Q9H9C1  SPE39_HUMAN

Gene name: VIPAS39   Description: Spermatogenesis-defective protein 39 homolog

Length: 493    GTS: 1.471e-06   GTS percentile: 0.434     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 232      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNRTKGDEEEYWNSSKFKAFTFDDEDDELSQLKESKRAVNSLRDFVDDDDDDDLERVSWSGEPVGSISWSIRETAGNSGSTHEGREQLKSRNSFSSYAQL 100
PathogenicSAV: R                                                                                                   
BenignSAV:                                                  M                                                      
gnomAD_SAV:      #K         R   EP I EN  N        RQV S #* LMYH #     Q   N KT# N  R    PT S C AQK H #QQ Q C  F # P
Conservation:  7211314456453242415525442344322669773695553143445757435565968745789696759454310121423311225322221323
SS_PSIPRED:            HHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHH       HHHHHHHH           
SS_SPIDER3:            HHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH           EEE          H HHHH         HHHHH            
SS_PSSPRED:            HHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHH                          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDD                        D DD     DDDDDDDDD    DDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
MODRES_P:                          T                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKPTSTYSLSSFFRGRTRPGSFQSLSDALSDTPAKSYAPELGRPKGEYRDYSNDWSPSDTVRRLRKGKVCSLERFRSLQDKLQLLEEAVSMHDGNVITAV 200
gnomAD_SAV:       I   T   LV   # SEN L   G  L# AV   D   RI E    H I  CNS#VA *H W   IF     CF     #I K# II#    I I I
Conservation:  3631835666559666351353334462326231624686566773536831266531685287466713458585494684295515511486646657
SS_PSIPRED:             HHH          HHHHHHH         HHH   HHHHHH      HHHHHHHHH      HHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHH         HH HHH      HHHH HHH     H H       HHHHHHHHH      HHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:                           HHHHH       HH HHH               HHHHHHHHHH     HHHH  HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD  DD                                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:             D            DDD  D   DDDDDDDDDDDD   DDD DD                                               
MODRES_P:                      T   S  S     S T                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIFLKRTLSKEILFRELEVRQVALRHLIHFLKEIGDQKLLLDLFRFLDRTEELALSHYREHLNIQDPDKRKEFLKTCVGLPFSAEDSAHIQDHYTLLERQ 300
PathogenicSAV:                          R                                                                          
gnomAD_SAV:          I       Q    Q          F *T N N    FL L G S   #  Y *   K * ANR#     S    R L   PV V  R M   H 
Conservation:  6556476734758539611944692856468383354337244343846466375346335535252335466562844858436812464876687898
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IIIEANDRHLESAGQTEIFRKHPRKASILNMPLVTTLFYSCFYHYTEAEGTFSSPVNLKKTFKIPDKQYVLTALAARAKLRAWNDVDALFTTKNWLGYTK 400
gnomAD_SAV:           H     R     # Q S   T      A F        A         IH # K  V E        G C   Q CD  N    AR #   IR
Conservation:  6668449442522662559574967655847967776695757992646835866266544966566663354958686553906543684465979347
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHHHH           HHHHHHHHHHH           HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HHH H           HHHHHHHHHH            HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH       E 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH   HHHH            HHHHHHHHHHH           HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90   
AA:            KRAPIGFHRVVEILHKNNAPVQILQEYVNLVEDVDTKLNLATKFKCHDVVIDTYRDLKDRQQLLAYRSKVDKGSAEEEKIDALLSSSQIRWKN 493
BenignSAV:                                                                                        F         
gnomAD_SAV:      TAVA RW F   QN# V   R  #  SQ G   M     IE   R IIV  HQ    H    EH#      *V   NTE VFR L  Q RS
Conservation:  976965976787686784994366549426745142553551435952648446775686348318526543481532483146242443222
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                 DD
DO_IUPRED2A: