Q9H400  LIME1_HUMAN

Gene name: LIME1   Description: Lck-interacting transmembrane adapter 1

Length: 295    GTS: 1.828e-06   GTS percentile: 0.590     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 124      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGLPVSWAPPALWVLGCCALLLSLWALCTACRRPEDAVAPRKRARRQRARLQGSATAAEASLLRRTHLCSLSKSDTRLHELHRGPRSSRALRPASMDLLR 100
gnomAD_SAV:     V S A* #    #   W V   ##        S*N  V    TW RG   #  E T AVT      F     PHS  YQ  Q #C      LTT     
Conservation:  9993999999939999999999399399999999993399999099999399999309933333333333333333999999399303333399399999
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                         
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HH    HHHHHHHH        HHHHHHHHH       HHH                    HHHH 
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H   HHHHHHHHH        HHHHHHH         H   H  H                E   
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH      HHHHHHHHHH                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDD DDD DDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D  DDDDDD                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                        DDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDDDDDDDDDD       
LIPID:                                    C  C                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PHWLEVSRDITGPQAAPSAFPHQELPRALPAAAATAGCAGLEATYSNVGLAALPGVSLAASPVVAEYARVQKRKGTHRSPQEPQQGKTEVTPAAQVDVLY 200
gnomAD_SAV:      S  M T    S    C  A  KQ Q        E  VS *    #L     SA NR   R  T C C        C  *AR     K I     HIP 
Conservation:  9999333393393330033990999903933339333399099999999999999999999999333339333393393333930930033999999999
SS_PSIPRED:                                                                   EEHHHHHHHH                    HHHHHHH
SS_SPIDER3:                         HHH                    E                   HHHEHHH                     HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                     EHHHHHHHH                   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             DDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                DDDDDDDDDDDDDD  DDD                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
REGION:                                                    YSNV                  YARV                             Y
MODRES_P:                                                  Y                     Y                                Y

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRVCKPKRRDPGPTTDPLDPKGQGAILALAGDLAYQTLPLRALDVDSGPLENVYESIRELGDPAGRSSTCGAGTPPASSCPSLGRGWRPLPASLP 295
BenignSAV:               L                                                                                    
gnomAD_SAV:            T AV    S E  #R V    V NR  EAFLR # N GRS P  #         S D N S R  MLR     R W S       V 
Conservation:  99999939999999999339993999999939999399993999393399999939939999399399999339999999999999399999039
SS_PSIPRED:    H                                                 HHHHHHHHHH                                   
SS_SPIDER3:    HH                                                HHHHHHHH H                            E      
SS_PSSPRED:    HH                                                 HHHHHHHHH                                   
DO_DISOPRED3:            DDDDDDDDDDDDDDDD                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     D  D  DDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  DD DD
REGION:        SRV                               YQTL               YESI                                      
MODRES_P:                                        Y                  Y S