Q9GZN6  S6A16_HUMAN

Gene name: SLC6A16   Description: Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5

Length: 736    GTS: 1.806e-06   GTS percentile: 0.581     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 365      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKTEAQPSTSLLANTSWTGTVISDSVPGSQTWEDKGSLTRSATSWTSEAQVSAARVAEAQARTSQPKQISVLEALTASALNQKPTHEKVQMTEKKESEVL 100
gnomAD_SAV:    V   G  L  # V I *S   MF       M*  ED  NQ P Y*I D      #D  T V  GE M      VS TP P    KR   KV D     I 
Conservation:  9113232411111121312111112122321442211114222322211212211131211303212221112111231221112022211113211312
SS_PSIPRED:                                   EEE                  HHHHHHHHH         HHHHHHHHHH     HHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:                         E         E               H    HHHHHHHHH         HHHHHHHH       HHHHH HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                        HHHHHHHHHH         HHH                   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDD  D         DDDDDDD DDD  DD                 DDD                           DDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LARPFWSSKTEYILAQVGFSMKPSCLWRFAYLWLNSGGCSFAAIYIFMLFLVGVPLLFLEMAAGQSMRQGGMGVWKIIAPWIGGVGYSSFMVCFILGLYF 200
BenignSAV:            R                                                                                            
gnomAD_SAV:     DCL LPG   C  P*L         RC T   FS A   VT VCV V  VFE SF    V G  GVC   VC *   VL MA  #NY LTL    C * 
Conservation:  1144284472484643464233311472522453237442744384355525849755798738833434333395133762485984444763514331
STMI:                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MM
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H       HHHHHHHHHHHH     HHH HHHHHH       HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NVVNSWIIFYMSQSFQFPVPWEKCPLTMNSSGFDPECERTTPSIYFWYQQALKASDRIEDGGSPVYSLVLPFFLCWCLVGAFMINGLKSTGKVIYVLVLL 300
gnomAD_SAV:    SM I   N#*V K   SLIL#  #L M # R V   Y Q AR  C  *  P       K  R  IC     S FF  VI   LMS  T      CF    
Conservation:  7423493549534363353792098333755138657447464368974248465535413725314514455434354434333936336644454432
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH      HHH           HHHH    HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH H       HH             H     HHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH                              EHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHEHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                  N                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PCFIIVGFFIRTLLLEGAKFGLQQLVVAKISDVYNMSVWSLAGGQVLSNTGIGLGSVASLASYMPQSNNCLSDAFLVSVINLLTLLVFTSFNFCVLGFWA 400
gnomAD_SAV:        T #   G R  Q VE C P*V    ML    I       V     I #S CCIV   FHT   SD P GG  M      S*  C       PS RV
Conservation:  5436334543445264740285326322533243330451146154543373959444447763334668408754444345233432322244347438
STMI:          MMMMMMMMMM                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHE  HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHHH  HHHEEE   EEEEE    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVITHRCCERNAEILLKLINLGKLPPDAKPPVNLLYNPTSIYNAWLSGLPQHIKSMVLREVTECNIETQFLKASEGPKFAFLSFVEAMSFLPPSVFWSFI 500
gnomAD_SAV:    I# ARH     DA       PR P     T  S  CY     D  F  FRR#   VI CK # Y    L     KVR   IP S     L LLP      
Conservation:  6323139224722152187124276255157124014322262195336411361164214228431145243225324354253433624435346343
STMI:          MMM                                                                                            MMMMM
SS_PSIPRED:    HH    HHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHH    HHHHHHHHH      HHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH      HH HHHHHHHHH            HH   HHHHHHHHH    HHHHHHHH H     HHHHH H    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHH
SS_PSSPRED:    EE    HHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH   HHHHHHHHH       HHHHHHH     EEHHHHHHHHHH    HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FFLMLLAMGLSSAIGIMQGIITPLQDTFSFFRKHTKLLIVGVFLLMFVCGLFFTRPSGSYFIRLLSDYWIVFPIIVVVVFETMAVSWAYGARRFLADLTI 600
gnomAD_SAV:       KF VT    P AV LSTV A    SP          A II  # A SF SI*HL  *S      C*V L  NI  I DIV  P* C       Y M 
Conservation:  3853432355322342344444577524323443333536242323554453633447254327413443335333533374353354333276324302
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   H HHHHHHHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EHEEHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLGHPISPIFGWLWPHLCPVVLLIIFVTMMVHLCMKPITYMSWDSSTSKEVLRPYPPWALLLMITLFAIVILPIPAYFVYCRIHRIPFRPKSGDGPMTAS 700
gnomAD_SAV:      # S C V          FM    L  TL Q  R L   I  A#   E   *  QS #  FTV I TT  F   E     C Y   L  # RER R   
Conservation:  4232432332236623448244425332233121121237268653232321404725211332241222436442433323212413211101120213
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     
SS_PSIPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:    HH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    E           EEE   HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:                                                                                            DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                             DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30      
AA:            TSLPLSHQLTPSKEVQKEEILQVDETKYPSTCNVTS 736
gnomAD_SAV:    IT     EIP NEDFL #  V     E AL   GS 
Conservation:  112012021121111122231221110111111111
SS_PSIPRED:                    HHHHH               
SS_SPIDER3:                    HHHHHH              
SS_PSSPRED:                    HHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: