Q96S52  PIGS_HUMAN

Gene name: PIGS   Description: GPI transamidase component PIG-S

Length: 555    GTS: 2.088e-06   GTS percentile: 0.685     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 295      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAAGAAATHLEVARGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRASLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLDDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKI 100
PathogenicSAV:                                  P                                                                  
gnomAD_SAV:    L V  P SIPV#M W   S F  TV       L *       QP  L  H RD  TF   #I    #LL LA      K   T   GP G  H  * I  
Conservation:  1111001100141044214332333423235254444454323313512240131021326133324543143411222124411011312113212305
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                             
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH  HH        EEEEEE     HHHHH     HHHHH   HHH    
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH EE EE   HHHH  HHH        EEEEEE     HHHHH    HHHH           E
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE    HHHHHHHHHHH     EEEEEEE     HHHHHH     HHHHH HHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KCRFQKAYRRALDHEEEALSSGSVQEAEAMLDEPQEQAEGSLTVYVISEHSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGIMHREAFNIIGRRIVQVAQAMSLTEDVL 200
gnomAD_SAV:    Q C   TC#KS GN   V  LSTA*GV T# GGS  *      AHM  DY LP S G   CT L TR  MP   RW     T CCT R T #V S V   
Conservation:  1244410771421164136121421443116002120118342355653041465322035682272444750011215103001424532366340124
SS_PSIPRED:    EEEEEEEHHH             HHHHHHHH         EEEEEEE            EEE    EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH
SS_SPIDER3:    EEEE HHHHH   HHHH      HHHHHH           EEEEEEEE          EEEE   EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH         EEEEEEEE                 EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                     D   DDDDDDDDDDDD                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAALADHLPEDKWSAEKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVYWDIEGAVRRYVQPFLNALGAAGNFSVDSQILYYAMLGVNPRFDSASSSYYLDMHSL 300
BenignSAV:                                                         H                                               
gnomAD_SAV:       V VY  #ENLRT  WQ F  T     I    ILA      H  # RTIQC M*    VFS S  L EV     C V R   C   P    C    G 
Conservation:  1456457230111313236358683944535453355643605185642721134392512331244464587556544888354441112231822159
SS_PSIPRED:    HHHHH         HHH         EEEEEEEE            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEEEEEEE              EEEEEHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH       H              EEEEEEEE            HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEEEE              EEE HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH        HHH          EEEEEEE          E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEEEEEEE              EEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                        N                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYNVDSKTYNASVLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIA 400
PathogenicSAV:        G                                                                                            
BenignSAV:                                                S                                                        
gnomAD_SAV:     Q V  #G         FCLL    P M   V #L    N  #S    S   NSC     I SI    H#V       K  V * # L  P  W  LR V
Conservation:  4687485554698565774887899986962186983926226115167676977976755765300111120383152757218958994988566842
SS_PSIPRED:         HHHHH          EEEEEEEE        EEE           EEE     EEEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HH   H HH           EEEEEEE         EEE     EE E EEEE    EEEEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                        EEEEEEE         EEE          EEEE     EEEE               EEHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                        D                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                           N                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QPQLPPKCLLSGPTSEGLMTWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDDVASEVYKAVAAVQKSAEELASGHLASAFVASQEAVTSSEL 500
gnomAD_SAV:     S R   G  P  A  R#I  QV W  GV# M    AT IS I  T#  CN G TI    #T     VIT I  L   *V  #      T E GLI#   
Conservation:  1203611224112231543289683957354497566736777997799567699995937937842653445052148329480186136535333694
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50     
AA:            AFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLVKIFLETRKSWRKPEKTD 555
gnomAD_SAV:     #  L  P  H  S      V  QF   VV        RV   SH    N    H
Conservation:  6896589988869968888866974458438864466254205023113210603
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    HH  HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:        HHHHHHH   HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HH    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                   DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                      DDDD