC D  LL  LL*EK     # E TQ V 
Conservation:  4563443259369656697674856766675753898878997558843761124422359778969985656382549333754553263348231638
SS_PSIPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHHHH  EE             EEE EEEEEEEEE        EEEEEEEE     EEEEEEE  HHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE        H   EEEEEEEEEEEE         EEEEEEE    EEEEEEEEE  HHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEEEEEEEEEEE        EEEEEEE     EEEEEEEE  HHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                 D    
DO_SPOTD:                                 DDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:                               D                                                                       
REGION:                               RAGNEK                                                                       
SITE:                                              T                              K                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FDRLTTTSLNKHLQELMDGLTAKVFRTYNASITLQEQLRALTRAEDSIAAKILSYNRANRVVAILCNHQRATPSTFEKSMQNLQTKIQAKKEQVAEARAE 500
gnomAD_SAV:     #  AR   S YF*   GR MVR  WA STF AP* * W RKCTK  V VT S  KPVS* M L  SY *GISNMLQ LT* # M  #  T   VK # G
Conservation:  8637352158649414627877778686968356626722661123423355647658655544577987536545446522541553153264125313
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHH    HHHHHHHH HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HEE HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                  DDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                                                                        DDDDDDDDD   DD         DDD
REGION:                            TAK                                                                             
SITE:                   N                                                         H                 K              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRRARAEHKAQGDGKSRSVLEKKRRLLEKLQEQLAQLSVQATDKEENKQVALGTSKLNYLDPRISIAWCKRFRVPVEKIYSKTQRERFAWALAMAGEDFE 600
BenignSAV:                             W                                                                           
gnomAD_SAV:     K VS  R  H     G I G   W  D  H * V     GMEE KK H V  #CN    E  F#MTCYRPL  A   M     Q   T V T E  G Q
Conservation:  6326212120122121221342433243533646135134554445554467656454466755545654422643434424435455362222221231
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH    HHH   HHHHHH HHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHH H      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH  H            HEEHHEEHH    HHH   HHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDD                              DDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDD   D             
DO_SPOTD:            DDDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD                             D D                                                    
ACT_SITE:                                                                Y                                         

                
AA:            F 601
Conservation:  4
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:     
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:   
DO_SPOTD:       
DO_IUPRED2A: