Q9H211  CDT1_HUMAN

Gene name: CDT1   Description: DNA replication factor Cdt1

Length: 546    GTS: 3.046e-06   GTS percentile: 0.908     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 450      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEQRRVTDFFARRRPGPPRIAPPKLACRTPSPARPALRAPASATSGSRKRARPPAAPGRDQARPPARRRLRLSVDEVSSPSTPEAPDIPACPSPGQKIKK 100
PathogenicSAV:                                                                  T                                  
BenignSAV:                                                P                 V                    L              V  
gnomAD_SAV:    #GHLCLSH       RT #     V    R ST         TP      SL   V R   V        #  A    R I L VS   T #FL LNV  
Conservation:  3111011111101101001110100110021100000100001110000000000000000011111111111111111111100100111110021220
SS_PSIPRED:                                                                      HHHH                         HH   
SS_SPIDER3:         HHHHH                                                        HHH                               
SS_PSSPRED:           HHH                                                         HHH                              
DO_DISOPRED3:  DD     DDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:         MEQRRVTDFFARRRPGPPRIAPP                                            RRL                              
MODRES_P:                                  T S                                                             S       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STPAAGQPPHLTSAQDQDTISELASCLQRARELGARVRALKASAQDAGESCTPEAEGRPEEPCGEKAPAYQRFHALAQPGLPGLVLPYKYQVLAEMFRSM 200
PathogenicSAV:                 H                                                                                   
BenignSAV:                                       V                                    C                            
gnomAD_SAV:      #  S S #    RY#    QHEL   WS# PRP LW#VN  T H#E*PGN# G CHS  A  K   T RHLQV  HLSPL  L SCR  MVVK# C T
Conservation:  1100001010012111111111321151234163243212111000101001101101111111111777657438452238592896675394669654
SS_PSIPRED:                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DTIVGMLHNRSETPTFAKVQRGVQDMMRRRFEECNVGQIKTVYPASYRFRQERSVPTFKDGTRRSDYQLTIEPLLEQEADGAAPQLTASRLLQRRQIFSQ 300
BenignSAV:                                      R                           A                          L           
gnomAD_SAV:     INMDVF  CPKKTS VE *W#I*VVVH C DGRSI    IA RVFHC CR#CR S # #DAGW*E *F #K   Q#D GRGPA  M LCF K*#H   *
Conservation:  7464657589394489376756984345639861556865495824605667325434321144326887468240030211131747526839732932
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  EEEEEEEEE             EEEEEEE  HHH         HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   EEEEEEEEEE       E   EEEEEEE   E          HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEEE             EEEE    HHH         HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                               DDDDDDDD               
DO_SPOTD:                                                                                     DDD                  
DO_IUPRED2A:      DD  D      DDDDDD                                 DDD D D  D     DDD        D    DDD             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLVEHVKEHHKAFLASLSPAMVVPEDQLTRWHPRFNVDEVPDIEPAALPQPPATEKLTTAQEVLARARNLISPRMEKALSQLALRSAAPSSPGSPRPALP 400
gnomAD_SAV:     V   I K   V  T  N SV  L Y   H  LC SM   TN #L V   L  M Q    E  M Q C  L L#I #T NR   CCTVLTR#AFR SVPL
Conservation:  4842375359223433728541666437369993836817625033279359114344795869339533427665577225522322111111001112
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH        HH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH        HHH                    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH               
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH                                HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                D         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   D          DD  DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                       S                                                             S             S      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATPPATPPAASPSALKGVSQDLLERIRAKEAQKQLAQMTRCPEQEQRLQRLERLPELARVLRSVFVSERKPALSMEVACARMVGSCCTIMSPGEMEKHLL 500
PathogenicSAV:                                                     W        Q     K                                
BenignSAV:                                                            A                                  N         
gnomAD_SAV:    VSS#PIRLVT LIS  RM *HM #W *V  T*#P T  MQFLG KRWP H QQ  KPGPM WGIS#FKC SVFG# E SVKVM   FIV#ISE I N   
Conservation:  1121223211241385856439668584653553362767131341530352443246535736754446356244447245238402133144562641
SS_PSIPRED:               HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH      EEHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 H     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH      EEEHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDB                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                 D                                                                 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD           DD  DDDDDDDDDDDDDDDDD  D                                                

                       10        20        30        40      
AA:            LLSELLPDWLSLHRIRTDTYVKLDKAADLAHITARLAHQTRAEEGL 546
BenignSAV:       A                                 V         
gnomAD_SAV:      AQ PLE  R YHVCANA IN VE SA T # VC VYE C  D P
Conservation:  4544534275136146242535535113420521251012215200
SS_PSIPRED:    HHHHH  HHEEEEEE   EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHH    EEEEEE   EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHH    EEEEEE   EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                           DDDDD
DO_SPOTD:                                                DDDD
DO_IUPRED2A: