Q99708  CTIP_HUMAN

Gene name: RBBP8   Description: DNA endonuclease RBBP8

Length: 897    GTS: 1.015e-06   GTS percentile: 0.231     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 470      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNISGSSCGSPNSADTSSDFKDLWTKLKECHDREVQGLQVKVTKLKQERILDAQRLEEFFTKNQQLREQQKVLHETIKVLEDRLRAGLCDRCAVTEEHMR 100
PathogenicSAV:                                                                                                    W
gnomAD_SAV:       LE      D VEA  N  A  I           #      N  * Q   T    * V  K  QK L  I Y     #  QS     G#R A   RRG
Conservation:  9213212222133340114724430244326323443632762376244357746845764578597833527563422775685345754934255225
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH HHHHH
SS_SPIDER3:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH  HHHHH
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD      D                                                                                 
REGION:                             DLWTKLKECHDREVQGLQVKVTKL                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKQQEFENIRQQNLKLITELMNERNTLQEENKKLSEQLQQKIENDQQHQAAELECEEDVIPDSPITAFSFSGVNRLRRKENPHVRYIEQTHTKLEHSVCA 200
gnomAD_SAV:        Q  Y WKR    #ADF  *         N       TV     RP   V S  VI  A LV  VP   I QPQ   Y  ALHR   Y    Y MY 
Conservation:  4142859433746415625622764174769466025542220111011212151442396468312262522766775221654727121111102132
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH  HHHH         HHH      HHH         HHHH    HH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH                      H H         EEH             
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                    
DO_DISOPRED3:                                      DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     DDDD             DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDD    DDDDDDDDDDDDDDD D DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NEMRKVSKSSTHPQHNPNENEILVADTYDQSQSPMAKAHGTSSYTPDKSSFNLATVVAETLGLGVQEESETQGPMSPLGDELYHCLEGNHKKQPFEESTR 300
BenignSAV:                                                  A                                                      
gnomAD_SAV:    Y   EA    S    #     T L E *   R LIT V    GC AG TCLS V   S #      G   I   #     DF  Y     E  A  K AG
Conservation:  2110200202201001112124654568122022112212232331122012112575894321111210100112521123210113315322103001
SS_PSIPRED:    HHHHH               EEEEE                            HHHHHHHH                  HHHH            HHH  
SS_SPIDER3:     HHHH                EEEEE         H                HHHHHHHHH                                       
SS_PSSPRED:    HHHHH                EE                               HHHHHHH                                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD      D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                      S                                          S                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NTEDSLRFSDSTSKTPPQEELPTRVSSPVFGATSSIKSGLDLNTSLSPSLLQPGKKKHLKTLPFSNTCISRLEKTRSKSEDSALFTHHSLGSEVNKIIIQ 400
PathogenicSAV:                                     E                                                               
BenignSAV:                                                             N                             Y             
gnomAD_SAV:     A N  KL   A  PS E   RIQ    I A  #  E#    S      V R RE N V  F     S   *  AIP     T  PY     QA   M  
Conservation:  1112124443212121100111110144222132112022121110344442111211342022232303421102113332211211123211124334
SS_PSIPRED:                                                                                 HHHHHHHHH       HHHHEE 
SS_SPIDER3:                                                                                   H   HEE        HHEE E
SS_PSSPRED:                                                                                                 HHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDD           DDDD     DDDDDDDDD       DD    
MODRES_P:                    T          SS                     S                             S                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSNKQILINKNISESLGEQNRTEYGKDSNTDKHLEPLKSLGGRTSKRKKTEEESEHEVSCPQASFDKENAFPFPMDNQFSMNGDCVMDKPLDLSDRFSAI 500
BenignSAV:                  D                                                                                      
gnomAD_SAV:     YS   FR   V *T      S  S G  I      # L   Q  * Q  K  IGRK GYS    GR       VASK  T   SMI  RVYP N#  GV
Conservation:  3213523222333422122131111222123212113522424026331031102011233425537762254112112013441127579987654321
SS_PSIPRED:       HHEEEE                                        HHHH                                       HHH     
SS_SPIDER3:         EEE                                         HHHHH                                           H  
SS_PSSPRED:        HHHHH                                                                                           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD  DDDD     D D DDD         DDDDD
MOTIF:                                                                                                  PLDLS      
MODRES_A:                                     K                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QRQEKSQGSETSKNKFRQVTLYEALKTIPKGFSSSRKASDGNCTLPKDSPGEPCSQECIILQPLNKCSPDNKPSLQIKEENAVFKIPLRPRESLETENVL 600
BenignSAV:                                                                                             H           
gnomAD_SAV:     HE  NHAN I E  #WR SVHG     A  S *RC   #D   F R  R D   H R        SF     P     V T   V#PH L   # KY  
Conservation:  3113221213112031331111323220111110001011111001220142343741121332130011010121121113252123231111322233
SS_PSIPRED:      HHHH     HHHHH    HHHHH                              HHHHH                                      HH
SS_SPIDER3:        H            EH HHHH            E     E             HEEEE                                      H
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHH                             HHHHH                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD              D   DDDDDDDDDDDDD                     DDDD    DDDDDD    DD     DDDDDD
MODRES_A:                               K                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDIKSAGSHEPIKIQTRSDHGGCELASVLQLNPCRTGKIKSLQNNQDVSFENIQWSIDPGADLSQYKMDVTVIDTKDGSQSKLGGETVDMDCTLVSETVL 700
gnomAD_SAV:     #V#R R    V TKNK  #     V FF  S #ISD # YPP   GIF   TH G  LE    H   V     AQY #PP #   A  L G  A    P
Conservation:  2434212123301210201111232224435332211301111233310124138546754244262241111222011203111422737374554636
SS_PSIPRED:    HHHH                              HH   HHH            HH      HHHH   EEEE                    EE HHHH
SS_SPIDER3:    HH           EE           HH                                   HH     E               EE     E    HH
SS_PSSPRED:                                                                                                  E   HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD DDDDDDDDDDDDDD                       D                         DDDDD DDDDDDDDDDDDDDD            
MODRES_P:                                                                     S              S                     
MODRES_A:         K                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKMKKQEQKGEKSSNEERKMNDSLEDMFDRTTHEEYESCLADSFSQAADEEEELSTATKKLHTHGDKQDKVKQKAFVEPYFKGDERETSLQNFPHIEVVR 800
gnomAD_SAV:         H    Q    D S  SG F V# G# IPG N  YSTGC F   #K#QKF      VYA#            G L  RDNK  I   S# PT  FW
Conservation:  2312111011101221403124553258535227461842011101012222111110110100021101110111133333211312101274433454
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH      HHHHHH   HHHH     HHHHHHHH         HHHHH HHHHHHHH      HH   HH  HHH   HHHH       EE   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH        H      HHH H     HHHH HH      HH HHHHH HH HHHH         H H    H               E E   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH               HHHH     HHHHHHH         HHHH               HHHHHHHH         HHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDD   D  DDDDDDDDDDDDDDDDD DD                 DD   DDDDDD   
MODRES_P:                            S                     S                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKEERRKLLGHTCKECEIYYADMPAEEREKKLASCSRHRFRYIPPNTPENFWEVGFPSTQTCMERGYIKEDLDPCPRPKRRQPYNAIFSPKGKEQKT 897
gnomAD_SAV:        G   # YSF K   F  VT V DK N  #C * YQLH  AR #TG   *FC   #HN V  D    EV A  #AR H  NKSV   NV  H I
Conservation:  5725554625334557433544373465135542478844434862486688556884663623644565200402425533532235323111120
SS_PSIPRED:     HHHHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    EE                   HHHHHH                   HH           
SS_SPIDER3:     HHHHHH     HHHHHHHH    HHHHHHHHHH     E           E        HHHHH   H                            
SS_PSSPRED:     HHHHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH                         HHHH                                
DO_DISOPRED3:                                                                 DDDDDBBBBBBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D                             D                      D                  DDD    D  DDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                FRY                                                       
MODRES_P:                                                    T