Q96JC1  VPS39_HUMAN

Gene name: VPS39   Description: Vam6/Vps39-like protein

Length: 886    GTS: 1.479e-06   GTS percentile: 0.438     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 325      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MHDAFEPVPILEKLPLQIDCLAAWEEWLLVGTKQGHLLLYRIRKDVVPADVASPESGSCNRFEVTLEKSNKNFSKKIQQIHVVSQFKILVSLLENNIYVH 100
gnomAD_SAV:    V      L         M       K                WMGIM  GIV L  SIY          S          RE  H            CI 
Conservation:  2111120101221022101000105736457643643766455441333333333313363779376774646676774737957777977995777499
SS_PSIPRED:         EEEE HH     EEEEEEE  EEEEEE   EEEEEEE                    EEEEEE          EEEE     EEEEEE  EEEEE
SS_SPIDER3:           EEHH      EEEEEEE  EEEEEE   EEEEEEE                    EEEEEE        EEEEEEE    EEEEEE  EEEEE
SS_PSSPRED:             HHH    EHHHHHHHH EEEEEE   EEEEEEE                     EEEEE        EEEEEEE    EEEEEE   EEEE
DO_DISOPRED3:                                                DDDDDDDDDDDDDDDD                                      
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDD                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLLTFQQITTVSKAKGASLFTCDLQHTETGEEVLRMCVAVKKKLQLYFWKDREFHELQGDFSVPDVPKSMAWCENSICVGFKRDYYLIRVDGKGSIKELF 200
gnomAD_SAV:      *  #   M * G  T   S      Q #  A W   E      VC          # E      LR T# YD  V      N     G  R F     
Conservation:  9999997772539977777539475110246209447775555547579597496757575377759577799447799999999977544736329666
SS_PSIPRED:    E               EEEEEE          EEEEEEEE  EEEEEEEE   EEEEE EEE     EEEEE   EEEEEE   EEEEE      EEE  
SS_SPIDER3:    E H              EEEEEEEEE     EEEEEEEEE  EEEEEEEE  E EEEEEEEE      EEEEE  EEEEEE  EEEEEEE     EEE  
SS_PSSPRED:    E                EEEEE          EEEEEEEE  EEEEEEEE    HHH          EEEEEE  EEEEEE   EEEEEE      EE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTGKQLEPLVAPLADGKVAVGQDDLTVVLNEEGICTQKCALNWTDIPVAMEHQPPYIIAVLPRYVEIRTFEPRLLVQSIELQRPRFITSGGSNIIYVASN 300
gnomAD_SAV:    L      S LV V      M     A   S K F  *R     M  A# #   S   V A  * #Q * L L      T S   #LV LEE KMVCMV  
Conservation:  9799999997577364966979777767966592697443647666723634447944547776575572597474533954555744557257497777
SS_PSIPRED:            EEEE    EEEEE    EEEE                   EEEE   EEEEE   EEEEE     EEEEEEE    EEEE     EEEEE  
SS_SPIDER3:            EEEE    EEEE    EEEEE     EE EE        EEEEE   EEEEE   EEEEEE    EEEEEEE    EEEE     EEEEE  
SS_PSSPRED:            EEEE    EEEEE      EE                   EEEE   EEEEE   EEEEE      EEEEEE              EEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HFVWRLIPVPMATQIQQLLQDKQFELALQLAEMKDDSDSEKQQQIHHIKNLYAFNLFCQKRFDESMQVFAKLGTDPTHVMGLYPDLLPTDYRKQLQYPNP 400
gnomAD_SAV:       R PV   #TPL           W  * T   N   R  *   N        YV   N     V        H            SIE  R      A
Conservation:  7577794755552773597354777797975277753735724554474594575959997955756473555575799797997997375469445954
SS_PSIPRED:     EEEEEE   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHH HHH    HHH       
SS_SPIDER3:      EEEEE   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH    HHHHHH  HHH              
SS_PSSPRED:     EEEEEE   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH   HHHHHHH HH     HHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                       D DDD                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPVLSGAELEKAHLALIDYLTQKRSQLVKKLNDSDHQSSTSPLMEGTPTIKSKKKLLQIIDTTLLKCYLHTNVALVAPLLRLENNHCHIEESEHVLKKAH 500
gnomAD_SAV:         # #S       F C    *   A   D    R  I LF    R    NR M           #F   M       C        K    M   TY
Conservation:  4717933979775799979975793575749654353635676459573656335545754747736654442575555779779799777793779755
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH    EE HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH        HHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                       DDDDDDDDDDDDD                                                      
DO_IUPRED2A:                                DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KYSELIILYEKKGLHEKALQVLVDQSKKANSPLKGHERTVQYLQHLGTENLHLIFSYSVWVLRDFPEDGLKIFTEDLPEVESLPRDRVLGFLIENFKGLA 600
gnomAD_SAV:                   K G  LF#        A     K  #  R   I    #  FC   L    S     ML   PL      CYQ  R      N VS
Conservation:  7455757777779573979599779757799597757577579755716661478556198971366999877999949772699236719914462295
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH HHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH      H   HHHHHHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IPYLEHIIHVWEETGSRFHNCLIQLYCEKVQGLMKEYLLSFPAGKTPVPAGEEEGELGEYRQKLLMFLEISSYYDPGRLICDFPFDGLLEERALLLGRMG 700
gnomAD_SAV:    LSF   TFD  K   FW  T V   C QNMHD   K  M   S  ##  DVKG SQ    Q    I     R CV  L      VED S  Q     CL 
Conservation:  6779775621646013067747646643479069626602241411345681906367339168706861811636128635666989799997979799
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHH       HHHHHH       HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHH       HHHHHH       EEHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH      HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                           DDDDDDDDD DDD                                              
DO_SPOTD:                                                        DD                                                
DO_IUPRED2A:                                                      DD                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KHEQALFIYVHILKDTRMAEEYCHKHYDRNKDGNKDVYLSLLRMYLSPPSIHCLGPIKLELLEPKANLQAALQVLELHHSKLDTTKALNLLPANTQINDI 800
gnomAD_SAV:     RKE      NF   RSI    SYTRC *KE   R  H    W   L# G   P LV    # S  T   #      Q #  G           A TSN 
Conservation:  5997995799777255157718943684101533499999979779779426477964444138338516671683755467565654477965637279
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH             HHH    HHHHHHHHHHHH      HHHHHH       HHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH              H   HHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHH       HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH           HHH   HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:                               D  D                DDDDDDDDBDDDDD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                          DDD                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80      
AA:            RIFLEKVLEENAQKKRFNQVLKNLLHAEFLRVQEERILHQQVKCIITEEKVCMVCKKKIGNSAFARYPNGVVVHYFCSKEVNPADT 886
gnomAD_SAV:    H        G  *  P S AVQ F      T R  GLF   M      #T YI   M     V T H SR  I C    G    E 
Conservation:  54797379645945794597573995797774343533544379677599492775737746345335442644544364310163
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE       HH        EEEE    EEEE            
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE     E     EE   EEEE    EEEE            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE                EEEEE   EEEE            
DO_DISOPRED3:                                                                                    DDDD
DO_SPOTD:                                                                                       DDDDD
DO_IUPRED2A: