Q9H270  VPS11_HUMAN

Gene name: VPS11   Description: Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog

Length: 941    GTS: 1.799e-06   GTS percentile: 0.578     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 392      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAYLQWRRFVFFDKELVKEPLSNDGAAPGATPASGSAASKFLCLPPGITVCDSGRGSLVFGDMEGQIWFLPRSLQLTGFQAYKLRVTHLYQLKQHNILA 100
gnomAD_SAV:      VCV SG L   H #R  K PNS A S  T  T     F    F S #  S           IG  MC FL# RR  A #    Q  Y   M  Q F  
Conservation:  7443247658479567163320424734444444444442206148145266558663666865362765629593431997997699965777776975
SS_PSIPRED:           EEE    EEEEE                              EEEE    EEEEE   EEEEEE    EEEEEEEE  EEEEEEE     EEE
SS_SPIDER3:                E   E                        E       EEEE     EEEEE  EEEEEE     EEEEEE    EEEEEE     EEE
SS_PSSPRED:       HHHHH      EEEE                              EEEEE    EEEEE    EEEEE    EEEEEEEE EEEEEEEEE    EEE
DO_DISOPRED3:  D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_IUPRED2A:                          DDD DDDD                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVGEDEEGINPLVKIWNLEKRDGGNPLCTRIFPAIPGTEPTVVSCLTVHENLNFMAIGFTDGSVTLNKGDITRDRHSKTQILHKGNYPVTGLAFRQAGKT 200
gnomAD_SAV:     A GHK   S            SA AFFI* L                    KSL V  I   IK         W  R      D#C       CET NA
Conservation:  6674772956977979957977676979766667463247566577466677779766959997595999999999996339356339799757672591
SS_PSIPRED:    EEE        EEEEEE         EEEEEEE          EEEEEE    EEEEEE    EEEEE          EEEEEE    EEEEEEEE    
SS_SPIDER3:    EEEE     EEEEEEEE        E EEEEEE        EEEEEEE     EEEEEE    EEEEE E        EEEEE     EEEEEEEE   E
SS_PSSPRED:    EEE        EEEEEE         EEEEEEE         EEEEEEE    EEEEEE   EEEEEE           EEEE     EEEEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                        D                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            THLFVVTTENVQSYIVSGKDYPRVELDTHGCGLRCSALSDPSQDLQFIVAGDECVYLYQPDERGPCFAFEGHKLIAHWFRGYLIIVSRDRKVSPKSEFTS 300
gnomAD_SAV:    I         I   V      TLM  NIY    H L    S      M  RY    F     H    T   P  T R*L  C     CVL       L  
Conservation:  6697779653525717619765125953699593975749997649769976797999997799999996939555494997945543407254742625
SS_PSIPRED:    EEEEEEE   EEEEEE       EEE                   EEEEE   EEEEE       EEEE    EEEEEE  EEEEEE             
SS_SPIDER3:    EEEEEEE  EEEEEEE       EE      EE   E        EEEEE   EEEEE     E  EEE   EEEEEEE  EEEEEE             
SS_PSSPRED:    EEEEEEE   EEEEEE       EEE                    EEEE   EEEEE        EE    HHHHHHH  EEEEEE             
DO_DISOPRED3:                                                                                              DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                 DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                  DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDSQSSDKQILNIYDLCNKFIAYSTVFEDVVDVLAEWGSLYVLTRDGRVHALQEKDTQTKLEMLFKKNLFEMAINLAKSQHLDSDGLAQIFMQYGDHLYS 400
gnomAD_SAV:      LH  E        Q     D CAF   AA  V  G F FM M#  Q  P   N  *I      N      V        V T   VP   H     HG
Conservation:  3313127774967999399799954175577976779967779735524447797976679767766666676656656676759776677767777972
SS_PSIPRED:            EEEEEEE    EEEEEEE    EEEEE    EEEEE   EEEEEEE  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            EEEEEE     EEEEEEEE  E EEEEE   EEEEEE  EEEEEE    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             EEEEE     EEEEEE     EEEEEE  EEEEEE    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                                                               
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGNHDGAVQQYIRTIGKLEPSYVIRKFLDAQRIHNLTAYLQTLHRQSLANADHTTLLLNCYTKLKDSSKLEEFIKKKSESEVHFDVETAIKVLRQAGYYS 500
gnomAD_SAV:     #SYNR  P   * T    L CE C      C    SV       RY  S N      Y C R    L       T  DC      KR  N HQ      
Conservation:  7767977667777767597955797777777757555577747755496546577577799779774449777552455277676677777797676654
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH   HH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH          HHHHHHHHHH   HH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH  HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HALYLAENHAHHEWYLKIQLEDIKNYQEALRYIGKLPFEQAESNMKRYGKILMHHIPEQTTQLLKGLCTDYRPSLEGRSDREAPGCRANSEEFIPIFANN 600
BenignSAV:                                   Q                                                                     
gnomAD_SAV:        VV  YVNY          L  C    Q VSR    RV R L L     V YMS  A   P E RPVCQ  FKVL#N   L   V#  *LV#     
Conservation:  6656796470575957558799576667793977597769693799499979746572369299717973525103002001120147777699679799
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH                      HHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDDDD D           
DO_SPOTD:                                                                                 DDDDDDDDD                
DO_IUPRED2A:                                                                             D   DDDDD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRELKAFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELRLQNWAHEKDPQVKEKLHAEAISLLKSGRFCDVFDKALVLCQMHDFQDGVLYLYEQGKLFQQIMHYHMQHE 700
BenignSAV:                                                                                                 T       
gnomAD_SAV:     * V   V#       HL     N  F  QP     K  R   Q# RG     P   C YYI   T  P* KPN  N     FD#       VD PT  K
Conservation:  6499737767952732175677799979979979797251317115606643997653922777559799999597576766666747567567655754
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                               D                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:           DDD                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QYRQVISVCERHGEQDPSLWEQALSYFARKEEDCKEYVAAVLKHIENKNLMPPLLVVQTLAHNSTATLSVIRDYLVQKLQKQSQQIAQDELRVRRYREET 800
BenignSAV:                                                                          I                              
gnomAD_SAV:     *W G# MSGCR V##   * R    LT#     E      P   K   V S  R   N       PI IV  C  K     R EVV   PG QWS*G  
Conservation:  5414563565247445256676866677577666634452681665135776776667596666665776767796367554415533662471497577
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH      EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                            DDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRIRQEIQELKASPKIFQKTKCSICNSALELPSVHFLCGHSFHQHCFESYSESDADCPTCLPENRKVMDMIRAQEQKRDLHDQFQHQLRCSNDSFSVIAD 900
PathogenicSAV:                                              G                                                      
gnomAD_SAV:     C L   E     S V           V   S GY    Y SYRQG    L  E N  N   D Q L  LV#   L Q     V        N   M   
Conservation:  2367179577626766777566548444644767666657777796677665454675674667445364643644535655261368326476977676
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH   EEE               EEE     EEHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH   EEE   E      E    EEEE    EE HHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   EEE     HHH        EEE    EHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      D  DDD                           
ZN_FING:                            CSICNSALELPSVHFLCGHSFHQHCFESYSESDADCPTCL                                       
MODRES_P:                  S                                                                                       

                       10        20        30        40 
AA:            YFGRGVFNKLTLLTDPPTARLTSSLEAGLQRDLLMHSRRGT 941
BenignSAV:        K                                     
gnomAD_SAV:      AK I DE     #H I          # CN  #P  K A
Conservation:  55567799979659737225211225247353363223220
SS_PSIPRED:    HH                        HHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHH                       HHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHH                         HHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                          D 
MODRES_P:                             S                 
MODRES_M:         R