Q96QK1  VPS35_HUMAN

Gene name: VPS35   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 35

Length: 796    GTS: 1.216e-06   GTS percentile: 0.318     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 221      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPTTQQSPQDEQEKLLDEAIQAVKVQSFQMKRCLDKNKLMDALKHASNMLGELRTSMLSPKSYYELYMAISDELHYLEVYLTDEFAKGRKVADLYELVQY 100
BenignSAV:                                                       S     I                        R                  
gnomAD_SAV:      A             V GMRG    #  K      T             S  WAP#    R    H  FF   #C            K  S        
Conservation:  5523535223355666555452655556555563965999999999994999669999996669999999999969966999699699999699699999
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
REGION:                                VQSFQMKRCLDKNKLMDALK                                                        
MODRES_P:            S                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGNIIPRLYLLITVGVVYVKSFPQSRKDILKDLVEMCRGVQHPLRGLFLRNYLLQCTRNILPDEGEPTDEETTGDISDSMDFVLLNFAEMNKLWVRMQHQ 200
gnomAD_SAV:                I         R  S                   C             T T   KQ HK      N                  *    
Conservation:  9964994969666696996699599969999969999699999999999999999999969996691025129966399599999999999999999699
SS_PSIPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH HHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                      DDDDDDDD                            
DO_IUPRED2A:                                                                 DDDDDDDDDDD                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GHSRDREKRERERQELRILVGTNLVRLSQLEGVNVERYKQIVLTGILEQVVNCRDALAQEYLMECIIQVFPDEFHLQTLNPFLRACAELHQNVNVKNIII 300
BenignSAV:                                             M                                                           
gnomAD_SAV:     Y    G              I              C            A            I  V   C      R   AL W    VY S  #  V  
Conservation:  9996969999569999999999999999999969966659556255969596666396665566666696999999999659966996699269696969
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHH HHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_SPIDER3:       H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DDDDDD                                                                                           
REGION:            DREKRERERQE                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALIDRLALFAHREDGPGIPADIKLFDIFSQQVATVIQSRQDMPSEDVVSLQVSLINLAMKCYPDRVDYVDKVLETTVEIFNKLNLEHIATSSAVSKELTR 400
BenignSAV:                    S                                                                 R                  
gnomAD_SAV:        S V    C  EL   VGM  LNV  *H          I     IF P       VTG S C         K     SRPS   V     I    A 
Conservation:  6966999969999999999269999969999996999999697799669979996796999996769999699756569999697996999999999969
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLKIPVDTYNNILTVLKLKHFHPLFEYFDYESRKSMSCYVLSNVLDYNTEIVSQDQVDSIMNLVSTLIQDQPDQPVEDPDPEDFADEQSLVGRFIHLLRS 500
PathogenicSAV:                                                                                        R            
BenignSAV:                           L                                                                             
gnomAD_SAV:             SD  A      YYL  A   H#   N  YC  GD V F            V    CM T   S E E ET   YL    G M ##F   H 
Conservation:  9999969396739699595796779999967999269695937276139332196997156273579359779551555357732357277572953527
SS_PSIPRED:    HHH  HHH   HHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HH  HHH    HHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH HEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHH H HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                             DDDDDDD                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                         DDDDDDDDDDDDD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDPDQQYLILNTARKHFGAGGNQRIRFTLPPLVFAAYQLAFRYKENSKVDDKWEKKCQKIFSFAHQTISALIKAELAELPLRLFLQGALAAGEIGFENHE 600
BenignSAV:                            W                                                                            
gnomAD_SAV:     Y E #     I #         Q C  Q S      H   Q  #H EL  I      NT     # V   M        *        TS D D   D 
Conservation:  5775577577777779797977357539979779755775737715210967955777799595779779979977799999999999997955999999
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH        EE HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH      H
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH      EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVAYEFMSQAFSLYEDEISDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLRTQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECL 700
PathogenicSAV:                    N                                                                                
BenignSAV:      D                                                                                                  
gnomAD_SAV:                   N           TI  V SL  L     G              R        Q     S   CP   A RS # I  A       
Conservation:  9979999996667666677656669699799799996339969999997959799799999997996999766977997355667277952356755575
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHEEEEHE              HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                        DDDDD             
DO_IUPRED2A:                                                                                          DD           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKALKIANQCMDPSLQVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLRRESPESEGPIYEGLIL 796
BenignSAV:                                         V                                    M                      
gnomAD_SAV:     RP  L S    R   M           S       P       L     Q   L   Y   A H   R D  MD    QQKT D #         
Conservation:  666666696966559669996999966559566695397379999977965677997531595779579919779997555535736932757724
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                        DD DDD D                                  
DO_SPOTD:                                                                                       DDDDDDDD  DD DD
DO_IUPRED2A:                                                        D   DD DDD DD D        DDD                 
MODRES_P:                                                                                        S       Y