Q9H6S0  YTDC2_HUMAN

Gene name: YTHDC2   Description: 3'-5' RNA helicase YTHDC2

Length: 1430    GTS: 1.31e-06   GTS percentile: 0.360     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 721      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSRPSSVSPRQPAPGGGGGGGPSPCGPGGGGRAKGLKDIRIDEEVKIAVNIALERFRYGDQREMEFPSSLTSTERAFIHRLSQSLGLVSKSKGKGANRYL 100
BenignSAV:                L                                                                                        
gnomAD_SAV:      G#NC  #  L L   R# R  LR   D S SRV  E HV        TV   H  H #EK       FN A  S   QI    R   N     #    
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111113111111111111111111112111111111
SS_PSIPRED:                                              HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE     HHHHHHHHHHHHH   EEEEE      EE
SS_SPIDER3:                                              HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE  EEEE
SS_PSSPRED:                                              HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHH  EEEE      EEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDDDDD DDDDDD  D          DD      DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVKKKDGSETAHAMMTCNLTHNTKHAVRSLIQRFPVTNKERTELLPKTERGNVFAVEAENREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQE 200
gnomAD_SAV:               #     I      Q       I  L D  H   VRISK E    F       N    Q  S L#   AI # Y  YA T T   L   K
Conservation:  1112021111111111111112321241343434613255211111111111113342311422323111123453111271114041461511111111
SS_PSIPRED:    EEEE                HHHHHHHHHHHHH    HHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEE               HHHHHHHHHHHHH     HH HH           HHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEE           EE   HHHHHHHHHHHHH      HHH              HHHHHHH HHHHHHHH          HHHHHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:            D D D                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD DDDDDDDDDDD         DDD        DDD D         DDDDD  D  DDDDDDDDDDDDDD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EIVKIIKENKVVLIVGETGSGKTTQIPQFLLDDCFKNGIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIRLESRVSPKTLLTFCTNGVLLRTL 300
gnomAD_SAV:         S K ELA  A  N     S  S V        DV    V  #A Q   VT V    S  Q KM RRV              IVI     LF C  
Conservation:  1111111111111111111111111111111111121112461112532124333223223336331231112821111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH  EEEEE      HHH HHHHHHHHHHH     EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH HH      HHHH         EEEEEE  HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH  EEEEE      HH HHHHHHHHHHHH    EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEHH        EEEEE HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  EEEEE           HHHHHHHHHHH   EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHH         EEEEEE HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                      GETGSGKT                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLKYKKE 400
gnomAD_SAV:    TT   MFL    IMM    Q N L Y    EFTV WP  S      CG    I   L  CA  T #N     L    I   GV     F K #I  F   
Conservation:  1111111111111112434351433311121332112211113131143311111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    H         EEEEE  HHHH    HHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHH    EEEE       EEEEHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H        E EEEE HHHH      HHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHHHHH    EEEE  EEEEEEEEEHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H          EEEE           HHHHHHHHHHHH    EEEEE    HHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHH       HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                  DDDD
DO_SPOTD:                                                                                                         D
DO_IUPRED2A:                                                                                                 D DDDD
MOTIF:                        DEVH                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVD 500
gnomAD_SAV:      H    * I #Q     A# L L F   K  P A   C  Q    E AVNK    # KRP A      # S A T    NV#DSVE    V   I    
Conservation:  1111101210113111113000101122012111111111111111111111111111111111111111111111111141221131112211121131
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH     HHHHH     HHH       HH   HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    HHHHHH H       HHH HH  H  HH        HH             HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHH      HHHH                                HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DD DDD   DD                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD         DDD DDDD                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD    DDDD                D                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YRHSETSATALMVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFD 600
gnomAD_SAV:    CK N    I   I   HS  GELG  MG  TS    T   CI S    Q #R  V     THGDS   R  H #     S   PIDG  GF  T  Y SN
Conservation:  1232114243542324244131163111465310124225303231111123231111111110012111146111111221412134263632533413
SS_PSIPRED:            HHHHHHH    HHHHHHHHH              HHHHHHHH    HHHHHHHHHHH       HHHHHH       HHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH             HHHHHHHH     EEE                HHHH       HHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH             HHHHHHHH   HHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDD               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVNDV 700
BenignSAV:                                                        N                                                
gnomAD_SAV:    G#   SG T #   D       DG       F KV   K CV   ENQ  HT L   F   Y #V I N  N#  I   # P  #VC S T I    S  
Conservation:  3224611111111235412211134546556556411324231145223211111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHH       EEEE   HHHHHHHHHHHHH           EEEEE      HHHHHHHH       EEEEEEE  HH    HH E
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHH       EEEE   HHHHHHHHHHHH   H H      EEEEE      HHHHHHH        EEEEE    H     E  E
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHH      EEEEE   HHHHHHHHHHHH           EEEEEE      HHHHHHHH       EEEEEE    E       E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                          DD                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEP 800
gnomAD_SAV:     S   A    A  #G V  AKI  #AR    G#  WI  S Q G# V# H  GIV  HHVM    LQ     S  I# #NN  G  S  V   #K DS  
Conservation:  1111111111322574251111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    EEEEE       EEE     EE EEEEEHHHHHHHHH         EEEEEE HHHHHH HH   HHHH   HHHHHHHHHHH      HHHHHH     
SS_SPIDER3:    EEEEE     E EEE    EEEEEEEEE HHHHH H          EEEE  EHHHHH         EE  EHHHHHHHHHHH      HHHHHH     
SS_PSSPRED:    EEEEE                EEEHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE   HHHHHH      HHHHH  HHHHHHHHHHH      HHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPALIVRNAVQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMAL 900
gnomAD_SAV:    LL  V    IHV Q VESV IR     V   F Y  I S IAIV  F I          T    SFQ#  I  I T E C TV S RC   RT T  L  
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111212424225211111111153574434
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH   E       HHHHHHH       HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH       HHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRAFQAWQKARSDGWERAFCEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPKEKK 1000
gnomAD_SAV:      EL      *     Q    E  V   AVGK TS       E         Q V   #EI  D      I      RVC D  ###  SVG AE R  #
Conservation:  3223411111111145221111111111114211334233331656353542663344444315645523111111111111112411111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHH       HHHHHHHHHHHH   EEEE     EEE     E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHH       HHHHHHHHHH     EEEE    EEEE     E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHH    EEEEE    EEE     E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTA 1100
gnomAD_SAV:     Q   S G T LRC  SS  DDE  PV T LAVCF     S TR    T      MA AM     S TF    P KL          G#         AT
Conservation:  1111111111111111111122322123133533425111111111111111111111111111111111111111111111111111141111451111
SS_PSIPRED:    EEE                    HHHHHH    EEEHHHHHH    EEEE      HHHHHHH                                     
SS_SPIDER3:    EEE HHHH               HHHHHH    EEEEHHHH    EEEEEE     HHHHHHH                              HH     
SS_PSSPRED:    EEE                  HHHHHHHH    EEHHHHHHHHHHHHHEE      HHHHEEE    E                                
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDD                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_IUPRED2A:                D                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
MODRES_P:                                                                                              SS S        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLAALKLDEWLHFTLEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSAGLQQPSGIGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRK 1200
gnomAD_SAV:     V#  T GG  R SQDSQ PGS P  K   #G# FCQR  ACTS  E E   V  V P V  K   SA    F        VCL   S  #  M K   R
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:      EEEEE  EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH  HHH                                  
SS_SPIDER3:     EEEEEE  EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HH HHHHHHHHHHH    HH                 HHH              
SS_PSSPRED:      EEEEE  EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH                                       
DO_DISOPRED3:                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYKDRGILHPKRGTEDRSDQSSLKSTDSSSYPSPCASPSPPSSGKGSKSPSPRPNMPVRYFIMKSSNLRN 1300
BenignSAV:                                                                                          V              
gnomAD_SAV:     L  AV CV  I#SQ   L      SY HL   NT VVY# Q #  Q G#FCV  #  G HATL     SL    V E AL# R VA QF  T     G 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112467445645144
SS_PSIPRED:                                                                                           EEEEEEE     H
SS_SPIDER3:                                                                                            EEEEE      H
SS_PSSPRED:                  HHH                                                                      EEEEEEE    HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD    D D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          
REGION:                                                                                                     KSS    
MODRES_P:       S                                                            S   S             S                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEISQQKGIWSTTPSNERKLNRAFWESSIVYLVFSVQGSGHFQGFSRMSSEIGREKSQDWGSAGLGGVFKVEWIRKESLPFQFAHHLLNPWNDNKKVQIS 1400
gnomAD_SAV:         RNAV        WR  L    RGV   IY IK   R     W   QT  Q # E   PAV   SQ V M# D     C  # F    N       
Conservation:  4245434347542524615851740122172746664566286744451724214242477212486383636434436592141552846643647557
SS_PSIPRED:    HHHHHH         HHHHHHHHHH   EEEEEEEE       EEEE   HHHHHH           EEEEEEEE     HHHHHHHH        EEE 
SS_SPIDER3:    EHHHHH       H HHHHHHHHHH    EEEEEEE     EEEEEEH HHHHHH    H         EEEEEEE    HHHHHHH        EEEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHH         HHHHHHHHHHH  EEEEEEEEE                               EEEEEEEE    HHHHHHHH       EEEE 
DO_DISOPRED3:      DDDDD  DDDDD                                   DDDDDDDD                                      D D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDDDDD                              DDDDD   DD DD                                           
BINDING:                W                                                 W                                        

                       10        20        30
AA:            RDGQELEPLVGEQLLQLWERLPLGEKNTTD 1430
BenignSAV:             Q                     
gnomAD_SAV:     V      QL  H#V  R HFL  GNK A 
Conservation:  774833231240454033121111010002
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:        EE H HHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:   DD DDDBB           DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                             DDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DD                         DD