Q9GZS1  RPA49_HUMAN

Gene name: POLR1E   Description: DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49

Length: 419    GTS: 1.644e-06   GTS percentile: 0.512     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 211      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAEVLPSARWQYCGAPDGSQRAVLVQFSNGKLQSPGNMRFTLYENKDSTNPRKRNQRILAAETDRLSYVGNNFGTGALKCNTLCRHFVGILNKTSGQME 100
gnomAD_SAV:    IEV   L    R  EV     K I  R Y R VR  D  S IWH SE   T #    WVV     GI#H   S RN #     SR        QN  E  
Conservation:  3222110020101311111112233434334121232131633323131136424123434577588385738842333557459546575554263264
SS_PSIPRED:             EEEE        EEEEEEEE  EE     EEEEEEE        HHHHHHHEEE    HH        HHHHHHHHHHHHHHHH     EE
SS_SPIDER3:             EHEE        EEEEEEEE  EEE  E EEEEEEE      HHHHHHHHHHHH H HH         HHHHHHHHHHHHHHH      EE
SS_PSSPRED:      HHH  HHHHHHH       EEEEEEE          EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHH   EE           HHHHHHHHHHHHH     EE
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBB                                                                                          
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                            DDDDDDDD  DDDDDDDD                                         
MODRES_P:                                        S                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VYDAELFNMQPLFSDVSVESELALESQTKTYREKMDSCIEAFGTTKQKRALNTRRMNRVGNESLNRAVAKAAETIIDTKGVTALVSDAIHNDLQDDSLYL 200
BenignSAV:                                                                                                H        
gnomAD_SAV:      ATG      V   #  G   VQ#     *  ET   T    A    *          #S    C   N TG V  R   # VI NT  SHF*H     
Conservation:  5436445354825353111122103112265746683676598746667693485472853536407733882267226842472366332212315237
SS_PSIPRED:    EEEHHHHH         HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHEEE HHH           
SS_SPIDER3:    EEEHHH   EE E      HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH   HH HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH H  H HHHHHHHHH        EE 
SS_PSSPRED:    EEEHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                             D                        DDDDDD                                           
MODRES_P:                                                                    S                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPCYDDAAKPEDVYKFEDLLSPAEYEALQSPSEAFRNVTSEEILKMIEENSHCTFVIEALKSLPSDVESRDRQARCIWFLDTLIKFRAHRVVKRKSALGP 300
gnomAD_SAV:    L   EG     H#  L  II  VVC          SSFM   #  I G KN     T VF C  T MDNQALLSQRMR  G     QTPS   WQR V L
Conservation:  8473147223547938435644275376312533422353545144133234213632164174132215342576357722646531441422822132
SS_PSIPRED:             HHH   HHHH  HHHHHHH  HHHHH    HHHHHHHHHH     HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:             HHHHH  HH   HHHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H       
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHH  HHHHHHH  HHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVPHIINTKLLKHFTCLTYNNGRLRNLISDSMKAKITAYVIILALHIHDFQIDLTVLQRDLKLSEKRMMEIAKAMRLKISKRRVSVAAGSEEDHKLGTLS 400
BenignSAV:                                                            M                          K                 
gnomAD_SAV:      S V S    E     I IS   W F LAFLRVNL TC V   V T#   T  RM     R     I      TK Q CR K  L TDN AG       
Conservation:  4552351144252863347235553526526433853553547599522444688296476352636546597575945261210112201325626371
SS_PSIPRED:           HHHHHH EEEEE    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH    HHHHHHHHHHH       EEEEE             
SS_SPIDER3:        E  HHHH H EEHEE   HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEHHHHHHH    HHHHHHHHHH    E    EEEE      EEE EE 
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_IUPRED2A:                                                                                                     DD
MODRES_A:                                                                              K                           

                       10        2
AA:            LPLPPAQTSDRLAKRRKIT 419
gnomAD_SAV:     LV L *SL L T WK S 
Conservation:  5984121120222445631
SS_PSIPRED:             HHHHHH    
SS_SPIDER3:            HHHHHH     
SS_PSSPRED:            HHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:       BBBBBBBBBBBBBB
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D          D DD D