Q9H3S7  PTN23_HUMAN

Gene name: PTPN23   Description: Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23

Length: 1636    GTS: 1.858e-06   GTS percentile: 0.602     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 10      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 885      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEAVPRMPMIWLDLKEAGDFHFQPAVKKFVLKNYGENPEAYNEELKKLELLRQNAVRVPRDFEGCSVLRKYLGQLHYLQSRVPMGSGQEAAVPVTWTEIF 100
gnomAD_SAV:           HVV Q         Y         T C #    CD     V       LHF Q V C   #C  F#  R  R      LSE  T   I     
Conservation:  5223442746364544563513122223553445465653644474475255344536485546642569749777664675664033475433345536
SS_PSIPRED:            EEE           HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EE     
SS_SPIDER3:            EEE    E      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEEE E   
SS_PSSPRED:            EEEE         HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEE   
DO_DISOPRED3:  DDD                                                                                                 
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGKSVAHEDIKYEQACILYNLGALHSMLGAMDKRVSEEGMKVSCTHFQCAAGAFAYLREHFPQAYSVDMSRQILTLNVNLMLGQAQECLLEKSMLDNRKS 200
BenignSAV:                                                                 L                                       
gnomAD_SAV:                KL    C   V     A V  QM      F   R   T S  T  W YLL    I INH N MP I F  A     F   LT     N
Conservation:  6662656376366666476797999939974969577799969999999679674775776444773757476966747797799979999977997999
SS_PSIPRED:       EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH
SS_SPIDER3:        EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
SS_PSSPRED:        E    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FLVARISAQVVDYYKEACRALENPDTASLLGRIQKDWKKLVQMKIYYFAAVAHLHMGKQAEEQQKFGERVAYFQSALDKLNEAIKLAKGQPDTVQDALRF 300
PathogenicSAV:                                Q                                                                    
BenignSAV:                                                                 K                                       
gnomAD_SAV:      M CV#T      N V W     N VL   #L  N   #     CH#  M Q  #    K   Q#R Q T     VN  SV  R  R *S  M EV H 
Conservation:  6979777799657754636475565667747645757667627753676666669677656774757756475846365946757467563336846636
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TMDVIGGKYNSAKKDNDFIYHEAVPALDTLQPVKGAPLVKPLPVNPTDPAVTGPDIFAKLVPMAAHEASSLYSEEKAKLLREMMAKIEDKNEVLDQFMDS 400
PathogenicSAV:  V                                                                                                  
gnomAD_SAV:     V  T E  S  E  DN#V Y V#T V     I       T #        R  NV  R  S  V K             WKIT   *  SD   K VE 
Conservation:  5374567646665786676775445165382345886975457647796469979794799975666567685686656684245444264446438666
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH           HHH                   HHH     HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH   E       HHH         E         HHHH   HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH H  EE                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                         DDDD D  D                   DDDDDDDD                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        DDDDD DDD                                                   DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQLDPETVDNLDAYSHIPPQLMEKCAALSVRPDTVRNLVQSMQVLSGVFTDVEASLKDIRDLLEEDELLEQKFQEAVGQAGAISITSKAELAEVRREWAK 500
PathogenicSAV:                               W                                                                     
gnomAD_SAV:    V    KML  V #   V  R #   V   IWAN I    RF     ##CM  GV  Q V HQ  AN   Q     VA  TE             #Q * T
Conservation:  6337563645442612573376679767776666755744677376666668444625431564244215314152242022012221224275267427
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHH       HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H   HHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                     D                                 DDDDDDDDDBBBBBBD   DDDD  DDDDDDDDDD            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:           DD   D                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YMEVHEKASFTNSELHRAMNLHVGNLRLLSGPLDQVRAALPTPALSPEDKAVLQNLKRILAKVQEMRDQRVSLEQQLRELIQKDDITASLVTTDHSEMKK 600
PathogenicSAV:                                L                                                  R                 
BenignSAV:                                               L                                                         
gnomAD_SAV:    CI   G  F      YC     IS  G   RLP HF#    IL V QD  VM     HS  N  KVQ  #M    R C F RR   I      HY    N
Conservation:  9345833653684689689558626899959765274238929184367235442585562992996499166546686465588683378745425451
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH   HH HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                         DDD                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFEEQLKKYDQLKVYLEQNLAAQDRVLCALTEANVQYAAVRRVLSDLDQKWNSTLQTLVASYEAYEDLMKKSQEGRDFYADLESKVAALLERTQSTCQAR 700
PathogenicSAV:                                  K                                                                  
gnomAD_SAV:      KD   R*ER          T  H FSG A T E  TPMQQ   N EH  D M  N L  C VF   T  L     L T   T     QK#M     DH
Conservation:  3523463353353465385535633343477423432433532521322363335538648466575752443485388366626332854322313223
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                             D D DDD DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EAARQQLLDRELKKKPPPRPTAPKPLLPRREESEAVEAGDPPEELRSLPPDMVAGPRLPDTFLGSATPLHFPPSPFPSSTGPGPHYLSGPLPPGTYSGPT 800
gnomAD_SAV:    KT        K   TALLW   A L   C#*DR EM TE#T# KPC  AA TM   Q R I     #L             L#S SVP LSL SS LV  
Conservation:  3217221444323523636824368240130110112113162262425431121120222111211121111124112111122111211120112201
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH                                                                                       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH                     H                                                                  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH                                                                                       
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                      S                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLIQPRAPGPHAMPVAPGPALYPAPAYTPELGLVPRSSPQHGVVSSPYVGVGPAPPVAGLPSAPPPQFSGPELAMAVRPATTTVDSIQAPIPSHTAPRPN 900
PathogenicSAV:                             L                                                                Y      
gnomAD_SAV:         GTSR L V APTR     P V PLD S   Q   ERRM N  CM   L     RH L S S   #LK   V W  S R     V M  YR SW  
Conservation:  0014102001110012011010102101211211111111111111111111111221113111211112111111234344332333242232011230
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTPAPPPPCFPVPPPQPLPTPYTYPAGAKQPIPAQHHFSSGIPAGFPAPRIGPQPQPHPQPHPSQAFGPQPPQQPLPLQHPHLFPPQAPGLLPPQSPYPY 1000
BenignSAV:                                                T                                                        
gnomAD_SAV:    TI#V  LL  # LLLRLPLML #   ET  #    Y       T  A SGTAS #HL LR  L   SAT SR   F  H T F S    R  T     LC
Conservation:  1121020011112121311021011111112131221033102110112101111111112111120012220122222121211310231011221221
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                                                            PQPQPHPQPHPS                                    
MODRES_M:                                                       R                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APQPGVLGQPPPPLHTQLYPGPAQDPLPAHSGALPFPSPGPPQPPHPPLAYGPAPSTRPMGPQAAPLTIRGPSSAGQSTPSPHLVPSPAPSPGPGPVPPR 1100
gnomAD_SAV:    V  L  VV L TA Y H  Q T#P#R  TP  V S R ARARH #P  M  DLV    SLD K# L ALL LP P R    H     #  F   AR  SC
Conservation:  4212122211222010111312111222311312210021011111111110212132321231131111231122110531221212122424331211
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPAAEPPPCLRRGAAAADLLSSSPESQHGGTQSPGGGQPLLQPTKVDAAEGRRPQALRLIERDPYEHPERLRQLQQELEAFRGQLGDVGALDTVWRELQD 1200
gnomAD_SAV:       TQT#R V#QATT S      L  HR VPHALRS  S       E    H#S V L   W S  Y VG Q  RL# G  QDEQ      H  C#  K 
Conservation:  1321321222211212354525332333641212322233628443532442342324355149431543513620365144216122417611664664
SS_PSIPRED:                   HHHHH                                     EE        HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                   HHHH                                                HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                   HHH                                                 HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD         DDDDDDDD
MODRES_P:                           SS       T                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AQEHDARGRSIAIARCYSLKNRHQDVMPYDSNRVVLRSGKDDYINASCVEGLSPYCPPLVATQAPLPGTAADFWLMVHEQKVSVIVMLVSEAEMEKQKVA 1300
PathogenicSAV:                                                  K                                                  
gnomAD_SAV:    T  R  Q H V #   F    W  # I C   H   CA    CT   FMKA      LVM      LD  PE   V    QL    T IA   I  R  V
Conservation:  3553435457776797746766553285541555431455455545514334533451323344753655575777536455633634355264344672
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHH                  EE           HH          EEEE       HHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HEEHH                 EEE       E EEEEE         EEEEE      HHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHH     HHHHHH                EEE                       EEEE      HHHHHHHHHHHE  EEEEEE  HHHH HHHH 
DO_DISOPRED3:         DDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                           DDD                                                                   D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RYFPTERGQPMVHGALSLALSSVRSTETHVERVLSLQFRDQSLKRSLVHLHFPTWPELGLPDSPSNLLRFIQEVHAHYLHQRPLHTPIIVHCSSGVGRTG 1400
PathogenicSAV:                                L                                                                    
gnomAD_SAV:    H    K DRR   SV   V C IC  K  MV## TP  #G R  HA A# R   *     SN   KFVH  K   TY    WL QMAVT   R   SHM 
Conservation:  3226143432213533241433331333434363355524532244536363334735314333114223233333335213331173444553856348
SS_PSIPRED:              EEE  EEEEEEEEEE   EEEEEEEEEE     EEEEEEEE            HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE      HHH
SS_SPIDER3:             EEEE  EEEEEEEEEE   EEEEEEEEEE     EEEEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE     HHH
SS_PSSPRED:               EE  EEEEEEEEE    EEEEEEEEEE     EEEEEEE             HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE      HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   
ACT_SITE:                                                                                                 C        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AFALLYAAVQEVEAGNGIPELPQLVRRMRQQRKHMLQEKLHLRFCYEAVVRHVEQVLQRHGVPPPCKPLASASISQKNHLPQDSQDLVLGGDVPISSIQA 1500
gnomAD_SAV:    D T     GR M G  VV K    LQ#IQ     V  #E QF   CKT  G LK    C    S#     #V  IR         H   SR M  # T* 
Conservation:  3646685636323441215232123222332333233211254242442212444473567113320102212111124245647777767333336553
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH  HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                         DDD   D                               DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TIAKLSIRPPGGLESPVASLPGPAEPPGLPPASLPESTPIPSSSPPPLSSPLPEAPQPKEEPPVPEAPSSGPPSSSLELLASLTPEAFSLDSSLRGKQRM 1600
BenignSAV:                                                        P                                                
gnomAD_SAV:      V    # S#  GYLA  VA  V TL FLT RPL#AN V YF LAA# FLP D S  E KL       W #RPF      A    TL     V#  RQI
Conservation:  3455655251211012210020011120112111121121322214110211010112000010212211213243536462544645466431463344
SS_PSIPRED:    HHHH                                                                        HHHHHH  HHHH            
SS_SPIDER3:    HHH                                                                         HHHHH   HHHE           E
SS_PSSPRED:    HHHH                                                                        HHHHHH                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30      
AA:            SKHNFLQAHNGQGLRATRPSDDPLSLLDPLWTLNKT 1636
gnomAD_SAV:       #  RPR R*  Q  QLT  SFT QN     S  
Conservation:  453454553274623220211878418897858461
SS_PSIPRED:     HHHHHH                HHH          
SS_SPIDER3:      HHH                  HHH          
SS_PSSPRED:                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
MODRES_M:                    R