Q99707  METH_HUMAN

Gene name: MTR   Description: Methionine synthase

Length: 1265    GTS: 1.575e-06   GTS percentile: 0.480     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 537      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSPALQDLSQPEGLKKTLRDEINAILQKRIMVLDGGMGTMIQREKLNEEHFRGQEFKDHARPLKGNNDILSITQPDVIYQIHKEYLLAGADIIETNTFSS 100
BenignSAV:                                                        Q        K                                       
gnomAD_SAV:    K #TI  VL         QEK # F        E  T   L L#N  K # QVH  Q  S S  DSS   G#S LN     R  F  V  # VQID   G
Conservation:  7222222222201000111034224432575558866986663204182156512432322372664655448451573158345523888555665664
SS_PSIPRED:      HHHHH          HHHHHHHHHHHH EEEE  HHHHHHH    HHHH  HHH            HHH   HHHHHHHHHHHHHH   EEE      
SS_SPIDER3:      HHH            HHHHHHHHH H EEEEE HHHHHHHH    HHH   HHH             HH   HHHHHHHHHHHHH    EEEE     
SS_PSSPRED:        HHH         HHHHHHHHHHHHHHEEEE  HHH              HHH           EEEE   HHHHHHHHHHHHHH   EEEE     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD DDDDD                              DD  DD DDDDDDDDD       D                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSIAQADYGLEHLAYRMNMCSAGVARKAAEEVTLQTGIKRFVAGALGPTNKTLSVSPSVERPDYRNITFDELVEAYQEQAKGLLDGGVDILLIETIFDTA 200
gnomAD_SAV:    # T  V  SFQ FVC#L VY V   G   K IS R       VWT  L      M      L CKS  SY        #  E  VDRF  V M  V    
Conservation:  5044657725423551562166056646522330246055696954797767466974764746967376475469068317745945753657767856
SS_PSIPRED:     HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   EEEEEEE                      HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE E      EE E             HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     H
SS_PSSPRED:     HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE  EE                      HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                    DD DDDDDDDDDD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                       D  DDD                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NAKAALFALQNLFEEKYAPRPIFISGTIVDKSGRTLSGQTGEGFVISVSHGEPLCIGLNCALGAAEMRPFIEIIGKCTTAYVLCYPNAGLPNTFGDYDET 300
BenignSAV:                                                           Y                                             
gnomAD_SAV:    K N V LV #S #  #  SWAVL#   VI        R  V      L Y GL #         P   AS   T  GAI CDF   S    S       M
Conservation:  6567654632146320413275346554442434354664334843644722565576786797054664453363231436445867568635525683
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEE          HHHHHHHHH     EEEEE     HHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEE     E     HHHHHHHHH    EEEEE     HHHHHHHHHHHHH   EEEEE                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE             HHHHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH  EEEEE                
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                    C                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PSMMAKHLKDFAMDGLVNIVGGCCGSTPDHIREIAEAVKNCKPRVPPATAFEGHMLLSGLEPFRIGPYTNFVNIGERCNVAGSRKFAKLIMAGNYEEALC 400
BenignSAV:                  N                                                                                      
gnomAD_SAV:    A L  N      VN  DS#GR  R     RT  V   M KY ATIAS  V  A TS      L VR       T  C  AT    L T     SC     
Conservation:  8226502461450375463568776557265536232520329534211231125366997562553456767799979969956765674342654452
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHHHHHHHHHHH               EEEE    EEE       EE         HHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH   EEEEE  E   HHHHHHHHHHH                EEE   E EE       EE  H H     HHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHH     EE     EEEE      HH HHHHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                               CC                                                                            
REGION:                                                                                         GSR                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAKVQVEMGAQVLDVNMDDGMLDGPSAMTRFCNLIASEPDIAKVPLCIDSSNFAVIEAGLKCCQGKCIVNSISLKEGEDDFLEKARKIKKYGAAMVVMAF 500
PathogenicSAV:          P                                                                                          
BenignSAV:                                                                                                   I     
gnomAD_SAV:       L   V  P    S   V     G    V S   Y S  EE      #            R RE L   V     V   S TVG  R C V V  I  
Conservation:  5441664487976969796976452043225643423594665796777664636556777946974658648675961475166016426957356566
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    EEEEE   HH  HHHHHHHHHHHHH   HHH   EEEE   HHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHHHHHHH  EEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   EEEEEE        HHHHHHHHHHH     HH   EEEE   HHHHHHHHHH     EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH   EEEEE        HHHHHHHHHHHH         EEEE   HHHHHHHHHHH   EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                       D                    N                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEEGQATETDTKIRVCTRAYHLLVKKLGFNPNDIIFDPNILTIGTGMEEHNLYAINFIHATKVIKETLPGARISGGLSNLSFSFRGMEAIREAMHGVFLY 600
gnomAD_SAV:      K     AGR  S YPWT #   N      DE  L      T     D D H V I             T T       F  #*        V      
Conservation:  5616687522093169298908941340645368999997776799679960885477095306833665657698799699799967458686955896
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH     HHH      HHH HHHHHHHHHHHHHHHH    EEE       EE    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH       HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE  E   EEH    HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE    EE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE              HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                           D                                         N     R     R         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HAIKSGMDMGIVNAGNLPVYDDIHKELLQLCEDLIWNKDPEATEKLLRYAQTQGTGGKKVIQTDEWRNGPVEERLEYALVKGIEKHIIEDTEEARLNQKK 700
gnomAD_SAV:    R  N       A   S  L G  PR   #   YFLR           H    H I  R#IT  GKCT  #IK C   S    F  RV G I G  F  E 
Conservation:  4885165785977773735765643374046564666530256658503452112244312445499012554796769687653573497597612011
SS_PSIPRED:    HHHH               HHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH           HHH   HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH   EEEEEE  H  HHHH  HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH           H HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHH    EEE          HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                        DDDD DDDD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                 DDD          DDDDD                             D      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YPRPLNIIEGPLMNGMKIVGDLFGAGKMFLPQVIKSARVMKKAVGHLIPFMEKEREETRVLNGTVEEEDPYQGTIVLATVKGDVHDIGKNIVGVVLGCNN 800
gnomAD_SAV:    NTQ  SVV               R  R          # V RG D P L   E    A#L  DKA Q  L R I  V  IE N        A A      
Conservation:  5286737996999599549979974797999996999999957954749679267232310030024043427474676667777796566655662764
SS_PSIPRED:         EE            HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEEEEE            EEEEE    
SS_SPIDER3:        HHH       HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH H              EEEEEEEE         EEEEEEEE  
SS_PSSPRED:          EE         E HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH            EEEEEEEE  EE   HHHEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDD                                 
DO_SPOTD:                                                                DDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:                                                             DDDDDDD                                   
METAL:                                                                                             H               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FRVIDLGVMTPCDKILKAALDHKADIIGLSGLITPSLDEMIFVAKEMERLAIRIPLLIGGATTSKTHTAVKIAPRYSAPVIHVLDASKSVVVCSQLLDEN 900
PathogenicSAV:                            S                                                                        
gnomAD_SAV:    LQ T F I I     P  #   #T T        A  N     VR      V V        A    AT    LT   SI  IP # RR   YF V   S
Conservation:  6567668995455297439311579579999797779699546959757423259779999999649977795926346766747778692754398441
SS_PSIPRED:    EEEEE   EEEHHHHHHHHHH    EEEE       HHHHHHHHHHHHH      EEEE           EE       EEEE  HHHHHHHHHHH   H
SS_SPIDER3:     EEEEE EEE HHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHHHHHH      EEE        EEEEEE       EEEE  HHHHHHHHHHH  HH
SS_PSSPRED:     EEEEEE    HHHHHHHHHHH   EEEE       HHHHHHHHHHHHHH    EEEE  HHHHHHHHHHE        EEEE    HHHHHHHHH   H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                    S                                                                      
REGION:                                                                   GA                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKDEYFEEIMEEYEDIRQDHYESLKERRYLPLSQARKSGFQMDWLSEPHPVKPTFIGTQVFEDYDLQKLVDYIDWKPFFDVWQLRGKYPNRGFPKIFNDK 1000
PathogenicSAV:                    D                                                                                
BenignSAV:                       G                   R                                                             
gnomAD_SAV:      GK    VVV  A V  G#   V *    S    K IR LV  P      R M T  H    #  RE  NC  #     #   W   RS*   E LSH#
Conservation:  1434633640469634923554454342344602771244117702021832924383445204560171176994789448494847988579567193
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH    HHHHHHH                   EEEE    HHHHHH     HHHHHHH            HH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EHHHHHH                    EEEE   EHHHHHH    HHHHHH    E        HH   H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH                   EEEE    HHHHHHH        EE                  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                                D                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVGGEARKVYDDAHNMLNTLISQKKLRARGVVGFWPAQSIQDDIHLYAEAAVPQAAEPIATFYGLRQQAEKDSASTEPYYCLSDFIAPLHSGIRDYLGLF 1100
gnomAD_SAV:    S     MN# YE  S  K   N E FW QA I     RIV    YQ V    L  S*SM ALC    * K  P  M  S  F  # #S R   H      
Conservation:  4891272465267305710441121525264366446440188715510210011214233323576732831332343165587654122230854528
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE EEEEEEE      EEEEE            EEEE                  HHHH          EEEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEEE       EEEEE           EEEEE E                 H            EEEEE
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE        EEEEE          EEEEE                 HHHHH          HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVACFGVEELSKAYEDDGDDYSSIMVKALGDRLAEAFAEELHERVRRELWAYCGSEQLDVADLRRLRYKGIRPAPGYPSQPDHTEKLTMWRLADIEQSTG 1200
PathogenicSAV:                                                                         L                           
BenignSAV:                 T                                                  H                              V     
gnomAD_SAV:    SIV    G    TSDN   N     I V   QP  P   K Y G C*Q CSCYSG    I   H MW     L #      N        * S V  C S
Conservation:  3552484523311421205453366365668844655462552445343764001608111343212809657566665574645512462542421065
SS_PSIPRED:    EHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH                   HHHHHHHH   HHHH 
SS_SPIDER3:    EEEE  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH                 HHHHHHHHHH    HHH 
SS_PSSPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH                 HHHHHHHHH  HHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                             DD DD                     
BINDING:                                                                              R   G                        

                       10        20        30        40        50        60     
AA:            IRLTESLAMAPASAVSGLYFSNLKSKYFAVGKISKDQVEDYALRKNISVAEVEKWLGPILGYDTD 1265
BenignSAV:                          S                                           
gnomAD_SAV:     S  G*  V       V   #S  CTF  L    R          SVP T      V V      
Conservation:  20585745418234657545432151683555422463265407622121434566364534312
SS_PSIPRED:     EE         HH  EEEEE             HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:      EE         HEEEEEE      EE      HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:      HHH HH   HHHHHHHHH              HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                  D
DO_SPOTD:                                                                     DD
DO_IUPRED2A:                                                                    
REGION:                                  YF                                     
MODRES_P:                                                                     T