Q9BY10  TSCOT_HUMAN

Gene name: SLC46A2   Description: Thymic stromal cotransporter homolog

Length: 475    GTS: 2.534e-06   GTS percentile: 0.815     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 295      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSPEVTCPRRGHLPRFHPRTWVEPVVASSQVAASLYDAGLLLVVKASYGTGGSSNHSASPSPRGALEDQQQRAISNFYIIYNLVVGLSPLLSAYGLGWLS 100
gnomAD_SAV:    #IT A YLQ  P LHS    RD  MM PY MPT F  G  RP G VFH  R   S     WSPE#  G #* V  SL    KPM   F     *#   V 
Conservation:  8111112211210001022124455532345635656567444732331111112132121111013311734365855354441252753563174325
STMI:                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHEEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                       EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                        DD   DDDD                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                       DDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:   DD DD    D                                           DD DDDDDDDDDD                                  
CARBOHYD:                                                            N                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRYHRKISICMSLLGFLLSRLGLLLKVLLDWPVEVLYGAAALNGLFGGFSAFWSGVMALGSLGSSEGRRSVRLILIDLMLGLAGFCGSMASGHLFKQMAG 200
gnomAD_SAV:     C P*N    T      F LFRM   L  G  L  M*##V   R LCS  TLRA FTVP  PA CKS#H  # # TE V D   LY R   EN LRH# #
Conservation:  7212473362267294435622885243325843555544441773966466946645637426322298325314653592595289539966711201
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HSGQGLILTACSVSCASFALLYSLLVLKVPESVAKPSQELPAVDTVSGTVGTYRTLDPDQLDQQYAVGHPPSPGKAKPHKTTIALLFVGAIIYDLAVVGT 300
gnomAD_SAV:     Y  RVTMM Y L ST S  F R   # ISQP   R  #  S#N A DMA R*CAPN  #    C   # L  A    N I T#         YPVA  K
Conservation:  1112933832264234234434433473330212101100100010110001011111110010000000001111132302524662454383355284
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHH  EEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                E      EEEEEE  HHHHH HEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        EEE   HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                    DDDDDDDDDDDDDDD                                                   
DO_SPOTD:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     
DO_IUPRED2A:                                                                     DDD  D                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDVIPLFVLREPLGWNQVQVGYGMAAGYTIFITSFLGVLVFSRCFRDTTMIMIGMVSFGSGALLLAFVKETYMFYIARAVMLFALIPVTTIRSAMSKLIK 400
BenignSAV:                                                                      V                                  
gnomAD_SAV:     N#  V  P#DS      HM#  V SA #   N     P   CS Q SIT RT #I  A ET F VL R   # #  *VI    # SI   Q T  RPMT
Conservation:  3355237456289384322598648544347489756513655331734573595397239344748552824774883356865884588973596452
STMI:          MMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:      HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:      EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:      EEEEEE         EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70     
AA:            GSSYGKVFVILQLSLALTGVVTSTLYNKIYQLTMDMFVGSCFALSSFLSFLAIIPISIVAYKQVPLSPYGDIIEK 475
gnomAD_SAV:    SC   M LITR   FD ISMLIP  *  VS*  T IS      P   F   V   T  M C      T RGTT  
Conservation:  243663253196324233243443255258416422426347254323433434843223141010111111122
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE            
DO_DISOPRED3:                                                                     DDDDDDDB
DO_SPOTD:                                                                    DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: