Q96AX1  VP33A_HUMAN

Gene name: VPS33A   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 33A

Length: 596    GTS: 1.216e-06   GTS percentile: 0.318     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 266      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAHLSYGRVNLNVLREAVRRELREFLDKCAGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGNRLPAADVKNIIFFVRPRLELMDIIAENVLSE 100
BenignSAV:                                                                                                L        
gnomAD_SAV:      VY  C#PM   MWC        #     S   VV     II             *R    I A  RSGM#      LVL    # K VVLMT  M G 
Conservation:  2222222222221143222112311122222222243243243253323310212133423533232202310301132434344421221044122124
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE            EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE HH HHHHHHHH HHHHHH  EEEEEE            EEEEEE   HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE  HHH HHHHHHHHHHHHHH HHHHHE            EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRRGPTRDFHILFVPRRSLLCEQRLKDLGVLGSFIHREEYSLDLIPFDGDLLSMESEGAFKECYLEGDQTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECAR 200
gnomAD_SAV:      #  R   RVR L C#    KRQ   P    F     # N   TL #  V  L  DV S  Y      M PCLTSTV    *    MM#H      YSQ
Conservation:  3503106244568386643398248763845353230567253468353865968472464624635544431224245233235465311138462336
SS_PSIPRED:    HH      EEEEE     HHHHHHHHH        EEEEEE  EEEE   EEE      HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE HHHH
SS_SPIDER3:            EEEEE     HHHHHHHHH       EEEEEEEEEEEE E  EEEE    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE HHHH
SS_PSSPRED:           EEEEEE     HHHHHHHHHH       EEEEEE  EEE     EE    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE  HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QVANMMIRMKREFTGSQNSIFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDGGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIR 300
BenignSAV:                                                            L                                            
gnomAD_SAV:      V L     K  I     V  I  D     #   I SH     SC      MF L       L  R  S  RDND#    SK  R #P  S A#C   #
Conservation:  3312242231321212011225234134447964743646567567799577474626527463556532567562456754632655885254442466
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH             EEEEEE      HH   HHHHHHHHHHHH     EEE  HHH                 EEEE     HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH            EEEEEE           HHHHHHHHHHH      EEE  HHH                 EEEE     HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH            EEEEE      HHH    HHHHHHHHHHH     EEE  HHH              HHHHHE    HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                     DDDDDDDDDDDDDD                   
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDDDDD                     
DO_IUPRED2A:                                                                     DDD DDDDDDDDDDDDDD                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DKNFNAVGSVLSKKAKIISAAFEERHNAKTVGEIKQFVSQLPHMQAARGSLANHTSIAELIKDVTTSEDFFDKLTVEQEFMSGIDTDKVNNYIEDCIAQK 400
BenignSAV:                                                             V                                           
gnomAD_SAV:         TA       GN   TTL#      IM  V     R         #   R  V     E S   #V     M     CE  #G I S T N TT T
Conservation:  5456428433564445155246577636755366728763666563541483346766946653535537772642672444852334331325434245
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HSLIKVLRLVCLQSVCNSGLKQKVLDYYKREILQTYGYEHILTLHNLEKAGLLKPQTGGRNNYPTIRKTLRLWMDDVNEQNPTDISYVYSGYAPLSVRLA 500
PathogenicSAV:                                                                                                  W  
BenignSAV:                                            Y                                                            
gnomAD_SAV:     L         P  M  TR  E      E G I   SC YL I NSM   S   LPMAS SHH AVW   CF V  I  H  M      G  S F LW  
Conservation:  2322446643555745646413623425413345444124347413532165433712232213234344564353334315154343334536453533
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHH             HHH     HHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH                     HHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH               EE     HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                         D                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLLSRPGWRSIEEVLRILPGPHFEERQPLPTGLQKKRQPGENRVTLIFFLGGVTFAEIAALRFLSQLEDGGTEYVIATTKLMNGTSWIEALMEKPF 596
gnomAD_SAV:        Q D Q MK F CLFQ L   KW   L    R CHL   Q   L  P  I  T        F#  N  I  #T             G    T 
Conservation:  324142572665653646332451133210112111011212432433554534441142222443232153312123331132123211213010
SS_PSIPRED:    HHHH      HHHHHHH                          EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHH       HHHHHH                          EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHH     EEEEEEE      HHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHH      HHHHHHH                          EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:                                DDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_IUPRED2A:                              DDDDDDDDDD