Q9BTX1  NDC1_HUMAN

Gene name: NDC1   Description: Nucleoporin NDC1

Length: 674    GTS: 1.467e-06   GTS percentile: 0.432     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 295      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATAVSRPCAGRSRDILWRVLGWRIVASIVWSVLFLPICTTVFIIFSRIDLFHPIQWLSDSFSDLYSSYVIFYFLLLSVVIIIISIFNVEFYAVVPSIPC 100
BenignSAV:                                               L                                                         
gnomAD_SAV:    LT VM  # VCKP H M  IW R T          P N A  L#  R # F L#VRR C  L   D     S  V    I   R   S   CVA L  R 
Conservation:  0210000100100232222641884324326664768223345534322334363132334211513522453345433423323353254543393546
STMI:                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H H HHHHHHHH  HH    HHHH HHHHH  HHHHHHHHHHEE       
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD                                                   D  D                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRLALIGKIIHPQQLMHSFIHAAMGMVMAWCAAVITQGQYSFLVVPCTGTNSFGSPAAQTCLNEYHLFFLLTGAFMGYSYSLLYFVNNMNYLPFPIIQQY 200
BenignSAV:                                                          D                                              
gnomAD_SAV:     TI  M  N       RL     R VM#  YTS T K  HR  L    DP   DRA T  S    L L I A P I   CNF    DS DC   RM   C
Conservation:  6744746234694632452363258434386343224145114203610123022101015468133326528452855654245436446538234785
STMI:                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHH 
SS_SPIDER3:     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KFLRFRRSLLLLVKHSCVESLFLVRNFCILYYFLGYIPKAWISTAMNLHIDEQVHRPLDTVSGLLNLSLLYHVWLCGVFLLTTWYVSWILFKIYATEAHV 300
gnomAD_SAV:       H        G Y        I       F  DCV  GR  I R     D FR LF  AGD    L F Y    D   #M  CA RL L  C S VL 
Conservation:  9442664262153426324644238652328564932761531234251041212216842366564485742633526662494335369684379240
STMI:                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH    E              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FPVQPPFAEGSDECLPKVLNSNPPPIIKYLALQDLMLLSQYSPSRRQEVFSLSQPGGHPHNWTAISRECLNLLNGMTQKLILYQEAAATNGRVSSSYPVE 400
gnomAD_SAV:      I L   QR   Y      RSLSHT       E #  P    PQ RAFL H#P  E   S  #      S S S     VVH  V  #   L     AV
Conservation:  9874439244312695366222131437567697724765463167266969779987764736653596275337526931377346399820231211
SS_PSIPRED:                  HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:                  HHHH      HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:                 HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH       H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                             DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                   DDD D                                       DDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKKLNSPEETAFQTPKSSQMPRPSVPPLVKTSLFSSKLSTPDVVSPFGTPFGSSVMNRMAGIFDVNTCYGSPQSPQLIRRGPRLWTSASDQQMTEFSNPS 500
gnomAD_SAV:         Y   A       IRTRQ   SL  N  R     PA H M             QI RS YL   CRLQ    PVKKV     L  GK T D    P
Conservation:  0012121340242531110124321234264221222133223232225662442222112124103324334563338735699731451302321004
SS_PSIPRED:           HH                                            HHHHHH               HHHHH          HHHHH      
SS_SPIDER3:                                                         HHHHHH               HHH          HHHHHH       
SS_PSSPRED:                                                          HHHHH               HHHH          HHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D  DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D                                                DDDDDD   DDDDDDDDDDDD
MODRES_P:           S       T                        ST    S   T                     S  S                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PSTSISAEGKTMRQPSVIYSWIQNKREQIKNFLSKRVLIMYFFSKHPEASIQAVFSDAQMHIWALEGLSHLVAASFTEDRFGVVQTTLPAILNTLLTLQE 600
gnomAD_SAV:      P L V   IK K        RS C    H    Q   IFL         RG           F    R     L  G      M  S V   S     
Conservation:  2011011001100362132174547359461875655654779365665555247543626486633894766566488256566546536623442976
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        E     EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H  HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD D                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70    
AA:            AVDKYFKLPHASSKPPRISGSLVDTSYKTLRFAFRASLKTAIYRITTTFGEHLNAVQASAEHQKRLQQFLEFKE 674
gnomAD_SAV:     I   L       E  W  R  LG  * I   T TV   AV CG  S         E F   KEI  P   L  
Conservation:  65776899885865524222243624456799568758785487663697279456234255544552443352
SS_PSIPRED:    HHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHH                  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDD                                                 
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDD                                                   D
DO_IUPRED2A: