Q9GZX3  CHST6_HUMAN

Gene name: CHST6   Description: Carbohydrate sulfotransferase 6

Length: 395    GTS: 2.984e-06   GTS percentile: 0.900     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 59      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 338      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MWLPRVSSTAVTALLLAQTFLLLFLVSRPGPSSPAGGEARVHVLVLSSWRSGSSFVGQLFNQHPDVFYLMEPAWHVWTTLSQGSAATLHMAVRDLVRSVF 100
PathogenicSAV: L             P      R        S          Y       CLDL     P T    L H L S   M                #   PW  
gnomAD_SAV:    T*MLHI R V  TVI  E  F    F W R  Y V S*##M      P*HLC     *  S DLNFLHV #SV   *SP PPV TTAVN VL#N L# I 
Conservation:  5000201010212322211222221000000000111112375566777999765396484868396685893595911201232006425386333335
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                          
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEEEEE     HHHHHHHHHH    EEE   HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH              EEEEEE      HHHHHHHHH    EEEE    HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH              EEEEEEE     HHHHHHHHHH   EEEE    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                       WRSGSSF                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LCDMDVFDAYLPWRRNLSDLFQWAVSRALCSPPACSAFPRGAISSEAVCKPLCARQSFTLAREACRSYSHVVLKEVRFFNLQVLYPLLSDPALNLRIVHL 200
PathogenicSAV:  # V  S  C          LP    CV  P                    P             P       R  #        R           E R
gnomAD_SAV:     *  EMSV#C   CC  C  LP PM H   L  T    LQ V   A#M #TR T# P A #Q   CFF  L F   C SS   V R   YLT  QC # R
Conservation:  3863443236300031141493510756786274802112113200009100911034004334912645454936956362383597195265546689
SS_PSIPRED:        HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH                HHH         HHHHHHHHHH   EEEEEEE   HHHHHHHHH      EEEEE
SS_SPIDER3:        HHHH H      HHHHHHHHH H                  H HH        HHHHHHHH    EEEEEEE    HHHHHHHH        HEHH
SS_PSSPRED:          HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH    HHH HHHHHHHHHH    EEEEEEE HHHHHHHHHHH      EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                     N                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRDPRAVLRSREQTAKALARDNGIVLGTNGTWVEADPGLRVVREVCRSHVRIAEAATLKPPPFLRGRYRLVRFEDLAREPLAEIRALYAFTGLSLTPQLE 300
PathogenicSAV:  SEQ##   F#     T   #                           P                  C     K P                        
gnomAD_SAV:    LCNQ#T# CF# #A  #PVG  C M   SS## D NSVMCMGLG  #RQI# #KDTIP SL  P# CC#V## KGPVP R  #VGTP V A  GV  *I#
Conservation:  7999976229821300180084045430010001150030342278376226112411024127327835486784522831131148174381331053
SS_PSIPRED:    E  HHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_SPIDER3:    E  HHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEEHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_PSSPRED:    E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:        RDPRAVLRS                                                                                          
CARBOHYD:                                  N                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AWIHNITHGSGPGARREAFKTSSRNALNVSQAWRHALPFAKIRRVQELCAGALQLLGYRPVYSEDEQRNLALDLVLPRGLNGFTWASSTASHPRN 395
PathogenicSAV:                                                          #                                     
BenignSAV:                                                                         D                          
gnomAD_SAV:     R YST  VC R T# #GL#   S#SVSICHV*H VP   E GSMR RRGRS R V# Q G PV #E  R#F  G L   #S #*VT IT Q#Q 
Conservation:  18523296614132001151524755004748981054503512692391236125691150621662222244302000111011111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHH            EE    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   EE   HHHH                            
SS_SPIDER3:    HHHHHHH                   HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   EE   HHHHH      E                    
SS_PSSPRED:    HHHHHHH                   HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH                          
DO_DISOPRED3:                                                                              DD DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDDD                                                             DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:               DDDDDDD D                                                                        DD
CARBOHYD:          N                      N