Q9BZI7  REN3B_HUMAN

Gene name: UPF3B   Description: Regulator of nonsense transcripts 3B

Length: 483    GTS: 3.475e-07   GTS percentile: 0.016     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 113      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKEEKEHRPKEKRVTLLTPAGATGSGGGTSGDSSKGEDKQDRNKEKKEALSKVVIRRLPPTLTKEQLQEHLQPMPEHDYFEFFSNDTSLYPHMYARAYIN 100
BenignSAV:                      I                                                                                  
gnomAD_SAV:         #Y L        I#  V   SD  L                  V       K   A   DR  KQ   IS           MN    V       
Conservation:  1101000112010000010011111111000000111111110011002001222433432534323222413241233222322315438635454545
SS_PSIPRED:                                               HHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHH       EEEEEE          EEEEEE
SS_SPIDER3:                                             HHHH H    EEEEEE      HHHHHHH      E EEEEE           EEEEEE
SS_PSSPRED:      HHHH                                    HHHHHH   EEEEE       HHHHHHHH       EEEEE           EEEEEE
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDD      D                      
REGION:                                                           KVVIRR                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FKNQEDIILFRDRFDGYVFLDNKGQEYPAIVEFAPFQKAAKKKTKKRDTKVGTIDDDPEYRKFLESYATDNEKMTSTPETLLEEIEAKNRELIAKKTTPL 200
PathogenicSAV:                                                            D                                        
gnomAD_SAV:       R           V I   #N      VI              R        N             A      F        V               
Conservation:  6423756348664866548453465663966767799944765377494638562493685389616315556214559499575666475316764589
SS_PSIPRED:    E  HHHHHHHHHHH  EEEE        EEEEE   HHH              HH  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH     EEE     EEE EEEE     HH H               HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH     HH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHH   EEE       EEEEEE   HHHHHH               HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                 DDDDD                        DDDDDDDDD               
DO_SPOTD:                                              DDDDDDDDDDDDD  DDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_IUPRED2A:                                            DDDDDDDDDDDD           DDDDDDD  DDDDDDDDD                  
MODRES_P:                                                                          T                            T  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSFLKNKQRMREEKREERRRREIERKRQREEERRKWKEEEKRKRKDIEKLKKIDRIPERDKLKDEPKIKVHRFLLQAVNQKNLLKKPEKGDEKELDKREK 300
BenignSAV:                                                           K                                             
gnomAD_SAV:                       K  V                  Q   ET     T K             T RK      S           #         
Conservation:  6456746876969776686598466763556656667767425754364144165111113154435381111111111111676925324301210433
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHH
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDDDD  DDDDDDDDDDD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKKLDKENLSDERASGQSCTLPKRSDSELKDEKPKRPEDESGRDYREREREYERDQERILRERERLKRQEEERRRQKERYEKEKTFKRKEEEMKKEKDTL 400
BenignSAV:                                                              #        N                                 
gnomAD_SAV:               G      S S RH   KFR ANL    GD S  H    WG  Q  KH# Q G G NW    HC PR H             T     I 
Conservation:  0310303002231011101011111011021011210021111113424111112241113334112114323453422151321154224512323200
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    HH                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH HHHHHHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH HHH   HHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH      HHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:               S                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80   
AA:            RDKGKKAESTESIGSSEKTEKKEEVVKRDRIRNKDRPAMQLYQPGARSRNRLCPPDDSTKSGDSAAERKQESGISHRKEGGEE 483
gnomAD_SAV:    W  V  VG   L  NL           T       P            Q      N G                R   G    
Conservation:  12323111010001111112211111223222332131333425411231111000110010001130000000110111100
SS_PSIPRED:    HHH                   HHHHHHHHH      HHHH     HH                HHHHHHH            
SS_SPIDER3:    H                HHHHHHHHHHHH H      HHHHH                      HHHHHH             
SS_PSSPRED:    HHH                  HHHHHHHHH      HHHHH                       HHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                                     RIRNKDRPAMQLYQPGAR                                    
MODRES_M:                                                    R