Q96LT7  CI072_HUMAN

Gene name: C9orf72   Description: Guanine nucleotide exchange C9orf72

Length: 481    GTS: 2.05e-06   GTS percentile: 0.671     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 242      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSTLCPPPSPAVAKTEIALSGKSPLLAATFAYWDNILGPRVRHIWAPKTEQVLLSDGEITFLANHTLNGEILRNAESGAIDVKFFVLSEKGVIIVSLIFD 100
gnomAD_SAV:    RW   SL  SV    GF         V #YSC*       G  V SSTRKRIF            A  E   *   T GVG     VCG     I  V  
Conservation:  9621769799397947714060475677997797797999937794971320295977579999999999999777799797999997995949779599
SS_PSIPRED:                 EEEEE     HHHHHHEEHHHH    EEEEEE          HHHHHHHHHH     HH        EEEEEEEHH  EEEEEEEEE
SS_SPIDER3:               EEEEEEE       EEEEEEEE      EEEEEE          HHHHHHHHHH     H H      EEEEEEEE    EEEEEEEEE
SS_PSSPRED:                EEEEEE     HHHHHHHHHHH     EEEEEE          HHHHHHHHHHH              EEEEEEEE    EEEEEEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GNWNGDRSTYGLSIILPQTELSFYLPLHRVCVDRLTHIIRKGRIWMHKERQENVQKIILEGTERMEDQGQSIIPMLTGEVIPVMELLSSMKSHSVPEEID 200
gnomAD_SAV:       K  H AC  LVM     FR  F  Y A  N   #T L #  G RN  P   *N T  R   VKHH# #   V# AK  SI      LR  # A  T 
Conservation:  9547977797799577794992959999247959957279779959599777239557575477377594565349429736595975977373636354
SS_PSIPRED:          EEEEEEEEEE HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:          EEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:           EEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IADTVLNDDDIGDSCHEGFLLNAISSHLQTCGCSVVVGSSAEKVNKIVRTLCLFLTPAERKCSRLCEAESSFKYESGLFVQGLLKDSTGSFVLPFRQVMY 300
BenignSAV:           S                           I                                                                 
gnomAD_SAV:     PN E S  H#A  #   C    V          IL  CR  #   #   * V Q   D R  K RK# L    G    A V  NH A   MQ  # LV 
Conservation:  5038354777977575547625776997999999477977376597462876679453663577461223243743779799979756796979797756
SS_PSIPRED:    HHHH            HHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH             EEEEEEE     EEEEHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHH EE          HHHHHHHHHHHHHH   EEEE   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH             EEEEEEE     EE  HHHHH 
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHH     EEEE   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH                EEEEEEE      E  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APYPTTHIDVDVNTVKQMPPCHEHIYNQRRYMRSELTAFWRATSEEDMAQDTIIYTDESFTPDLNIFQDVLHRDTLVKAFLDQVFQLKPGLSLRSTFLAQ 400
gnomAD_SAV:    T      #E   S LTPVS    RV K*HS ##CKPI L#       V #YR #C  KGVA         IQG S       H   MRA   IG  #   
Conservation:  5577699997977796997979993639617543792277742467430360263356377977779675371766751974777266445255427754
SS_PSIPRED:        EEEEE     EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH              HHH HH    HHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEEEE    EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH       E          HHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        EEEEE    EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH                        HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80 
AA:            FLLVLHRKALTLIKYIEDDTQKGKKPFKSLRNLKIDLDLTAEGDLNIIMALAEKIKPGLHSFIFGRPFYTSVQERDVLMTF 481
gnomAD_SAV:      FF R RVS  T  V NNM  # NL  PFW V V V      N S  VGV  N   S YY # RG S    E ##     
Conservation:  757474963637457667577674636569759917737317779275664666443797474764473773577737337
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHH       HHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH H      HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH    HHHHHH       HHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHH       HHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                 DD
DO_SPOTD:                                                                                   DDDD
DO_IUPRED2A: