Q99259  DCE1_HUMAN

Gene name: GAD1   Description: Glutamate decarboxylase 1

Length: 594    GTS: 9.793e-07   GTS percentile: 0.214     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 218      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEKSRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFA 100
PathogenicSAV:            C                                                                                        
BenignSAV:                               K                                                                         
gnomAD_SAV:     E L   # S T  V VE SI    SSKHN   S T       RIR S#L    S  GD  HPA   R W    H P   K NQN HLQH          
Conservation:  2222222222222222222222222222222222222224122301101000001000000000000200000100001000000010000002330222
SS_PSIPRED:                                HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH    HHHHHHH HHH                 HHH       HHHH H
SS_SPIDER3:                                HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH     HHHHHHH HH                 HHHHH      HHHHHH
SS_PSSPRED:                                 HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH              HHH       HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       D                                      
MODRES_P:                                                                                   S                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDLLPAKNGEEQTVQFLLEVVDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQLSTGLDIIGL 200
gnomAD_SAV:       F    D  E M      AN   SF #  S CP      N     P  T      V   S            I     H    L     P        
Conservation:  2777940253105118633442564265133343368767785754744856143425222724754682373346565435577355556537643574
SS_PSIPRED:    H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH        HHHH      HHHH
SS_SPIDER3:    HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHH               HHHHHHHHHHHHHH       HHH        HHHH
SS_PSSPRED:    H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                                                 QLS        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA 300
BenignSAV:                                L                                                                        
gnomAD_SAV:        V  M    T  H   T      KL  E  G TA  P     EV      M  I*G V  CC     INSN VV  L   FLI          V T 
Conservation:  5445543368354556555668446623255862336681112576574697457756544476541672472375223814445563346553463243
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH         EE   HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH       EEEEE    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EE   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHH        EEEEE     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH      EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH       EEEEEE   HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVT 400
gnomAD_SAV:       A H    L R  K   TL  C    I  RERV      S    M         R   VT   *      N S      V   YH   Y V   S   
Conservation:  6736334642435424543533474135214413512845626658576586577502554571232485777767775553622511651743562958
SS_PSIPRED:           EEEEEE       HHHHHHHHHHHHH     EEEEE            HHHHHHHHHH   EEEEE      HH  HHHHHH   HHH  EEE
SS_SPIDER3:        HHHEEEEEE     E HHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE           HHHHHHHHHH   EEEEEEE    E     HHHH        EEE
SS_PSSPRED:    H      EEEE         HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE            HHHHHHHHHHH  EEEEE      EE   HHHHHH        EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WNPHKMMGVLLQCSAILVKEKGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAKIKNREEF 500
PathogenicSAV:                                                                    G                                
BenignSAV:                      I                                                       G                          
gnomAD_SAV:      L   # M      V F # D    G  # T *            N E   T     M                L   T  Y  V           K  
Conservation:  8878656545985544643335572269342518886399396417888854586868694967888857674099504764365551675126317147
SS_PSIPRED:    E HHHH       EEEEE    HHHHHH                                HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E
SS_SPIDER3:    E         EEEEEEEE  HHHHHHH    H               HH HHHH   H  HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E
SS_PSSPRED:    E       HHHHHHHHHE  HHHHHHHHH                             HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90    
AA:            EMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL 594
BenignSAV:                                    Q                         S      L                             
gnomAD_SAV:    G   # KT  KDLFV          #ENL #Q     M      V I L MI A   A R  VS  W# F    T    T      L       
Conservation:  4773333964678898749334303322044013723546166326431523745698242547887574773541126465643463355125
SS_PSIPRED:    EE       EEEEEEEE  HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE         EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EEEE     EEEEEEEE  HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE       EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    EEEE      EEEEE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE        EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                
DO_SPOTD:                                                                                                    
DO_IUPRED2A:                               DDD D                                                             
BINDING:                                                                         R