Q96NR3  PTHD1_HUMAN

Gene name: PTCHD1   Description: Patched domain-containing protein 1

Length: 888    GTS: 1.02e-06   GTS percentile: 0.232     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 12      gnomAD_SAV: 238      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLRQVLHRGLRTCFSRLGHFIASHPVFFASAPVLISILLGASFSRYQVEESVEHLLAPQHSLAKIERNLVNSLFPVNRSKHRLYSDLQTPGRYGRVIVTS 100
PathogenicSAV: T                                                                                                   
BenignSAV:                                                                             F        H                  
gnomAD_SAV:           G  K   CWV R     S         M V F     #       K       NP E   S   NF  F H   H         G     #I 
Conservation:  2221120110222222220221235523221312132122123121202111302124102121111121012001111100102010011001121110
STMI:                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                            
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH       HHHHHHHHHHHH                   EEEEEEEE
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH       EE   HHH       HHHHHHHHHHHH        EEEE       EEEEEEEE
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH      HHHHHHHHHHHH                   EEEEEEE 
DO_DISOPRED3:  D                           DDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                  N                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQKANMLDQHHTDLILKLHAAVTKIQVPRPGFNYTFAHICILNNDKTCIVDDIVHVLEELKNARATNRTNFAITYPITHLKDGRAVYNGHQLGGVTVHSK 200
PathogenicSAV:                                                                                 T                   
BenignSAV:                                                            I                V                     I     
gnomAD_SAV:    LRR  V      N      T           L                #M  T  I  GV  SQV  W    V   V  V        A    SI     
Conservation:  2100012220000001046215124381223576693549423313184596662364643153128171225298442627640365999888620133
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE  EEEE          HHHHHHHHHH        EEEE              HHH   EEE   
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHH  EEEE    EEEEEEE           HHHHHHHHHHHHH       EEE  EEE     E  HHHH   EE    
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHH     EEEE             HHH E  EEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                      N                                 N                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRVKSAEAIQLTYYLQSINSLNDMVAERWESSFCDTVRLFQKSNSKVKMYPYTSSSLREDFQKTSRVSERYLVTSLILVVTMAILCCSMQDCVRSKPWLG 300
BenignSAV:                                                       L                                                 
gnomAD_SAV:    YQ               VS#   VL  K      N  S  E  #    L S M   P   L   T#I  H  F   M    VTM    TRN IH    R 
Conservation:  3266363554354553012113513322850194133115210212413333563591256435404522464365254223533343646658389789
STMI:                                                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMM
SS_PSIPRED:      EEEEEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEEEEE  EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLGLVTISLATLTAAGIINLTGGKYNSTFLGVPFVMLGHGLYGTFEMLSSWRKTREDQHVKERTAAVYADSMLSFSLTTAMYLVTFGIGASPFTNIEAAR 400
BenignSAV:                                                               R                                         
gnomAD_SAV:     P  A       ST#   S         L     IV S   H      T            #I  G   E            V       NS   TA   
Conservation:  4966535346257769654553447574546556232798739499697799665937679783825658475467357357346795779979947677
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH   EEEEEE     EEEHHHHHH      HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HEHHH  HHHHHH    EEEEEEHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                        N      N                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IFCCNSCIAIFFNYLYVLSFYGSSLVFTGYIENNYQHSIFCRKVPKPEALQEKPAWYRFLLTARFSEDTAEGEEANTYESHLLVCFLKRYYCDWITNTYV 500
BenignSAV:                                                                          D        G                 K   
gnomAD_SAV:           V V   CFC F  S         V  DH  IVI           K #VR      VT        K TD FK Y  #G F H       K   
Conservation:  4983244657356949355975669957966944669656967796362621672976247254312232220410334276633656368459789798
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEE   HHHH     HHHHHEEE                  HHHHHHHHHHHHHH    H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E EEE    HHH   HHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH     EE     HHHHHH HHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:                                                                         DDDDDDDDDDD                      
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KPFVVLFYLIYISFALMGYLQVSEGSDLSNIVATATQTIEYTTAQQKYFSNYSPVIGFYIYESIEYWNTSVQEDVLEYTKGFVRISWFESYLNYLRKLNV 600
gnomAD_SAV:                      #V I     I      V      SN                    T        D  V   R   #           Q  S 
Conservation:  9996776997959967996896236354545754372743751386659869998999979975399905893654253289233994637517931092
STMI:           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH      HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE        HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH      HHHHHHHHHHH       EEEEEE       HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH    HHHHHHHHHHHHH      EEEEE        HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                         N                              N 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STGLPKKNFTDMLRNSFLKAPQFSHFQEDIIFSKKYNDEVDVVASRMFLVAKTMETNREELYDLLETLRRLSVTSKVKFIVFNPSFVYMDRYASSLGAPL 700
gnomAD_SAV:        SE    #  K     #T  L#          # Y I         M  NV   K   CH                 I  L  I T Q V    G  
Conservation:  6222352395129322985145735826989544203231456898577797834435353215966995886335778669997977595634653495
SS_PSIPRED:             HHH HHHHHH       HH  EEE        EEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHH        H HEEEE       EEEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHH        HHHHH           EEEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE     EHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:             N                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HNSCISALFLLFFSAFLVADSLINVWITLTVVSVEFGVIGFMTLWKVELDCISVLCLIYGINYTIDNCAPMLSTFVLGKDFTRTKWVKNALEVHGVAILQ 800
BenignSAV:                                                                             A                           
gnomAD_SAV:        M      L            I        #    T                   C      VS   IVA   M  N    E I    KM     SH
Conservation:  2573364545836724645366543963655496579659758983726766858897354766584649564594663617993774159618945359
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                    MMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH    EEEE  EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                   N                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        
AA:            SYLCYIVGLIPLAAVPSNLTCTLFRCLFLIAFVTFFHCFAILPVILTFLPPSKKKRKEKKNPENREEIECVEMVDIDSTRVVDQITTV 888
BenignSAV:                                                                                      A      
gnomAD_SAV:                  L  SM                L        M  S T      ED    K Q  TG#  #   NR H #   K  
Conservation:  3226734563962486989827697962843257379665799549685886633321331122445466485252255222666934
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHEE         EEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH                HHH    E                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH              EEE  
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDDDDBDDBBBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                           D DDDD                          
CARBOHYD:                       N