Q9C030  TRIM6_HUMAN

Gene name: TRIM6   Description: Tripartite motif-containing protein 6

Length: 488    GTS: 1.902e-06   GTS percentile: 0.619     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 314      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTSPVLVDIREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQACITPNGRESVIGQEGERSCPVCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADH 100
gnomAD_SAV:    VALS  MN P K SF T  Q# # S #V Y      V     C * G V  R    TA   # PA   P DQ P S   L#  A FV    V   H   R
Conservation:  6321111131323283483123115333174724810940000000000000000952520020011221321412332031110001100010006006
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHH     HHHH              HHHH                                HHHHHHHHHHHH             HHH 
SS_SPIDER3:        HHH   HH E  HHHHH     E     HHHHHH              EEE      E       E HHHHHHHHHHHH            H HHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHH  HHHHHHH          HHHHHHHHH                              HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                     DDD D      D 
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ZN_FING:                     CPICLELLTEPLSIDCGHSFCQACITPNGRESVIGQEGERSCPVCQ                               LKAVLCADH

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GEKLQLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPERCRIQTEFNQLRNILDRVEQR 200
BenignSAV:                                              D           K                                              
gnomAD_SAV:    E N P  S  N  L RRIS #   QC   M RM#KL E*  Q# H       KKV* P ##KG FI  TA#   E  S TY   #Q  H *KTVN#MGKQ
Conservation:  2403015712511234015101116115021222341112401321121021101010101100111110022012201210410151111025002410
SS_PSIPRED:        EEEE     EEEHHH   HHH   EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEEE     EEEHEH   HHH   EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHH     EHHHHHHH HHH    EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                              D                        
ZN_FING:       GEKLQLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLV                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELKKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSYW 300
gnomAD_SAV:      EN Q   *T I  T  VQ G I  S L Q  VL   HP H  A #   # N IAKG  L  VKTSK   AN  I# *PSNP WIP* FTK   F# C 
Conservation:  0311511221011002111010311310021113124302110210123222102102100111101101101011010001100111011211011010
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH HHHHHHHHH           HHHHH    HHHHHHHHHHHH    EEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH              HHHHH      HHHHHHHH HH   EEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH    HHHHHHHHHHHHH   EEEE
DO_DISOPRED3:          D                                                      D                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEKHYDCSVLGSQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSG 400
gnomAD_SAV:    F  IPY  I  FSR P   # H#S LE  L RLP#   RDNW    FPQVFAS  C      N  V#L EL  #P   AC  H  V T  P F C*S # 
Conservation:  2030321000100212112111100000000000000100001424020402441452402112005149430100000000000000000000012104
SS_PSIPRED:       EE        EEE     EEEE                            EEEEEEE      EEEEEEE          HH      EEEE     
SS_SPIDER3:    EEEE         EEE     EEEEE          HH     EE     E  EE EEEE E    EEEEEEE           H      EEEE     
SS_PSSPRED:    EEEEE        EEEE    EEEE                              EEEEE      EEEEEEE                           
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        
AA:            YWVIGLQHNHEYRAYEDSSPSLLLSMTVPPRRVGVFLDYEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTTLCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS 488
gnomAD_SAV:    HCL E    R  T C N FL   FFT  SSCHLW    H S I   C A KRS  V   A * Y I    H STRSS  RL PCC  F
Conservation:  3423210000110210010101110100020144525422120547453110123342410003110216362310200532400000
SS_PSIPRED:    EEEEEEE   EEEE                 EEEEEEE    EEEEEE       EEEE           EEE        EE     
SS_SPIDER3:    EEEEEEE   EEEE       EE        EEEEEEE    EEEEEE       EEEE        E  E         EEE     
SS_PSSPRED:    EEEEEE    EEEEE                EEEEE      EEEEEE       EEEE                      EE     
DO_DISOPRED3:                                                                                         D
DO_SPOTD:                                                                                             D
DO_IUPRED2A: