Q9H269  VPS16_HUMAN

Gene name: VPS16   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog

Length: 839    GTS: 3.211e-06   GTS percentile: 0.928     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 465      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWRKEKAASVRPVLDIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCV 100
PathogenicSAV:                                                    K                                                
gnomAD_SAV:    VV  # T   F        F    V *HP Q FS RR  GPS  VSTG   K  QN        AFGMSCT SL  P        M      TV K    
Conservation:  4010021122222222144123404141323342332342543334445432001132322256144354546012322254341311454312354324
SS_PSIPRED:            EE    EEEEEEEE         HHHH EEEEE    EEEEEE             EEEEEE    EEEEEE     EEEEEE     EEEE
SS_SPIDER3:            EEE    EEEEEEE E      HHH   EEEEE    EEEEEE             EEEEEE    EEEEEE     EEEEEE    EEEEE
SS_PSSPRED:                  EEEEEEEEE       HHHHHHHEEEE    EEEEEE   HHH       EEEEE       EEEE     EEEEE     EEEEE
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      D                                                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTVLCQDRVAHILLAVGPDLY 200
gnomAD_SAV:      Y S   C  R H Q P N# S    ##  Y GF  I LD RA  V EP HL F VT AN NPCW L M   L  R    M    QMV VI   RL V 
Conservation:  3549389564637284525464465363482455696736667556564225553426513459865525537412836834725572315567161354
SS_PSIPRED:    E   EEEEE        EEE   HHHH  EEEEEEEEEE   EEEEE    EEEEEE      EEE            EEEEE      EEEEEE  EEE
SS_SPIDER3:    E    EEEEE    E  EE     H    EEEEEEEEE     EEEEE   EEEEE     EEEEE            EEEEEE    EEEEEEE  EEE
SS_PSSPRED:    E   EEEEE                     E EEEEEE    EEEEEE   EEEEE       EE             EEEEEE     EEEEEE   EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGYIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAVVVAWERRLMVVGDAPESIQ 300
gnomAD_SAV:     S R T  SMM LD T  G   RHV A   CQ#     NA         P    YAC SS Q      F  TCTL    TMMA C  Q     N #K   
Conservation:  3552458314154331512323424546553528645584414544242543541451410212724316414624233544326442523480212142
SS_PSIPRED:    EEE                   EEEEE     EEEEEE    EEEEE     EEEEEE         EEEE        EEEEEE  EEEEE      EE
SS_SPIDER3:    EEE      E           EEEEEE     EEEEEE    EEEEE      EEEEE        HEEEEE       EEEEEE  EEEEEE     EE
SS_PSSPRED:    EEE                  EEEEEE    EEEEEEE   EEEEEE  HHHHHHHHH        EEEEE        EEEEEE  EEEEE      EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSTHEFLHEVPAASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHQPDMQKSLL 400
gnomAD_SAV:     M     *   D V  #V FC   KL     VTTK    V  V  EV       #   K   VN   W N *    P GM   L  T   QH N   R  
Conservation:  6243223256564564553311144475543133544655563465696646243576266566657996675229138715766974362141466364
SS_PSIPRED:    EEE   EEEEE    EEEEE  EEEEEEE  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH HH HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EE    EEEEE   EEEEEE   EEEEEE  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    E     EEE      EEEEE    HHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAASFGKCFLDRFPPDSFVHMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQLTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSD 500
gnomAD_SAV:     ST SR    EGI LN  M TS G P  SVIWN   R L  *   E   VH P    M Q   HP  H#FQ  C L  KSI#M      S#     H  #
Conservation:  6434355364223253054034355755333241138474523463459346946876395676554467377746424756869557554797756436
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHH         HHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:    HHH H HH       HHHHHHH  HHHHHHHH      E  HHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMA 600
BenignSAV:                         N                                                                               
gnomAD_SAV:    KY SQ   R    S   FDFN T * C   CM   VE    K CL        TT KN     NGV  RN   M A          *  # V  WHH # 
Conservation:  6369456526655345446636936635676369676666576444245776946446256714667799797565644267575499499967644949
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       HHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH             EHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQTAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTV 700
BenignSAV:                                         I                                                               
gnomAD_SAV:        QHLYMR   KM N  H  # D #   G   Q T   K CT  Q    RIVTGV#      CVD V    VWF #Q QC * #RWA L EV #R  L
Conservation:  7999474832553386555446574625555433125610323353434074253565558665444444544346550531433323102242343143
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADV 800
gnomAD_SAV:        VDSYH HV      VCMS   ISR  M V  G   *        RR   T       N VRE D HK     ACASA    ES    AN  * VHG
Conservation:  0144114124234443366655565356645256413336555657453454662442733343411422344443244253334343223443247633
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH       HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH        HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                            D                          

                       10        20        30        4
AA:            AIEHRNEAELSLVLSHCTGATDGATADKIQRARAQAQKK 839
gnomAD_SAV:    PMK Q    VTFL C  M PI  T      Q  S     
Conservation:  435343425332454342234211222542345211122
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHH  HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                       DD
DO_SPOTD:                                       DDDDDD
DO_IUPRED2A:                           D  DDDDDDDDDDD