Q9H1J1  REN3A_HUMAN

Gene name: UPF3A   Description: Regulator of nonsense transcripts 3A

Length: 476    GTS: 1.726e-06   GTS percentile: 0.549     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 282      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRSEKEGAGGLRAAVAARGPSGREKLSALEVQFHRDSQQQEAETPPTSSSGCGGGAGKPREEKRTALSKVVIRRLPPGLTKEQLEEQLRPLPAHDYFEFF 100
BenignSAV:                                                                    K                                    
gnomAD_SAV:    #  #R RSR#F TVL VQ LG KKNMW  GL    H   K TK  LILP## WCCGDQSGD ET TVN       LLD  RK    *    A  E LA  
Conservation:  1111111111111111111111111111100101000120101000001111000000010110020012224334325343232224132412332223
SS_PSIPRED:                HHHHH      HHH HHHHH                            HHH      EEEE       HHHHHHHH       EEEEE
SS_SPIDER3:       HH     HHHHH             HHHHH H HHH                              EEEEE      HHHHHHH      EEEEEEE
SS_PSSPRED:                HHHHH                                           HHHH     EEEE       HHHHHHHH       EEEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD D D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD  DD             DDDDD              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AADLSLYPHLYSRAYINFRNPDDILLFRDRFDGYIFLDSKGLEYPAVVEFAPFQKIAKKKLRKKDAKTGSIEDDPEYKKFLETYCVEEEKTSANPETLLG 200
gnomAD_SAV:       VN HSYFS    V  G S A PR GVLL  H  FN  D   LS IAL S   T     SE Y  S N K          N YAQ    T I  AV #
Conservation:  2231543863545454564237563486648665484534656639667677999447653774936385624936853896163155562145594995
SS_PSIPRED:    E          EEEEEEE  HHHHHHHHHHH  EEEE        EEEEE                        HHHHHHHHHH          HHHHHH
SS_SPIDER3:               EEEEEEE  HHHHHHHHH     EEE     EE EEEEE   H                    HHHHHHHHHH            HHHH
SS_PSSPRED:    E          EEEEEEE  HHHHHHHHHHH  EEEE        EEEEE   HHH                  HHHHHHHHHHH           HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                             DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                   DDDDD                         DDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EMEAKTRELIARRTTPLLEYIKNRKLEKQRIREEKREERRRRELEKKRLREEEKRRRREEERCKKKETDKQKKIAEKEVRIKLLKKPEKGEEPTTEKPKE 300
gnomAD_SAV:    V  V  #QFS KI IL  K   I ES    V*   #  WSK Q    S W  K K  GK  G*RTR AG R TTS     FQ      E *       * 
Conservation:  7566647531676458964567411116876969776686598466763556656667767425754364144116543538676925324301221043
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RGEEIDTGGGKQESCAPGAVVKARPMEGSLEEPQETSHSGSDKEHRDVERSQEQESEAQRYHVDDGRRHRAHHEPERLSRRSEDEQRWGKGPGQDRGKKG 400
gnomAD_SAV:    #  KMG         SSSTIINT TV R   QS  S   SR  D W  KS#          LMN S# YITR K  P        *   EES  #  R E
Conservation:  3031030300223101101011111011102101121002342422411123334112111114324534221513211542245123232001232311
SS_PSIPRED:                                              HH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHH          HHHH              
SS_SPIDER3:                        E                     HHHHHHHHHHHHHHHHH               H H     H HHH             
SS_PSSPRED:                                                  HHHHHHHHHHHHHHH                     HHHH              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                              S                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70      
AA:            SQDSGAPGEAMERLGRAQRCDDSPAPRKERLANKDRPALQLYDPGARFRARECGGNRRICKAEGSGTGPEKREEAE 476
gnomAD_SAV:    TRN R S K T K V S    N L RKE Q   EEQ # *  H   H LV*   RYG #    RLES  KR Q V 
Conservation:  1010001111122113312111111122322233213133342541123111111010013000000111110111
SS_PSIPRED:           HHHHH              HHHHH     HHHHHH                          HHHHHH  
SS_SPIDER3:             HH HH H                    HHHHHH     H                           H
SS_PSSPRED:                   HHHHH      HHHHHH    HHHHH                             HHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                            DDSPAPRKERLANK