Q9H6L5  RETR1_HUMAN

Gene name: RETREG1   Description: Reticulophagy regulator 1

Length: 497    GTS: 8.72e-07   GTS percentile: 0.169     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 218      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASPAPPEHAEEGCPAPAAEEQAPPSPPPPQASPAERQQQEEEAQEAGAAEGAGLQVEEAAGRAAAAVTWLLGEPVLWLGCRADELLSWKRPLRSLLGFV 100
gnomAD_SAV:        TA##  K  R  #T    PR    L    T  PR  DV V G      V     D TSW   T N   R # PR C PVE   N     G VV   
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111101111001010000100010000000000000000110211210211011
STMI:                                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMM
SS_PSIPRED:          HHHHH      HHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
SS_SPIDER3:           HHHH      HHHH            HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHH                       HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AANLLFWFLALTPWRVYHLISVMILGRVIMQIIKDMVLSRTRGAQLWRSLSESWEVINSKPDERPRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSLFKQQSPGKFCLLV 200
BenignSAV:                               C                                                                         
gnomAD_SAV:    # S   C      RG H V  I  FWHL V V   VIF# I S P RTGP  N #F      D      S    R  #NV   A#FV   *R   I FP 
Conservation:  1110002422322251213331122212112223112221111101020110363232311321422322333243410252114216823689488343
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            E       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEHH
DO_DISOPRED3:                                                    DDDD D                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CSVCTFFTILGSYIPGVILSYLLLLCAFLCPLFKCNDIGQKIYSKIKSVLLKLDFGIGEYINQKKRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKE 300
gnomAD_SAV:      M    M     #  F   C   V   F S L S AT      #   L         Q   P  S TTA     C    G *Y      E# PM V  K
Conservation:  8434443544825678445382255124447622222332243034442715546521244114122212100110012147364655583453222365
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH     HHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH H  HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH HHHHHHHHHHH        HHHH H      HHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH      HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD
DO_SPOTD:                     D           DDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                      DDDDDDDDDD                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEEVFSRDLSDFPSLENGMGTNDEDELSLGLPTELKRKKEQLDSGHRPSKETQSAAGLTLPL 400
BenignSAV:                                                                                   E  T                  
gnomAD_SAV:     FG    #L    S S I S    SP#K  I E VE*L     PGNI E SA  Y  V    E     F  D      E  T# TR  QMR   V     
Conservation:  7345776497465578648689673795973977585548529426825887416312336767245435100010100030011000110111121112
SS_PSIPRED:                                            HHH                  HHHHH     HHH HHHHH       HH           
SS_SPIDER3:                                          HHHHH                   HHH       H   HH H                    
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSDQTFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPIPEEDTDTEEGDDFELLDQSELDQIESELGLTQDQEAEAQQNKKSSGFLSNLLGGH 497
gnomAD_SAV:      N N   I#  V   F       M    G  P V    DT    Y  S   N              N  A I* * P  H  RT  S F D  ASR
Conservation:  0111211121132231432344345324313211101000112236682714789969886893535215231121100111121134754345322
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HH          HH  HHHHHHHHHHH     HHHHHHH      HHHHHH   
SS_SPIDER3:         HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHH      H HHHHH      HHHHH    
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHH        HHHHHHH                      HHHHHHHHHH                  HHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDD D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D   D   D                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        
MOTIF:                                                             DDFELL