Q9BZA8  PC11Y_HUMAN

Gene name: PCDH11Y   Description: Protocadherin-11 Y-linked

Length: 1340    GTS: 1.158e-06   GTS percentile: 0.293     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 240      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MFRVGFLIISSSSSLSPLLLVSVVRVNTTNCHKCLLSGTYIFAVLLVCVVFHSGAQEKNYTIREEIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTTTMQFKLVYK 100
gnomAD_SAV:        V                        K D        VY    A L         S     Q        H                  T   P *Q
Conservation:  3333333333333333333333333333433333321122252333331222315684353435624553455552566444311122242352565646
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                        
SS_PSIPRED:      EE  EEE      HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEEEHHHH                EEEEE 
SS_SPIDER3:                   HHHHHHHHHH      HHHH     HHHHHHHHHH H     EEEEE        EE  HHHH               EEEEEE 
SS_PSSPRED:     EEEEEEE        HHHHHEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EE HHHHHH             EEEEEEEE
DO_DISOPRED3:  BBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                N                    N     N              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TGDVPLIRIEEDTGEIFTTGARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDEIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISIPENSAINSKYTLPAAVDPDV 200
gnomAD_SAV:                   TY  S LV       R        C  D     N                N     #       V     L  I    V      
Conservation:  3762854552425645464326466534723211522636646656865538575646325464786666955565668898656586573554538683
SS_PSIPRED:          EEE     EEEE      HHHH          EEEEEEEE      EEEEEEEEEE             EEEEEE                   
SS_SPIDER3:         EEEEE     EEE   EE HHHH         EEEEEEEEE      EEEEEEEEEE            EEEEEE        EEE         
SS_PSSPRED:          EEEE    EEEE     HHHHHH        EEEEEEEEEE    EEEEEEEEEEEEE          EEEEEE                    
DO_DISOPRED3:                                                                   DDDD D                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELDREEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV 300
gnomAD_SAV:        D   Q            T                      N              P    T                   KT      D       
Conservation:  9175643526447633848676976896839889984199994796789869969991957998989975749499938792523376267966438599
SS_PSIPRED:        EEEEEE      EEEEEEE     EEEEEEE          EEEEEEEEEE       EEEEEEEEEE            EEEEE         EE
SS_SPIDER3:        EEEEEEE    EEEEEEEE     EEEEEEE          EEEEEEEEEE     E EEEEEEEEEE        E E EEEEEE        EE
SS_PSSPRED:         EEEEE      EEEEE          HHHH           EEEEEEEEE        EEEEEEEEEE           EEEEEE        EE
DO_DISOPRED3:                                                                             DDDD DDD                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                  DDDDD                              DDDD      DDD DDDDDDDD   DD   D D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVLASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTV 400
gnomAD_SAV:       Y   S  S       F                      S                  T                   S       #  VIS      
Conservation:  2683968594929936271773744215654927733686666642989623429762649799633766836378799799949389588955539778
SS_PSIPRED:    EEEEEE       EEEEEEEE    HHHHHHH       EEEE           EEEEEEEE       EEEEEEEEE       EEEEEEE       E
SS_SPIDER3:    EEEE         EEEEEEE     HHHHHHEEE     EEEE          EEEEEEEEE      EEEEEEEEEE       EEEEEE E      E
SS_PSSPRED:    EEEE         EEEEEEE  H HHHHHHHHHH      EEEE           EEEEEEE       EEEEEEEEEEE      EEEEEE       E
DO_DISOPRED3:                                                                                   D                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                     DDDDD      DD                                             
CARBOHYD:                                                                                 N                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLSENIPLNTKIALITVTDKDADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLLENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQSAMLFIKVKDENDNAPVFTQ 500
gnomAD_SAV:      *         T                  A  G  L        R          C   E  D      #P  L V      L R      S  I   
Conservation:  1889744369979978639595526757397662759869667756979798653997934448264748594949598476463565698999395934
SS_PSIPRED:    EE        EEEEEEEE        EEEEEE     EEEEE    EEEEEE          EEEEEEEEEE       EEEEEEEEEE           
SS_SPIDER3:    EE        EEEEEEEE        EEEEE      EEEEE    EEEEEE  E       E EEEEEEEE        EEEEEEEEE        E  
SS_PSSPRED:    EEE       EEEEEEE         EEEEEE       EEE    EEEEEE           EEEEEEEEE         EEEEEEEEEE         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SFVTVSIPENNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPDAPPEFSLDRRTGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP 600
gnomAD_SAV:    PVI           S       MN  I                    YHH C    M    T          V       S   #  IV      D S  
Conservation:  6153455289905433866659382947286462838415432292682579586735366992353716763748591336447546264759499948
SS_PSIPRED:     EEEEEEE       EEEEEEEE       EEEEEEE       EEE     EEEEEE      EEEEEEEEEEE         EEEEEEEEE       
SS_SPIDER3:     EEEEEEE       EEEEEEEE       EEEEEEE      EEEEE    EEEEEE  E    EEEEEEEEEEE     EE EEEEEEEEE       
SS_PSSPRED:     EEEEEEE        EEEEEE         EEEEE        EE       EEEEE   HHHHHHHHEEEEEEE        EEEEEEEEEE      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                  DDDDDDD         DDD D                                                                
CARBOHYD:                                                                                          N               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPNISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVND 700
gnomAD_SAV:        H *          R                  AM  V EK    NT               G  V *             H           Y   
Conservation:  2999377696859896357989799688293959336466643133293786049796795798993858869174829393243462568996859688
SS_PSIPRED:    EEE                EEEEEEEE       EEEEEEEE     EEE     EEEE EE  HH   EEEEEEEEEE      EEEEEEEEEEE    
SS_SPIDER3:    EEEE    EE         EEEEEEEE      EEEEEEEEE     EEEE    EEEEE E  H   EEEEEEEEEEE  E  EEEEEEEEEEEEE   
SS_PSSPRED:                        EEEEEEE        EEEEEEE      EEE     EE           EEEEEEEEEE       EEEEEEEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      D                 D   D          D                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NKPVFIVPPYNYSYELVLPSTNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGGNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHRVLVKANDLGQPDSLFSVVIV 800
gnomAD_SAV:         T         VG L    S   S    I SN    #  H  F  R  G     N     V  #   H        A          G    I   
Conservation:  9394552854927536742443655663282959274938745393533561649915521598866366311381897774746196949466442426
SS_PSIPRED:       EEE        EE         EEEEEEEEE      EEEEEEE        EEE     EEEEEEE  HH    EEEEEEEEE       EEEEEE
SS_SPIDER3:       EEEE     EEEEE       EEEEEEEEE      EEEEEEEEEE     EEEE     EEEEEEE      HE EEEEEEEE  EE   EEEEEE
SS_PSSPRED:                 EEEE       EEEEEEEEEE      EEEEEEE         EEE     EEEE EE        EEEEEEEE        EEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                              D                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLFVNESVTNATLINELVRKSIEAPVTPNTEIADVSSPTSDYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNMQNSEWATPNPENRQMIMMK 900
gnomAD_SAV:     P M       A      #  T ES   S        R R    V           I          YH         E T       S        IIE
Conservation:  5575947429262626654421435223342322121222664554494559545855455676649745264444466386549956976443723335
STMI:                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                   
SS_PSIPRED:    EEEEE     HHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH            HH HHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEE     HHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH                HHHHHH 
SS_PSSPRED:    EEEEE     HHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                               DDD D                                         D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:          N                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKKKKKKHSPKNLLLNVVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNWVTTPTTFKPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNLKHHIIQELPL 1000
BenignSAV:                     F                                                                                   
gnomAD_SAV:         NQ         F  V    G             P  E     I    *        S #  V #                         V     
Conservation:  5455453235556566576635362452223434456455356564343453734376999526989839957469866966577894359964886996
SS_PSIPRED:    H             EEEEE              EEEE                             HHHHH                     EEEEE   
SS_SPIDER3:    HH              EEEE               E E               E            HHHH         EE           EEEE    
SS_PSSPRED:                                                                    HHHHH                       HHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD                     D DDDDD   DD DD             DDD  DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DNTFVACDSISNCSSSSSDPYSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRPSQRRVTFHLPEGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTE 1100
BenignSAV:                K                                                                                        
gnomAD_SAV:    Y I   R    K    N     IA       N   S  I      QC I  MS R    G   E         A PT     R             K#A 
Conservation:  8999857555884664374568686665435468335445354233236436524535425424333141121223322443232464565234324555
SS_PSIPRED:       EE                                EE     EEEEEEE                                  HHH            
SS_SPIDER3:       EE                                         EEE                                    HHH            
SS_PSSPRED:       EE                                                                                               
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                          D          D DDD D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDGNSDPESTFIPGLKKEITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPASLDHSSSSQAQASALCHSPPLSQASTQHHSPPVTQTIVLCHSPPVTQTIAL 1200
gnomAD_SAV:                                             A T   SE       L   VCS    L    T      S    S         I   # 
Conservation:  4564555333333333333333132221222432344434435553353231122231213333333333333313331023123111102111133102
SS_PSIPRED:                            HHHHHHH HHHHHHH                              HHH            EEEE        EEEE
SS_SPIDER3:                            HHHHHHHHHHHHHH       E                                     E            EEEE
SS_PSSPRED:                            HHHHHHHH  HHHHH                                             EEEE        EEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDD             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CHSPPPIQVSALHHSPPLVQGTALHHSPPSAQASALCYSPPLAQAAAISHSSSLPQVIALHRSQAQSSVSLQQGWVQGANGLCSVDQGVQGSATSQFYTM 1300
gnomAD_SAV:    Y   TL           V   S       L E#           V       T  R VV  C           V  P   V       G        H  
Conservation:  0212212223333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333331002133321
SS_PSIPRED:    E                            HHHH  HH    HHHHHHHH     HHHHH                EE                HHHHEE 
SS_SPIDER3:    E                            HHHHH H     HHHHHHH       HHHHHH             EEE     E            HHEEE
SS_PSSPRED:                                 HHHHHHH    HHHHHHHHH      HHHHHH                                 HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDD  D       D D      
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_IUPRED2A:              DDDD  DDDDDDDDD                                DD          D              D         DDDDD

                       10        20        30        40
AA:            SERLHPSDDSIKVIPLTTFAPRQQARPSRGDSPIMETHPL 1340
BenignSAV:                        T                    
gnomAD_SAV:     K     G      S    V C               Y  
Conservation:  1333333333323223122011330121133331112100
SS_PSIPRED:    HH         EEEE     HHH                 
SS_SPIDER3:    HH        EEEEEEEE               H      
SS_PSSPRED:    HH        EEEEEE                        
DO_DISOPRED3:                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                            DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD