Q96SB8  SMC6_HUMAN

Gene name: SMC6   Description: Structural maintenance of chromosomes protein 6

Length: 1091    GTS: 8.127e-07   GTS percentile: 0.144     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 405      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAKRKEENFSSPKNAKRPRQEELEDFDKDGDEDECKGTTLTAAEVGIIESIHLKNFMCHSMLGPFKFGSNVNFVVGNNGSGKSAVLTALIVGLGGRAVAT 100
gnomAD_SAV:      E  *   P  I    S *  S A Y    KNK T NI# V     L NV   D     #         AS I  S                 RK    
Conservation:  7359621010011006315120110121131121000001124446464452446676842676528745567657346687856756758577657236
SS_PSIPRED:                                                  EEEEEEEE         EEE     EEEE      HHHHHHHHHHHH   HHH 
SS_SPIDER3:        HH            HHHHHHH                     EEEEEEEEE      EEEE     EEEEE      HHHHHHHHHH     HHH 
SS_PSSPRED:                                              EE  EEEEEEEE          E     EEEEE     HHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBBBBBBDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                                                  
NP_BIND:                                                                                  GNNGSGKS                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NRGSSLKGFVKDGQNSADISITLRNRGDDAFKASVYGNSILIQQHISIDGSRSYKLKSATGSVVSTRKEELIAILDHFNIQVDNPVSVLTQEMSKQFLQS 200
gnomAD_SAV:    #S  C      E  S   T        V D  TNM    M T  YSR   T  C  #  R  M      D M  R         #     R  GR     
Conservation:  6753468288614623646363848581565632268126252356415816455564127135635856623498475765598455745555525545
SS_PSIPRED:         HHHHHH    EEEEEEEEE         HH    EEEEEEEEE    EEEEE     EE   HHHHHHHHHH             HHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:         HHHHHH    EEEEEEEEE        H      EEEEEEEEE   EEEEEE     EEEEEHHHHHHHHHH        EEEE HHHHHHHH  
SS_PSSPRED:         HHHHH     EEEEEEEEE              EEEEEEEEE     EEEEE     EEE  HHHHHHHHHHH         E  HHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KNEGDKYKFFMKATQLEQMKEDYSYIMETKERTKEQIHQGEERLTELKRQCVEKEERFQSIAGLSTMKTNLESLKHEMAWAVVNEIEKQLNAIRDNIKIG 300
gnomAD_SAV:    # GE   RC   TME   L       #GM D        R  #   V CRYIDTG C   VP#   T     Y  RK     IS* GN* # V  K  T 
Conservation:  3334336479686847597536633842651270145124241713752131455536433323335211841843287955828192234243414114
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                DDDDDDDDDDDD D DDD                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDRAARLDRKMEEQQVRLNEAEQKYKDIQDKLEKISEETNARAPECMALKADVVAKKRAYNEAEVLYNRSLNEYKALKKDDEQLCKRIEELKKSTDQSLE 400
gnomAD_SAV:      #    H  VK     VIKVD N   T  N   #N     #    IS   N  V  K C     S  #   KH     G K F  #       A     
Conservation:  3121033145435441651245232312433521524422152333114814431233234338414342233352525522471256244414113113
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                               DDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DD    DDDDD DDDDDD       DDDD DDDDDD                                                D  DD   DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PERLERQKKISWLKERVKAFQNQENSVNQEIEQFQQAIEKDKEEHGKIKREELDVKHALSYNQRQLKELKDSKTDRLKRFGPNVPALLEAIDDAYRQGHF 500
BenignSAV:                                                                    G                                    
gnomAD_SAV:      W DG  RKP   Q   T   K  L SR #KR   TM      #  V      M RE  C  G     EG    Q    SLH     K #NV  GRR  
Conservation:  1412343334005423431411321242653234335202145512452171012311321223242162466362557882348265136325323629
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDD DDD DD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                            DDDDDDDD   D  DDDDDD               D     DD                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TYKPVGPLGACIHLRDPELALAIESCLKGLLQAYCCHNHADERVLQALMKRFYLPGTSRPPIIVSEFRNEIYDVRHRAAYHPDFPTVLTALEIDNAVVAN 600
gnomAD_SAV:     S       VYV  WN      V C F     TC  R# D  SL#    N  C  R  Q L      W  V#G    T           T V        
Conservation:  3268498694553658334467793985354268497761983285167122521402993857319221376521634175355665336342354659
SS_PSIPRED:            EEEEEE  HHHHHHHHHHH  HH EEEE  HHHHHHHHHHHHHH         EEE           HHH        HHHHHH   HHHHH
SS_SPIDER3:            EEEEEE  HHHHHHHHHH      EEEE  HHHHHHHHHHHHH          EEEE           H       HHHHHHH    HHHHH
SS_PSSPRED:            EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH          EE          HHHH      HHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLIDMRGIETVLLIKNNSVARAVMQSQKPPKNCREAFTADGDQVFAGRYYSSENTRPKFLSRDVDSEISDLENEVENKTAQILNLQQHLSALEKDIKHNE 700
BenignSAV:                                                                                               T         
gnomAD_SAV:             A    #  Y    AL F      FG G   E   A S        IG#    G         G   Q#RM   I   R   T #  TQ   
Conservation:  6887374883696864312872585011583682476723886670384854311342585374624732431532311332113333311222442053
SS_PSIPRED:    HHH      EEEEE  HHHHHHHHHH      EEEEEE    EEEE            EE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHH      EEEEEE    EEEEEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH   EEEEE  HHHHHHHHHH      EEEEEE    EEEE                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                     DDDDDDDDDDDD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                           DD    DDDD             D            DDDD     DDD                            
MODRES_P:                                                                          S                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELLKRCQLHYKELKMKIRKNISEIRELENIEEHQSVDIATLEDEAQENKSKMKMVEEHMEQQKENMEHLKSLKIEAENKYDAIKFKINQLSELADPLKDE 800
gnomAD_SAV:    D        F          F   WG     Q P A      V TL S N   #         KST LF    M      G V  R IR L   G    A
Conservation:  1131121111723311132112351674533713215523964534641153212311221231252124101123512323362233352623454654
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                          DD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNLADSEVDNQKRGKRHYEEKQKEHLDTLNKKKRELDMKEKELEEKMSQARQICPERIEVEKSASILDKEINRLRQKIQAEHASHGDREEIMRQYQEARE 900
gnomAD_SAV:          D AD RQ  QY#        #   E# Q  NI    R  T   V  V L C    NC#   GE V G K R  V R G   QQ   ##     G
Conservation:  5222424212243124244352426311532251161154234330335833744553241433436638644761472342123743435554614632
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD D                           DDDDDDDDDDDDDDDD D      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TYLDLDSKVRTLKKFIKLLGEIMEHRFKTYQQFRRCLTLRCKLYFDNLLSQRAYCGKMNFDHKNETLSISVQPGEGNKAAFNDMRALSGGERSFSTVCFI 1000
BenignSAV:                                Q                                                                        
gnomAD_SAV:            MK   QL      V   #   *E I        T   H      SC       Y  A P M  R   RS P  D L                
Conservation:  3522312346284275126225411721271156425636843582047225252724187944448563844432332113857498787778766555
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE    EEEEEEE                 HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE    EEEEEEE                 HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE     EEEEEEE      HHH   HHH   HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                              DDD DDDDDDDDDDDDD       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                    DD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90 
AA:            LSLWSIAESPFRCLDEFDVYMDMVNRRIAMDLILKMADSQRFRQFILLTPQSMSSLPSSKLIRILRMSDPERGQTTLPFRPVTQEEDDDQR 1091
BenignSAV:                                                  M                                             
gnomAD_SAV:         VT     Y       V  F   VT#E         H K*   F    INL S T  VG  *T     EE A      SE   GG #
Conservation:  7669364669977898787698647745455646337337224887767864563771422447557267454522221120101222211
SS_PSIPRED:    HHHHHH    EEEEEE HH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE             EEEEEE                        
SS_SPIDER3:    HHHHH     EEEE        HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE            EEEEEE                        
SS_PSSPRED:    HHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE              EEEE                         
DO_DISOPRED3:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDD