Q9BQI6  SLF1_HUMAN

Gene name: SLF1   Description: SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1

Length: 1058    GTS: 1.129e-06   GTS percentile: 0.281     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 450      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEDGTPKHIIQMTGFKMEEKEALVKLLLKLDCTFIKSEKYKNCTHLIAERLCKSEKFLAACAAGKWILTKDYIIHSAKSGRWLDETTYEWGYKIEKDSRY 100
gnomAD_SAV:    V  D LM        ETG   V I   V      S*     #F L V  C   N      S     T     VSN  E          K*      HFH 
Conservation:  4210104245946856115721622261382524333438323796632324268945846757897655377449533549838227999324221312
SS_PSIPRED:           EEEEE    HHHHHHHHHHHHH   EE   HH     EEEE      HHHHHHHH   EEEEHHHHHHHHHH                     
SS_SPIDER3:           EEEEE    HHHHHHHHHHHHH   EE E HH    EEEEE      HHHHHHHH    EE HHHHHHHHH                      
SS_PSSPRED:           EEEEE    HHHHHHHHHHHHHH  EEEE        EEEE   HH HHHHHHHHH  EEE HHHHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                                                               
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPQMQSAPKRWREELKRTGAPGAFHRWKVVLLVRTDKRSDSLIRVLEAGKANVILPKSSPSGITHVIASNARIKAEKEKDNFKAPFYPIQYLGDFLLEKE 200
gnomAD_SAV:              RH G QHS D     K     FFS  R#    #* F P    L  R        R  T  VG           P L  V   E     EQ
Conservation:  7433236363784562241228784384736141212322242758187382521102210268764212211111111001123355325442576423
SS_PSIPRED:     HHH HHHHHHHHHHHHH         EEEEEE     HHHHHHHHHH   EEE          EEEEE     HHHHHH        HHHHHHHH    
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEE     HHHHHHHHHH   EEE         EEEEE      HHHHH         HHHHHHHH    
SS_PSSPRED:     HHH H HHHHHHHHHHH        EEEEEEE     HHHHHHHHHH   EEE          EEEEE      HHHHHH       HHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:             DDD                                                    D   D                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQNDEDSQTNSVWTEHSNEETNKDFRKDAGFLEMKGALRETMYRTQKEMQNHEDVNVGSILIQHHKKEKFSGSSKDLKFVKMRNTFGSHTYENQKEIKKK 300
BenignSAV:                                                                                            R            
gnomAD_SAV:    T D KG H S IGI RN          VT L   R#GV   I   R     R     A VW         T  R  W    R  N  R A        N 
Conservation:  3231101222000121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:        HH                  HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH    HHHHHHH           HHHHHHHHHH        HHHH  
SS_SPIDER3:                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH           HHHHHHHHHH        HHH E 
SS_PSSPRED:                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H HH           HHHHHHHHH         HHH   
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                          D    DDDDDDDDDD                         
DO_SPOTD:        DDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DDDDDDDDDDDDDDD   DDDD              DDDDDDDDDD DDDDDDDDD    D       D               DDDDDDDDDD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEDIQRSYTLRRKRKKGKESNCKKGVEHEKIKSTLRRHIYNRDQKEMKNSIFAEYAKESKAMAIKTDVDVVEIKNTLRKHIYRAQAVRYNCIRIDKQPVY 400
gnomAD_SAV:      VT    PWG  H N  Q  F   I L*   R  G        T         NS   E V#VQ   NIA      KN MH     *   LG  E    
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111100002012124511532442112222311202212012
SS_PSIPRED:           HHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EE      
SS_SPIDER3:        E  EE                      HHHHHHHHH    H H   HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE       
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDD                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NVEVKNAEFPRGVLNLIESLIEGHFFKEAIEELSTLQAHYIPPVCVLHALLENVLQDNIDTFSGRYFHILSALLHLHPPWKSPAMSRYYLELFQCPTCMK 500
gnomAD_SAV:    #I     VLS    H  G FL  R     M     FRGR     RI R VV KI    #N    Q  P  *TV   R S  P # LS   #FL#R A   
Conservation:  1032121102211212322536426515542551122221286313532563336343221312141135215612496723311337722579981842
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:      E       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   H H  
SS_PSSPRED:      EE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GAWSLVEVLIRSCLFNESFCHQISENIGSKVLHLTLLKFFFNLIESEVQHLSQKLYDWSDSQNLKITGKAMLLEIFWSGSETSGLLTKPVNMLLEWTIYS 600
gnomAD_SAV:          Q  V   V S          #    F  M  TV L      E   N   C  AN   VN    TL   F     #A   VS    T    AVC 
Conservation:  9273646434536522202981243212131531156262325331852233133132112112101313442247721343425363252282354324
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH    HHHHH     HHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEEEEE       HHH HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDD                                 
DO_SPOTD:                                                                DDDDD                                     
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HKEKFKSNDVFKHELAYLLAGILGAAIDYWIFLGLKMGRNVMRHMSDDLGSYVSLSCDDFSSQELEIFICSFSSSWLQMFVAEAVFKKLCLQSSGSVSSE 700
gnomAD_SAV:     Q  LMT EL N   S   GR     VES  L  V   G   Q   AN RG    W     AE     VFFS  C  E  A  V L     RG AI A G
Conservation:  2120022232310343047124855466683333313622431232255316425253433112421551242725846225654652232322112213
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHEEE     HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHE E      HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH EEEEE     HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLSLQKMVYSYLPALGKTGVLGSGKIQVSKKIGQRPCFDSQRTLLMLNGTKQKQVEGLPELLDLNLAKCSSSLKKLKKKSEGELSCSKENCPSVVKKMNF 800
BenignSAV:                    R                                                                                    
gnomAD_SAV:        R I H      RN SM AFE TR  N T E##  G  K  P  #  EE    #  K  # # V     F* W       F Y   K #F   E#  
Conservation:  5567345313952473132112232121232112231223452312224135443334433413221414232210112131211023331113202123
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHH             HH          HHHHHH     HHHHH  HHHHH         HHHH HHHHH                  
SS_SPIDER3:       HHHHHHH E                            H HHHH     HHHH H  HHH          HHH                         
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHH                                    HHHHHHH               HHHHH                       
DO_DISOPRED3:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
DO_SPOTD:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HKTNLKGETALHRACINNQVEKLILLLSLPGIDINVKDNAGWTPLHEACNYGNTVCVQEILQRCPEVDLLTQVDGVTPLHDALSNGHVEIGKLLLQHGGP 900
gnomAD_SAV:     R #   G        S HAK   I    T*VNFSG#G#  #R FLA G C   LY   V  L#  L  PA         NT   R  AT RVV   R L
Conservation:  2539268643672483355643530562254465735956999896866559734882466333825251346394769587835473477459844685
SS_PSIPRED:             HHHHHHH   HHHHHHHHH                HHHHHH  HHHHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:             HHHHHHH   HHHHHHHH               HHHHHHHH   HHHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:             HHHHHHHH  HHHHHHHHH                HHHHHHH  HHHHHHHHHH               HHHHHH   HHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLLQQRNAKGELPLDYVVSPQIKEELFAITKIEDTVENFHAQAEKHFHYQQLEFGSFLLSRMLLNFCSIFDLSSEFILASKGLTHLNELLMACKSHKETT 1000
gnomAD_SAV:       RR    R    YC    E  GQM  V  VKV M  C# E#   C   H  L T   I    S F V Y   QI V          RFITYE    A 
Conservation:  2753426106237763412112635731231233212210113221231322632316522543451122354101101111121121122200112112
SS_PSIPRED:      EEEE      HHHH   HHHHHHHH            HHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH   EE 
SS_SPIDER3:      EEEE     E HHH   HHHHHHHH         HHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHH       EE       HHHHHHH     E  
SS_PSSPRED:     EEEE              HHHHHHHHH          HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D                             D              
DO_SPOTD:                                       DDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        
AA:            SVHTDWLLDLYAGNIKTLQKLPHILKELPENLKVCPGVHTEALMITLEMMCRSVMEFS 1058
gnomAD_SAV:       I  F# F#VA T A   F   R     SM*AYA IY    IVA Q VYW    S 
Conservation:  1112423331513533542243122124211300215133128321642410110011
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH   HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                           D
DO_SPOTD:                                                                
DO_IUPRED2A: