Q9H2M9  RBGPR_HUMAN

Gene name: RAB3GAP2   Description: Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit

Length: 1393    GTS: 1.739e-06   GTS percentile: 0.554     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 12      gnomAD_SAV: 650      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MACSIVQFCYFQDLQAARDFLFPHLREEILSGALRRDPSKSTDWEDDGWGAWEENEPQEPEEEGNTCKTQKTSWLQDCVLSLSPTNDLMVIAREQKAVFL 100
BenignSAV:                                          S                                                              
gnomAD_SAV:     G#PV  LW L  F TT E   RQRP  S G   WM STRPA    GA   LK   LP L   E  W  R# Y   V   T P N   I  #QG      
Conservation:  1221113541434511221121000001013000300022222963338548523412322244211112123986483568884499766733468377
SS_PSIPRED:       EEEEEEEHHHHHHHHHHH   HHHHHH                                            HH   EEE      EEEEE  EEEEE
SS_SPIDER3:      E EEEE EHHHHHHHHHHH    HHHHH                                                EEEE     HEEHEEE EEEEE
SS_PSSPRED:       EEHHHHHHHHHHHHHHHH                                                    HHH   EEE     EEEEEE  EEEEE
DO_DISOPRED3:  D                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:                                   DDDDDDDDDDDDDD DDD   D DDDDDDDDDDDDDDDDD                               
DO_IUPRED2A:                                       DD  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 
MODRES_P:                                            S                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VPKWKYSDKGKEEMQFAVGWSGSLNVEEGECVTSALCIPLASQKRSSTGRPDWTCIVVGFTSGYVRFYTENGVLLLAQLLNEDPVLQLKCRTYEIPRHPG 200
gnomAD_SAV:     S   H E R       I #T Y   K#R Y  CG     T    G   CLH   TMMS S  FIC  S   MV V   FK NL  EF G A D  Q  S
Conservation:  4458212236455735433869164356563545346766567777977699779665776795777777499999797963626567697766778969
SS_PSIPRED:    EEEE         EEEEEEEEE        EEEEEEEEE             EEEEEEEE   EEEEEE   EEEEEEE     EEEEEEEE        
SS_SPIDER3:    EEEE        EEEEEEEEEEE       EEEEEEEEE             EEEEEEEE  EEEEEE     EEEEEEE    EEEEEEEE        
SS_PSSPRED:    EE            EEEEEEE         EEEEEEEEE             EEEEEEE    EEEEEE   HHHHHHHH     EEEEEE         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTEQNEELSILYPAAIVTIDGFSLFQSLRACRNQVAKAAASGNENIQPPPLAYKKWGLQDIDTIIDHASVGIMTLSPFDQMKTASNIGGFNAAIKNSPPA 300
gnomAD_SAV:    M   SA  IV C   SL # E    P  HG * R     TL S  MK #S V    C   TN   E  #I  VI     R   #    A H    DCL T
Conservation:  7679599777976375777699999999999797776779594637479794665766663526466375746585596766679369953656635796
SS_PSIPRED:          EEEEEE  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EE         EEEEEE      HHHHHHHHH       EEE     
SS_SPIDER3:          EEEEEE  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            EHEH      EEEEEEEEEE     HHHHHHHHH   E  EEE     
SS_PSSPRED:          HHHHHH  EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH                         EEEEEE      HHHHHHHHH       EE      
DO_DISOPRED3:                                      DDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:                                             DDDDD                                                        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSQYITVGSNPFTGFFYALEGSTQPLLSHVALAVASKLTSALFNAASGWLGWKSKHEEEAVQKQKPKVEPATPLAVRFGLPDSRRHGESICLSPCNTLAA 400
BenignSAV:                 I                                                                                       
gnomAD_SAV:    V #  A   I  IACLC  A N             TIF  V   VS         YQ AP  R   EID  S V I   F    H   N      K  E 
Conservation:  6665467745775977776675679779999679999999769577799799746377722777797575656737977799999699356997975797
SS_PSIPRED:     EEEEEEE   EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH            EEEEE       EEEEEE     EEE
SS_SPIDER3:    EEEEEEE     EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH              EEE      EEEEEEE     EEE
SS_PSSPRED:      EEEEE    EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          EEEEE        EEEEE     EEE
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDD                            
DO_SPOTD:                                                         DDDDDDDDDDDDDD D                                 
DO_IUPRED2A:                                                              DDDDDDDD                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTDDFGRVILLDVARGIAIRMWKGYRDAQIGWIQTVEDLHERVPEKADFSPFGNSQGPSRVAQFLVIYAPRRGILEVWSTQQGPRVGAFNVGKHCRLLYP 500
PathogenicSAV:                          C E                               Q                                        
gnomAD_SAV:     RG  S         E  V#VC   CNPP      I  F#    KR   #T    RSSTQ  H FMMCVS K*  AM NS  RSG  G K #NRW     
Conservation:  6995999739996379557999977977747936319543563223231464522227495979779797999799795565999779979995989884
SS_PSIPRED:    EE     EEEEE     HHHH       EEEEEEE                          EEEEEEE     EEEEEE     EEEEEEE    EEE  
SS_SPIDER3:    EE     EEEEE     EEHHHH     EEEEEE  H H                     EEEEEEEEE     EEEEE     EEEEEE     EEE  
SS_PSSPRED:    EE    EEEEHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE                          EEEEEEE     EEEEEE     EEEEEE     EEE  
DO_DISOPRED3:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           
DO_SPOTD:                                               DDDDDDDDDDDDDDD                                            
DO_IUPRED2A:                                                 DDDDD D                                               
MODRES_P:                                                       S                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYKIMGLNNVTSQSWQPQTYQICLVDPVSGSVKTVNVPFHLALSDKKSERAKDMHLVKKLAALLKTKSPNLDLVETEIKELILDIKYPATKKQALESILA 600
BenignSAV:                                                                          S                              
gnomAD_SAV:     C     SKD GRRRR     T   GL FER     #L   S     R Q  NV      VDSP A  TD G# G VVR  V   E             T
Conservation:  9767897766598695457385994962353465636999779899969698959944754448734111241461644246578768556598874585
SS_PSIPRED:                         EEEEE     EEEEEEEHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                        EEEEEE     EEEEE EHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                        EEEEEE    EEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:       DDDDDDDDDD                                                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SERLPFSCLRNITQTLMDTLKSQELESVDEGLLQFCANKLKLLQLYESVSQLNSLDFHLDTPFSDNDLALLLRLDEKELLKLQALLEKYKQENTRTNVRF 700
gnomAD_SAV:    R C R      V   S  IF  E VQ    R      S  N     VC     PV  #  #SC #K   Q VS NGR# I   E   T     A SKIQ 
Conservation:  4413543452355337243632642417732743481336788475324125430112222102002731442323275155214842832312423525
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH        EE 
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH      EEEE
SS_PSSPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH      EEE
DO_DISOPRED3:                     DDDDDDDDDD                         DDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                             DDDDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SDDKDGVLPVKTFLEYLEYEKDVLNIKKISEEEYVALGSFFFWKCLHGESSTEDMCHTLESAGLSPQLLLSLLLSVWLSKEKDILDKPQSICCLHTMLSL 800
gnomAD_SAV:        GR   I KV K   C R EVYV  RN G#  V  GL I R  R   AS VTG A  L SFI  V WC P      N NG   ELP VS# R  P P
Conservation:  3331311664329853653635262531125142439838489377384452444812732544386179686745972696245322234239333824
SS_PSIPRED:             HHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHHHHHHH       E     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD                                                                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSKMKVAIDETWDSQSVSPWWQQMRTACIQSENNGAALLSAHVGHSVAAQISNNMTEKKFSQTVLGADSEALTDSWEALSLDTEYWKLLLKQLEDCLILQ 900
BenignSAV:                                                                   A                                     
gnomAD_SAV:       R    N      F   R*   # V     K   #  PVRA RF   E# K        #A SR  L        # Y    C   P  K    F   
Conservation:  7717466454398284568888859157366454798884738554563123112244444522132533353347755765475725553674654475
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH           HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH           H      HE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH           HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:                                                             DDDDDDDDDDDDDDDD                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLLHSKGNTQTSKVSSLQAEPLPRLSVKKLLEGGKGGIADSVAKWIFKQDFSPEVLKLANEERDAENPDEPKEGVNRSFLEVSEMEMDLGAIPDLLHLAY 1000
BenignSAV:                                                                    H                                    
gnomAD_SAV:          # NRS EA   L     K  I R   E IVVF N I  CV      TK    VD   N       N D   N P    I  N EV    V   H
Conservation:  4974542111211142223554134656378566496589257966864332502931210110020111001001101011011103122324580344
SS_PSIPRED:    HHH                       HHHHHH     HHHHHHHHHHH    HHHHHHH                   HHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH                       HHHHHH    HHHHHHHHHHHH    HHHHHH HH                 H  H HH      HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH                      HHHHHHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHH                        HHH  H HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDD                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:              DDDDD  D                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_IUPRED2A:             D DDDD                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
MODRES_P:      T              S                                                             S                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EQFPCSLELDVLHAHCCWEYVVQWNKDPEEARFFVRSIEHLKQIFNAHVQNGIALMMWNTFLVKRFSAATYLMDKVGKSPKDRLCRRDVGMSDTAMTSFL 1100
PathogenicSAV:                                                    C                                                
BenignSAV:                                                    R                                           T        
gnomAD_SAV:    D LS     N  Y Y Y GNI R   NA K H #   VGY  HV   RI       I  ML I        ITV I   S   I L     T IVT Y V
Conservation:  3679398436463698698388799788953237027566942717567838543656488457459765795799996898999988786692655385
SS_PSIPRED:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH      HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH       HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH HHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH   HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSCLDLLQILMEADVSRDEIQVPVLDTEDAWLSVEGPISIVELALEQKHIHYPLVEHHSILCSILYAVMRFSLKTVKPLSLFDSKGKNAFFKDLTSIQLL 1200
BenignSAV:                                      L                                                                  
gnomAD_SAV:    ST  G I      N  TV #  TM GA  V HCM     V    P   R     A Q      T  VFIW     M A LHL     T#V  E  T    
Conservation:  5683298755597743247323625349749125674277467755862678698596346524733342833644767497846876968678565896
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHH        HHHHHH      HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH       HH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HHH        HHHHH       HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH   H H H HH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH             HHHHHH       HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                 DDDDDDDDDDDD                                                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PSGEMDPNFISVRQQFLLKVVSAAVQAQHSATKVKDPTEEATPTPFGKDQDWPALAVDLAHHLQVSEDVVRRHYVGELYNYGVDHLGEEAILQVHDKEVL 1300
BenignSAV:          Y                        T                     S                                               
gnomAD_SAV:       D Y Y    #       F   IRS   #AMLN   #  A   SR  #G SV   Y  Y    N GA   R   G N C A  F        R     
Conservation:  9584484344539756923454547313011111100211110111212018423433542278524736465673888649392468742448295789
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  HHHH
DO_DISOPRED3:                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:                                    DDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_IUPRED2A:                                 DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90   
AA:            ASQLLVLTGQRLAHALLHTQTKEGMELLARLPPTLCTWLKAMDPQDLQNTEVPIATTAKLVNKVIELLPEKHGQYGLALHLIEAVEAISLPSL 1393
BenignSAV:                                   I                                                              
gnomAD_SAV:         LFMR SVVYV  QI     T   T I      L  P  L H    QL T  A #     TVR   E  K    FY T T   TYF P 
Conservation:  788995749998753775174434386866686587785777553573332575115436524648298638797457859387463311301
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHH      HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHH      HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                               DDDDD D                                       DD
DO_SPOTD:                                                                                                   
DO_IUPRED2A: