Q96KN7  RPGR1_HUMAN

Gene name: RPGRIP1   Description: X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1

Length: 1286    GTS: 1.124e-06   GTS percentile: 0.279     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 12      BenignSAV: 32      gnomAD_SAV: 651      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSHLVDPTSGDLPVRDIDAIPLVLPASKGKNMKTQPPLSRMNREELEDSFFRLREDHMLVKELSWKQQDEIKRLRTTLLRLTAAGRDLRVAEEAAPLSET 100
BenignSAV:                                    L                                                     W         Q    
gnomAD_SAV:    L     #  EYF    TG  S   LV#QR  K IRLH N   W  S  G V*FHK R  GRV#             IS   IG  W  QI GA  R #A 
Conservation:  0001241222224443100111000000012110320313224244442333425632235211224332465223231431110311111111001132
SS_PSIPRED:                             HHH  HH     HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH HH
SS_PSSPRED:                              HHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDD DD D             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            DD        D  DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ARRGQKAGWRQRLSMHQRPQMHRLQGHFHCVGPASPRRAQPRVQVGHRQLHTAGAPVPEKPKRGPRDRLSYTAPPSFKEHATNENRGEVASKPSELVSGS 200
BenignSAV:                                       R                                                        E        
gnomAD_SAV:    T  #   R W H  # #HLR R   A  R*    G  SV   I E  G   A    LR    # A    R  # L  M  V       L  E  G     
Conservation:  1222212211311212321113220010201023001112231113231111111001010011101322120331200000111223112411120000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHH  HHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH HHH                             HHHHHHHHH                            HHHHHHHHHHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHH        HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSIISFSSVISMAKPIGLCMPNSAHIMASNTMQVEEPPKSPEKMWPKDENFEQRSSLECAQKAAELRASIKEKVELIRLKKLLHERNASLVMTKAQLTEV 300
PathogenicSAV:                                                                   Q                                 
gnomAD_SAV:      TV  NT  #V Q T  #V  GV  IVI  IPM   H    T   RH    #G        S   Q  V   I V  FE VSR  S           K 
Conservation:  0000000000000000000000011122122133301110311112121214011111213231126127337423644364604622243334243015
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHH          HHHHHHH H                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDBBBBDDDDDDDDDD DDDD    D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:                       D D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEAYETLLQKNQGILSAAHEALLKQVNELRAELKEESKKAVSLKSQLEDVSILQMTLKEFQERVEDLEKERKLLNDNYDKLLESMLDSSDSSSQPHWSNE 400
BenignSAV:                      V                                                                                  
gnomAD_SAV:      V        RE  R #RD FP   D VSP      EE A      GN  VF          D  VGEQQ     S N H   V  # NR      R#K
Conservation:  3300000000242243234224314325521485343243206323422112311121443365046626525633243282243400020111112001
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHH
DO_DISOPRED3:       DDD     D   DD DD DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DD  D  DDD DDDDDD DD DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIAEQLQQQVSQLQDQLDAELEDKRKVLLELSREKAQNEDLKLEVTNILQKHKQEVELLQNAATISQPPDRQSEPATHPAVLQENTQIEPSEPKNQEEKK 500
BenignSAV:                                    F                                                                    
gnomAD_SAV:      #   * R F  K    V V  E Q     FSQ VK  Y N D      NRR    I R       L     K   YA AFK D# M LTGL  R    
Conservation:  1021412123116412411231342242131202022221521000011222333211421100011112012321100111130020200000100012
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHH         HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHH         HH HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH         HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDD DD   D  D   D   D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD          DDDDD          DDD D         DDDD D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSQVLNELQVSHAETTLELEKTRDMLILQRKINVCYQEELEAMMTKADNDNRDHKEKLERLTRLLDLKNNRIKQLEGILRSHDLPTSEQLKDVAYGTRPL 600
BenignSAV:                                                                                         S   H        Q  
gnomAD_SAV:      L    * I  S A F  GN SNV   HH  YMY*  #  T #I SNS S  R G  G   P  Y   THV* PK  SS  EFS P*H R#    AQL 
Conservation:  1110302334154653488485625724633651356165322114221221302131123135721621462397000000000004564535853211
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD DDD DDDDD   D                              DD DD  D      D                 DD DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD  DDDDD  DD DDDDDDD                                   DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD   DDDDD    D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                DD         DDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLCLETLPAHGDEDKVDISLLHQGENLFELHIHQAFLTSAALAQAGDTQPTTFCTYSFYDFETHCTPLSVGPQPLYDFTSQYVMETDSLFLHYLQEASAR 700
PathogenicSAV:                               #                                                                     
BenignSAV:     # S                               G  I                                                              
gnomAD_SAV:    L R  IQT R     M V   R#  S I  RVR T VI  TV  VE NKL I F CFL #   RS A  LE  H    S R M G NL Y R  R  LSW
Conservation:  2111311110111212312141156566955612516521420122202427976835557635386431801708378837141222033134311221
SS_PSIPRED:       HHH           HHHHHH   HHHHHHHHHH  HHHHHH        EEEEEE                   EEEEEEEE  HHHHHHHHH  EE
SS_SPIDER3:       H              HH      HHHHHHHHH   HHHHHH       EEEEE E          EE      EEEEEEEE   HHHHHHHH   EE
SS_PSSPRED:                               HHHHHHHHH  HHHHHHH     EEEEEEE                    EEEEEEEEE HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDIHQAMASEHSTLAAGWICFDRVLETVEKVHGLATLIGAGGEEFGVLEYWMRLRFPIKPSLQACNKRKKAQVYLSTDVLGGRKAQEEEFRSESWEPQNE 800
PathogenicSAV:                                              E   C                                                  
BenignSAV:                                                                    V                                    
gnomAD_SAV:          V  D   V         M #    I S SI V       R R    G P   N  P VYS * EP*L  *INL  DW D D D  #  ##S  K
Conservation:  5545341522404271435150234321324032206161122238244553462143112102111101222321110010011101000021100264
SS_PSIPRED:    EEEEEHH     EEEEEEEEHHHHHH   EEEEEEEEE     EEEEEEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH        HHH HHHH         E
SS_SPIDER3:    EEEEE     EEEEEEEEEEHHHH     EE EEEEEE     EEEEEEEEEEEEE  HHHHHHHH HHH              H HHHH         E
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHEEEEHHHHH    EEEEEEEEE     EEEEEEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH                          E
DO_DISOPRED3:                                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_SPOTD:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:                                                                                            DD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LWIEITKCCGLRSRWLGTQPSPYAVYRFFTFSDHDTAIIPASNNPYFRDQARFPVLVTSDLDHYLRREALSIHVFDDEDLEPGSYLGRARVPLLPLAKNE 900
PathogenicSAV:           H           C   L                                                                         
BenignSAV:          I W     L                      GV  T          Q              W        G      D                 
gnomAD_SAV:    Q  K I  RD Q #RMR E  S#   H       G#GV  G D    TY  QV L  AANM     WV  ##DI   K   S LS  QTQ T   H E  
Conservation:  6051412812713210102756842746635333271451231481626011635124136316831315045467316030107453406472264152
SS_PSIPRED:    EEEEEEEE              EEEEEE         EE          EEEEEEE  HHHHHHHHH  EEEEEEE        EEEEEEEE HHHH   
SS_SPIDER3:    EEEEEEEEE             EEEEEE      EEEE          EEEEEEE   HHHHHHHHH  EEEEEEE        EEEEEEE  HHHH   
SS_PSSPRED:    EEEEEEEE              EEEEEE                   EEEEEEEEE  HHHHHHHHH  EEEEEE         EEEEEEE HHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SIKGDFNLTDPAEKPNGSIQVQLDWKFPYIPPESFLKPEAQTKGKDTKDSSKISSEEEKASFPSQDQMASPEVPIEAGQYRSKRKPPHGGERKEKEHQVV 1000
BenignSAV:                                                                P                                        
gnomAD_SAV:            AHT    SRF   P  *R   VTR #     PH   N #  N    A K  S  S   RV Y    T  SH QCM  T RREG R  GY   
Conservation:  0536261614113022916140528211513501110100000000010000100111000000000001011312211010000000001101221110
SS_PSIPRED:     EEE EEEE       EEEEEEEEEE      HH   HHH               HHHH                                         
SS_SPIDER3:     EEEEEEEE     EEEEEEEEEEEEE                            HH                                           
SS_PSSPRED:         EE          EEEEEEEE                              HHHH                                         
DO_DISOPRED3:                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SYSRRKHGKRIGVQGKNRMEYLSLNILNGNTPEQVNYTEWKFSETNSFIGDGFKNQHEEEEMTLSHSALKQKEPLHPVNDKESSEQGSEVSEAQTTDSDD 1100
BenignSAV:                                     Q                       L                                           
gnomAD_SAV:     C     R KVSI*RR  I  V FKM DR I VRM      L  A   VDGD    LK         P     TVR I    CF #S G R     N   
Conservation:  2110010101100000000100100010000100000010200000100221120200111000111000110010000122001110101211134145
SS_PSIPRED:                                                             HHHH    HHHH                               
SS_SPIDER3:                            H                E               HHH                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDD     DDDD  DD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VIVPPMSQKYPKADSEKMCIEIVSLAFYPEAEVMSDENIKQVYVEYKFYDLPLSETETPVSLRKPRAGEEIHFHFSKVIDLDPQEQQGRRRFLFDMLNGQ 1200
gnomAD_SAV:    I    V       Y D TYL  IF V   GG M#    V   F G    N   W    L   M  T#VQ T    R   N V RQ   QMWI LNKR#  
Conservation:  2641110000101013342555357270214232041262577693251330013377546845400421545664255256111311282272236121
SS_PSIPRED:                     EEEEEEEEEE    HH      EEEEEEEEE       EE            EEEEE            HHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:     EE             EEEEEEEEEEE    HEEH   EEEEEEEEEE            E        EEEEE  EEEE    H HHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:     EE              EEEEEEEEE     HHH    EEEEEEEEEE                     EEEE            HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD    D                                            DDDDDD                           DDD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80      
AA:            DPDQGHLKFTVVSDPLDEEKKECEEVGYAYLQLWQILESGRDILEQELDIVSPEDLATPIGRLKVSLQAAAVLHAIYKEMTEDLFS 1286
PathogenicSAV:           E                                                                           
BenignSAV:                                            E                                              
gnomAD_SAV:    #    L R    N LPE          C  F   H    E E P     T  RK   I VA  R  VE   # RG# E KN     
Conservation:  21102243835455723232267266824242501552221621312415232020111581737544731651261230000000
SS_PSIPRED:         EEEEEEE            EEEEEEEEHHHHHHH          EE        EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:         EEEEEEEE           EEEEEEEEHHHHHH      H    EE      E  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHH H    
SS_PSSPRED:          EEEEEE            EEEHHHEHHHHHHHH                    EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                       D
DO_SPOTD:                                                                                            
DO_IUPRED2A:          DDD D