Q96M95  CCD42_HUMAN

Gene name: CCDC42   Description: Coiled-coil domain-containing protein 42

Length: 316    GTS: 1.054e-06   GTS percentile: 0.248     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 182      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSLGIMEEEDLAEYFRLQYGERLLQMLQKLPNVEGASESPSIWLLEKKKETEIMHQTMVQKKKMFQRRMETLNLRWEELGVKEAQLKAHIQKSEQFIQEN 100
BenignSAV:                                                       P                       C                         
gnomAD_SAV:    I        E  #  Q HH  Q Q  I   L  D ST            DIQFT   V  Q  T  H # IVK #  KV IED H            R  
Conservation:  9000000002003320001110110000012000010021111312433611042223102022320131131141235013223241111233123521
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD            DD DD                                                                         
DO_IUPRED2A:                                DD                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQKRIRAMKKANKERELKCQHMQELTKRKQEMVALRLEHQRLSAKLKDYYIFNKYLEKVVENSEFEEIHEVIARYKTLVSMRHDLMQSAQEGQEKIERAK 200
BenignSAV:                                                T                                                        
gnomAD_SAV:    N  W CS   DKRG*KF  HRR K  NCE*G MV#Q *  #  T      V  NH G   D  K K     #T#  MP N # Y K  T*G    TGCTN
Conservation:  4010022125212221110221133114214011511131240024121126013532432044725312531432173022117122211023112112
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    DDD  DDDDDDDD DDDDDDDD                                                                  DDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ARLARYMEEKDDEILQQNNELARLQMRFDRARSNVIFWESRWAHIQNTAAKKTLLLGTIKMATLNLFQIVSKHLKEVTEVALEDTHKQLDMIQQFIQDRS 300
gnomAD_SAV:     WP HCTKG      E  K  #    H  SDH  A SR# H VL R    *        E TM    H M  Q TG   # P  NQ L     R    LL
Conservation:  2160141320111341011241231123422312301322162256233324232421232442444203100111000112153018721520221200
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10      
AA:            DIWAEVKKKEQQRVRI 316
gnomAD_SAV:      RV #    #KQ QV
Conservation:  1200000010000000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:            DBBBBB
DO_SPOTD:              DDDDDDDD
DO_IUPRED2A: