Q96BI3  APH1A_HUMAN

Gene name: APH1A   Description: Gamma-secretase subunit APH-1A

Length: 265    GTS: 7.739e-07   GTS percentile: 0.129     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 87      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGAAVFFGCTFVAFGPAFALFLITVAGDPLRVIILVAGAFFWLVSLLLASVVWFILVHVTDRSDARLQYGLLIFGAAVSVLLQEVFRFAYYKLLKKADEG 100
gnomAD_SAV:      T       S       V  F  #SA      #     V    CVF   M    F PA NQ Y W   SI      L      LL  VC       E W
Conservation:  0011100121111012121010021100121111011226455354434324733221232014112421461282226524582456354434534128
STMI:            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD D  DD                                                                                        
DO_SPOTD:       D                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LASLSEDGRSPISIRQMAYVSGLSFGIISGVFSVINILADALGPGVVGIHGDSPYYFLTSAFLTAAIILLHTFWGVVFFDACERRRYWALGLVVGSHLLT 200
gnomAD_SAV:     TL    RT     HR  C       V      LT           G       C L                R          KW         N   I
Conservation:  4224522311336234434535365834692862364634535753455254632454244441223223613332336322312220011233213323
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH         HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60     
AA:            SGLTFLNPWYEASLLPIYAVTVSMGLWAFITAGGSLRSIQRSLLCRRQEDSRVMVYSALRIPPED 265
gnomAD_SAV:    L#  L       #  S      AV F   V  R  IQ VPHN  W Q    WM       V  KG
Conservation:  42234034021133222212221252533114622022311231222011111111111111110
STMI:          MMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                               
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HH HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH        EEEEEHH      
SS_SPIDER3:    HHHH      H  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH EE       EEEEEEEE     
SS_PSSPRED:    HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       EEEEEEE      
DO_DISOPRED3:                                                                DDD
DO_SPOTD:                                                                    DDD
DO_IUPRED2A: