Q96JG6  VPS50_HUMAN

Gene name: VPS50   Description: Syndetin

Length: 964    GTS: 1.189e-06   GTS percentile: 0.306     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 329      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQKIKSLMTRQGLKSPQESLSDLGAIESLRVPGKEEFRELREQPSDPQAEQELINSIEQVYFSVDSFDIVKYELEKLPPVLNLQELEAYRDKLKQQQAAV 100
gnomAD_SAV:       F*  #I  D  N# Q  T    #   Q S    S  FQ  SCE  T  D   CV         L    C           R  DV  #RW  RR   
Conservation:  3001101001243246322204223151231212553572242617933475474474456480424534334755794373777473355254297459
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH          HHH   HHH      HHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHH       HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         H             HHH HHHHH      HHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHH       HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHH                         HHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                      
DO_IUPRED2A:          DD  D  D  D       D          DDDDDDDDDD DDDD                                                 
MODRES_P:                    S                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKKVADLILEKQPAYVKELERVTSLQTGLQLAAVICTNGRRHLNIAKEGFTQASLGLLANQRKRQLLIGLLKSLRTIKTLQRTDVRLSEMLEEEDYPGAI 200
gnomAD_SAV:      #      V K    R         #D      F               I D *   V   RCR  TV  N  G MN       W     A  G   T 
Conservation:  7455777597995595599797945532423925674337937114544733436646644545257249754755555545575977555755536453
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLCLECQKAASTFKHYSCISELNSKLQDTLEQIEEQLDVALSKICKNFDINHYTKVQQAYRLLGKTQTAMDQLHMHFTQAIHNTVFQVVLGYVELCAGNT 300
gnomAD_SAV:    E     #    N RQ                       I        C    H     ##Q     H  V#E  #    SL  SL    F      V   
Conservation:  5447475355756344353759477779997576444574664484344617544341222330222457777557455755575755799779775554
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H  HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                   DDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DTKFQKLQYKDLCTHVTPDSYIPCLADLCKALWEVMLSYYRTMEWHEKHDNEDTASASEGSNMIGTEETNFDRGYIKKKLEHGLTRIWQDVQLKVKTYLL 400
gnomAD_SAV:             E     #              VVR* V R    V       SKHA L     DVV   #I   C    R        V   I     IC P
Conservation:  5555455477579477514775757267777777685984288288413302110011721110312500545475779757965797779999592777
SS_PSIPRED:     HHHHH  HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:            HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                            DDDDDDDDDDDDDDDDD                                 
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                               
DO_IUPRED2A:                                                    DDDDDDDDDDDDDD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTDLSIFKYDDFIFVLDIISRLMQVGEEFCGSKSEVLQESIRKQSVNYFKNYHRTRLDELRMFLENETWELCPVKSNFSILQLHEFKFMEQSRSPSVSPS 500
gnomAD_SAV:      Y  V R  H      V N F#    Q  S      *QCV         D    W    T      I        D N SPF   T  K  HAS L  R
Conservation:  9795939979997377975579557954975757949779775997999747994775597777979355577754793529999977727355753776
SS_PSIPRED:       HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE        EEEEEEHH EE          
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE       EEEEEHHHHH            
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                           DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                D  DDDD
MODRES_P:                                                                                                   S   S  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KQPVSTSSKTVTLFEQYCSGGNPFEIQANHKDEETEDVLASNGYESDEQEKSAYQEYDSDSDVPEELKRDYVDEQTGDGPVKSVSRETLKSRKKSDYSLN 600
gnomAD_SAV:     R FLA  NA N S  HR         SYRRG         K# A   H     H C      L  P Q#       G    #IYQ A  IG        
Conservation:  5700210101037934401277999353306757677996797465673473346577779777579757549667661703317755453354795273
SS_PSIPRED:                HHHHHH     HHHHH         HHH                        HHHHHH               HHHH           
SS_SPIDER3:                HHHHH         H       HHHHHH                        HHH                                 
SS_PSSPRED:                HHHHHH                                              HHH                                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD D                   DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D     
MODRES_P:                                                                S S                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVNAPILTNTTLNVIRLVGKYMQMMNILKPIAFDVIHFMSQLFDYYLYAIYTFFGRNDSLESTGLGLSSSRLRTTLNRIQESLIDLEVSADPTATLTAAE 700
gnomAD_SAV:     L           I                V               F  VCNI  W  LV     S NC   SSA S      T   F     SI A VK
Conservation:  7145779999999757959997999579599777757439999999777795997755247536495594597795579774742351127213132229
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH             HHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH            HHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HH
DO_DISOPRED3:  DDD                                                          DDD DD                    DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DD                                                          DDDD                     DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                   D DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERKEKVPSPHLSHLVVLTSGDTLYGLAERVVATESLVFLAEQFEFLQPHLDAVMPAVKKPFLQQFYSQTVSTASELRKPIYWIVAGKALDYEQMLLLMAN 800
gnomAD_SAV:         E     CY  G  C NM H     M     W           RR                C   I  T   Q      I     #         H
Conservation:  7979777357554693922232959945975799777595364327536463245234494475557744437397957447577549555974735723
SS_PSIPRED:    HHH       HHHHH       HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H          HHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                                                                                           
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VKWDVKEIMSQHNIYVDALLKEFEQFNRRLNEVSKRVRIPLPVSNILWEHCIRLANRTIVEGYANVKKCSNEGRALMQLDFQQFLMKLEKLTDIRPIPDK 900
BenignSAV:                                                                     S                                   
gnomAD_SAV:                S      F   K           K CT   A  V  DY V#  DQ VAG  VSI   #  #    ##     S EF  #A#V  TA  
Conservation:  5797579999977457724575551541541557427549727643775577799997545554577779777977755775597477759775997997
SS_PSIPRED:          HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        H
SS_SPIDER3:         HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H
SS_PSSPRED:    H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60    
AA:            EFVETYIKAYYLTENDMERWIKEHREYSTKQLTNLVNVCLGSHINKKARQKLLAAIDDIDRPKR 964
gnomAD_SAV:     SI ##N S     S VQQ    R    AR M#   # F   P S         SVG    T# 
Conservation:  5777477747977977972747595755355724553357543554437777444755277774
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                              D   D DDDDDDDDD DDBB
DO_SPOTD:                                                                 DDDDD
DO_IUPRED2A: