Q96T21  SEBP2_HUMAN

Gene name: SECISBP2   Description: Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2

Length: 854    GTS: 8.011e-07   GTS percentile: 0.140     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 444      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASEGPREPESEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWLESSEACVFPSSAATYYPFVQEPPVTEQKIYTEDMAFGASTFPPQYLSSEITLHPYAYSPYTLDST 100
gnomAD_SAV:    I *   W#S   D E PV I S  R   #HDM R G L  R L  FV AC L# *         H      R     SE       PNLCPD L N N I
Conservation:  0000000000000122323321332210111112013212113322201432243433120132423422332112320012211200212022131221
SS_PSIPRED:                                                                     HHH                                
SS_SPIDER3:                  EE               E E       E           E           HHH                                
SS_PSSPRED:                  E                             HHHH                                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD                                                D                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QNVYSVPGSQYLYNQPSCYRGFQTVKHRNENTCPLPQEMKALFKKKTYDEKKTYDQQKFDSERADGTISSEIKSARGSHHLSIYAENSLKSDGYHKRTDR 200
BenignSAV:                                             V                                                           
gnomAD_SAV:     S H  S  P RHH    **       Q  IA   LH T V L  TNHN  IMD     Y K G  IVTP     # PY   V S  N ILN#CR * E 
Conservation:  1221110000000011112021211212121120000000000000000143000221010111201011011211110011101121122000111222
SS_PSIPRED:                                        HHHHHH              HH             EE                           
SS_SPIDER3:                                        HHHHHH               HH                                         
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHH                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                DD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD          D        DDDDDDD D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSRIIAKNVSTSKPEFEFTTLDFPELQGAENNMSEIQKQPKWGPVHSVSTDISLLREVVKPAAVLSKGEIVVKNNPNESVTANAATNSPSCTRELSWTPM 300
BenignSAV:                                     I                                                                   
gnomAD_SAV:     YG    KLP F L  D SI   LQ   S  SI  TR    RELI    #E   R  A  S V  # VKR   S LD    P  T S   Y S  P*  V
Conservation:  2321112112000005000006732302110101010111122011212000000212332111100000213112011011121001121010200221
SS_PSIPRED:                   HH       HH  HHH  HHHH               HHH       HH    EEEE                            
SS_SPIDER3:                                    HHHH                 H       HHH    EEEEE                           
SS_PSSPRED:                                                                 HHH     EEE                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD              D    D DDDDDDDDDDDDDDD   D                     DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYVVRQTLSTELSAAPKNVTSMINLKTIASSADPKNVSIPSSEALSSDPSYNKEKHIIHPTQKSKASQGSDLEQNEASRKNKKKKEKSTSKYEVLTVQEP 400
gnomAD_SAV:    VF IQE   AV    SEII  LVK EIV L      F L F  T FL S C    N FR P E  V H  V  #H T#  S E * E A *C AP   DS
Conservation:  0011212121001211112000002411233422411110111100000000000000000001011011101002122413565130010021010232
SS_PSIPRED:                          EEHHHH            HHH                           HHHHHHHHHH                    
SS_SPIDER3:                            HHH       EE                                   HHHHHHHHHHHH                 
SS_PSSPRED:                                                                           HHHHHHHHHH                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:          DD D  DDDD DD  DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                                                        KNKKKKEK             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRIEDAEEFPNLAVASERRDRIETPKFQSKQQPQDNFKNNVKKSQLPVQLDLGGMLTALEKKQHSQHAKQSSKPVVVSVGAVPVLSKECASGERGRRMSQ 500
BenignSAV:                                E                                  R                            V        
gnomAD_SAV:     GM* SK  RIV GS  #K T#  L  E   # RV L* T       L#   W#VPIT  NQRR  PTE  P#     L     I  A V VGT C#I  
Conservation:  5345523374251120102110022210122113011212257644564985755934653582322243227553446432331154210102001001
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHH    HHH       HH            EEEHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE                     
SS_SPIDER3:              HHHH  H                                E    HHHHH HH HH H       EEEEE    E                
SS_PSSPRED:                                                    EEE    HHHHHHHHHHHHHH     EEEEE     EE              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKTPHNPLDSSAPLMKKGKQREIPKAKKPTSLKKIILKERQERKQRLQENAVSPAFTSDDTQDGESGGDDQFPEQAELSGPEGMDELISTPSVEDKSEEP 600
PathogenicSAV:                                        Q                                                            
BenignSAV:                               R                                                                         
gnomAD_SAV:      #LRI     T VIRT    DLS  E AS     #  DQRK ERC     LN S S   #     D   R  K     E   I KR TS L K N D  
Conservation:  0022263462434326593343233344342343546333335321113201110121100101100112000100110000000011113201102110
SS_PSIPRED:                  HH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HH                        
SS_SPIDER3:                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHH                        H                          
SS_PSSPRED:                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PGTELQRDTEASHLAPNHTTFPKIHSRRFRDYCSQMLSKEVDACVTDLLKELVRFQDRMYQKDPVKAKTKRRLVLGLREVLKHLKLKKLKCVIISPNCEK 700
gnomAD_SAV:     SRV *   GV R VSSD I LE R C L     *I N  AAG#  #PV    C R HI RR    #   H* A EFSD   Y N      IV CLS  T
Conservation:  1000010000000111001103354544545995649375662554299649869875354566258636575779799939777736677656797996
SS_PSIPRED:                             HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH   EEEE HHHHHHHHH    EEEEE    HH
SS_SPIDER3:                             HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H H     EEEE HHHHHHHHH     EEEE   HHH
SS_PSSPRED:                              HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH      EEE HHHHHHHHHH    EEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                               BBBDDDDDDDDDDDD                            D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                               
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                               
REGION:                                                                                LVLGLREVLKHLKLKKLKCVII      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQSKGGLDDTLHTIIDYACEQNIPFVFALNRKALGRSLNKAVPVSVVGIFSYDGAQDQFHKMVELTVAARQAYKTMLENVQQELVGEPRPQAPPSLPTQG 800
gnomAD_SAV:    V       N  LA MG  #   M  #    HRT RC  S  F    L     H   H   EVLGP  V * VN  V#   *H Q R S  #V       C
Conservation:  5677999975643792264383695699956639866648298844685656345523743543752476248325423221112022120011010001
SS_PSIPRED:    H     HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE HHHHHHHH     EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHH    EEEEE HHHHHHH      EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEHHHHHHHHHH    EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                   D DDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50    
AA:            PSCPAEDGPPALKEKEEPHYIEIWKKHLEAYSGCTLELEESLEASTSQMMNLNL 854
gnomAD_SAV:      YL *G TQ       L     *Q  V   G R    D CW   A   R S #
Conservation:  200100000101211223141228321531221111204113121222001110
SS_PSIPRED:                      HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHHHHH      HHH   H          
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD DD                        DD D DDDDD DD