Q96AA3  RFT1_HUMAN

Gene name: RFT1   Description: Protein RFT1 homolog

Length: 541    GTS: 2.358e-06   GTS percentile: 0.769     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 10      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 250      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGSQEVLGHAARLASSGLLLQVLFRLITFVLNAFILRFLSKEIVGVVNVRLTLLYSTTLFLAREAFRRACLSGGTQRDWSQTLNLLWLTVPLGVFWSLFL 100
PathogenicSAV:                                                                   #                                 
BenignSAV:                                                                                             I           
gnomAD_SAV:     D R L C#  G TFF  F  #  LVM    S LT H      I II I  M  F  #R P  Q  H  R   D  *         G I R AM      
Conservation:  4021113001202121213133224123325443255245432453343574954573287666568686842211349233358465438682393237
STMI:                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GWIWLQLLEVPDPNVVPHYATGVVLFGLSAVVELLGEPFWVLAQAHMFVKLKVIAESLSVILKSVLTAFLVLWLPHWGLYIFSLAQLFYTTVLVLCYVIY 200
PathogenicSAV:                                                    E                                                
BenignSAV:                                                                     I                   T               
gnomAD_SAV:            Q  AL#  L C  RL P DV#       KT    T  RK    E  G   L V   I  V FM C  QRE HV   TH   SII    C  F
Conservation:  4259424843953135749126922954666398649868668844666359734562433166236525731141585468524653653284378327
STMI:          MMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FTKLLGSPESTKLQTLPVSRITDLLPNITRNGAFINWKEAKLTWSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGVYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESF 300
PathogenicSAV:                                                           S                                    # K  
BenignSAV:               I                                                              G                          
gnomAD_SAV:          CA *I    F  AKV   I   S   V   *     I # L      #S    K#CGK  F      G    NT  S           LT #N 
Conservation:  8215628144152117851342347911002223573235277667667977565996799959996767597799589476888864685584868869
STMI:          MMMMMMM                                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHH       HH      HHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEHH    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH                HHHH         E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE    H HHHHHHHHH HHHHHHHH HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YIFFAKVLERGKDATLQKQEDVAVAAAVLESLLKLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGTMLSSGSGPVLLRSYCLYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEE 400
PathogenicSAV: C                                                                                                   
BenignSAV:                                                                             H                           
gnomAD_SAV:     V   N          * # NIG TTT     FRR Q  S   I     C  V  H  RR     R S  # C    CIF  VN  G  Y    TTG   
Conservation:  9679545549631211663543435718982977674649535359835773979649982499193671976397299676949977797379495545
STMI:                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH     HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  HH     HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDRYNFVMLALSSSFLVLSYLLTRWCGSVGFILANCFNMGIRITQSLCFIHRYYRRSPHRPLAGLHLSPVLLGTFALSGGVTAVSEVFLCCEQGWPARLA 500
PathogenicSAV:        V                                 Q                                                          
BenignSAV:                                                                       R                                 
gnomAD_SAV:     E  S L   P        H   S*  NA  #      VV W M    SVYCC #   Y L V  RRL I  R    #   AS LQE   Y RV S   P
Conservation:  5677732685691288226626613184489736694665487267305711652041328806814531532351344236217511585306511351
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                 DDDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40 
AA:            HIAVGAFCLGATLGTAFLTETKLIHFLRTQLGVPRRTDKMT 541
gnomAD_SAV:     T M   S R   R SL IDAR F  F S   A KC    I
Conservation:  75128226511331224246344416422442132102401
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                     DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                        DD