Q96KK3  KCNS1_HUMAN

Gene name: KCNS1   Description: Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1

Length: 526    GTS: 2.552e-06   GTS percentile: 0.819     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 241      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAR 100
gnomAD_SAV:          #V  C   P  L  Q L E         K       S     Y   S              QE    RQ RS    E  A  Q PR N      
Conservation:  2222222222222222222222222222222322222222222220033024256597353330313624483355554514142443624766452122
SS_PSIPRED:      EEEE                                             EEEEE  EEEEEEHHHHHH    HHHHHH    HHHHHHH     HHH 
SS_SPIDER3:      HE                                              EEEEEE  EEEEEEHHHH       HHHHH    HHHHHHH       H 
SS_PSSPRED:     EEEEEE                                           EEEEE   EEEHHHHHHHHH    HHHHHH    HHHHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_IUPRED2A:                                 DD                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EFYFDRHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCG 200
gnomAD_SAV:      H      L V V       Y N           RD HH  Q#GDT  S  C    K   I Q S EQ  NML   AS S G A L G  GSC   S V
Conservation:  9799875926753544872485663432364656355554664342254466322433533112117741752247335324665443253134112137
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH    HHH HHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:     E E    HHHHHHHHHHHH  E       HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH   H               HHHHHHHHHHHHHH    HH
SS_PSSPRED:    H  E    HHHHHHHHHHHH EEE      HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH               HHHHHHHHHHHH HHH
DO_DISOPRED3:                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                
DO_IUPRED2A:                                                                     DDDDDDDDDD DDD                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNF 300
gnomAD_SAV:        H   I   #  W L N L   TTRL #S         V K     V   M     SG R DMHEN      G      L      H  ME  ALSL
Conservation:  1165348846569645549734824972564254235845743412003112010222222222222332243057135556653552284166931127
STMI:                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDD DDD                                      
DO_SPOTD:                                                        DDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKE 400
gnomAD_SAV:     Y # S VN     L CPM    M VD  DV  #   SRM K     #  H # S     RMS PEVM N GCH          L     PDA     E 
Conservation:  5137893664386396959523332332232225334673466656566766656554666758775544235356553355435333344334543515
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:    H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDVGFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSIDGVSEASLETS 500
BenignSAV:                                                                      C                      V           
gnomAD_SAV:     NMA    L   CR I  I  M *WE    MA   V     N  VN##IE  VI     L    WH NSP T MHHN  EG     # V # LKV     
Conservation:  4314626665466775455665564356624326555566666385678579655566856464334336514436332220231010020014211212
STMI:                  IIIIIIIIIIIIIIIIIIII       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                    
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH      HHHHHH 
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH               
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHEE       E     HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                  DDDDD
MOTIF:                             TVGYGD                                                                          

                       10        20      
AA:            RETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY 526
BenignSAV:            R               P  
gnomAD_SAV:    Q     RR  V QT T   SL  PV#
Conservation:  12211102110120100122202222
SS_PSIPRED:     HH       HHHHH           
SS_SPIDER3:                              
SS_PSSPRED:              HHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD