Q96NT5  PCFT_HUMAN

Gene name: SLC46A1   Description: Proton-coupled folate transporter

Length: 459    GTS: 1.725e-06   GTS percentile: 0.548     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 10      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 204      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEGSASPPEKPRARPAAAVLCRGPVEPLVFLANFALVLQGPLTTQYLWHRFSADLGYNGTRQRGGCSNRSADPTMQEVETLTSHWTLYMNVGGFLVGLFS 100
BenignSAV:                                                                   S                                     
gnomAD_SAV:      W  R SK     S      LD#A   IL  Y      S       *    V RVC A S TRCSC #           F  D A   KA S  M #LL
Conservation:  2110001002101000001121113453223222322210441455442324232322221002011101002112375455769587354466253442
STMI:                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                    MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                     HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                      EE    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      EE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                         DDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD                                          DDDDDDDDDDDDDD                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD DD                                              D DDDDDDDDD                          
MODRES_P:           S                                                                                              
CARBOHYD:                                                               N         N                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STLLGAWSDSVGRRPLLVLASLGLLLQALVSVFVVQLQLHVGYFVLGRILCALLGDFGGLLAASFASVADVSSSRSRTFRMALLEASIGVAGMLASLLGG 200
PathogenicSAV:             #                                 R        Y                                            
gnomAD_SAV:          C  N  CL#  A  P  V     AY#S G  R Q V  MP        S    F  T  VF   D F CRHS #   V T  R GAI T   R 
Conservation:  3475858770488734924422644443244537532377535645983556439845266736866588452002774858379856945854563288
STMI:          MMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHEH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HWLRAQGYANPFWLALALLIAMTLYAAFCFGETLKEPKSTRLFTFRHHRSIVQLYVAPAPEKSRKHLALYSLAIFVVITVHFGAQDILTLYELSTPLCWD 300
BenignSAV:                                                                                                   A     
gnomAD_SAV:       Q   F SL C # S  T  I H         N     # LM L# # T  FC S T  E   Y   C  SV E  N    D          K PY N
Conservation:  1743358533969755422443349335441865011103375711862541285222200105018288254473553583643462667886199992
STMI:          MMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH   HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHH    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HEHEEEE       
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKLIGYGSAAQHLPYLTSLLALKLLQYCLADAWVAEIGLAFNILGMVVFAFATITPLMFTGYGLLFLSLVITPVIRAKLSKLVRETEQGALFSAVACVNS 400
PathogenicSAV:                  R                D  R                                     #                        
gnomAD_SAV:     R  ##           R  #  V      N * D MS  I   R   S    SM VV   *R          L W     M  D     V    D  KN
Conservation:  6157848564134255467347535605417356643662583266444537145265848864346354269748787945711266935542345333
STMI:                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH        HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        6
AA:            LAMLTASGIFNSLYPATLNFMKGFPFLLGAGLLLIPAVLIGMLEKADPHLEFQQFPQSP 459
PathogenicSAV:                         R                                  
BenignSAV:                                                            S   
gnomAD_SAV:     VV M  S  S F     S#T       E  I  LLG   EI  N   YF   E S*N 
Conservation:  23342433354354435414535445433323543522535121100100020111011
STMI:          MMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                   DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                              
MODRES_P:                                                               S