Q9HA77  SYCM_HUMAN

Gene name: CARS2   Description: Probable cysteine--tRNA ligase, mitochondrial

Length: 564    GTS: 2.731e-06   GTS percentile: 0.857     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 16      gnomAD_SAV: 325      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLRTTRGPGLGPPLLQAALGLGRAGWHWPAGRAASGGRGRAWLQPTGRETGVQVYNSLTGRKEPLIVAHAEAASWYSCGPTVYDHAHLGHACSYVRFDII 100
BenignSAV:                          R                  V    A                                                      
gnomAD_SAV:      S         A        V V  YC   G   VVS  VC   A    #    S   R    V M       #H   SAIC Y   AR   C G H  
Conservation:  1111111111111101000000000000111111111111110010100102020212211101213000003122232211111233221333538745
SS_PSIPRED:               HHHHHHHH                                EEEEE               EEEEEE     HH        HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                HHHHHH                                EEEEEE    EEEE EE    EEEEEE    H H HE   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHH                              EEEEEE      E  EE     EEEEE               HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:    DD                                   DDD D          D                                              
METAL:                                                                                      C                      
MOTIF:                                                                                        PTVYDHAHLGH          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RRILTKVFGCSIVMVMGITDVDDKIIKRANEMNISPASLASLYEEDFKQDMAALKVLPPTVYLRVTENIPQIISFIEGIIARGNAYSTAKGNVYFDLKSR 200
BenignSAV:     Q                                                                              F               N    
gnomAD_SAV:    #SV  R C   V T  DMRN G  VVEI S  S F TP T  CA   ERG EP  LHQLM      K T    Y #  LFVC  T LMT SD   N    
Conservation:  4844212531343243355543454424312212211231113623652851393524523335544243254155226513436711117375644130
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   EEEEEE    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH  HHHHHHHHHHHHH   EEE     EEEEE   
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHH   EEE     EEEEE E 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  EEEEE     HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH  EEE     EEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDKYGKLVGVVPGPVGEPADSDKRHASDFALWKAAKPQEVFWASPWGPGRPGWHIECSAIASMVFGSQLDIHSGGIDLAFPHHENEIAQCEVFHQCEQWG 300
PathogenicSAV:                   T                               L                                                 
BenignSAV:                    E                                                                                    
gnomAD_SAV:       #  MICMAR   R R# C  H  G   VG     R LV   L R R L    #F T P    V    V  VR    L Y#       K# YP# *R 
Conservation:  1116625211010110311012622127657761543254251476618777765563424413561147585993783895545626545644231255
SS_PSIPRED:                             HH    HHH                    HHHHHHHHHHH   EEE            HHHHHHHHHH      E
SS_SPIDER3:                             HHHHHHH                    HHHHHHHHHHHH      EE   H       H HHHHHH         
SS_PSSPRED:                             HHHHHHHH                    HHHHHHHHHHH     EE           HHHHHHHHHHHH    HH
DO_DISOPRED3:                      D D                                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                    DD                                                                                 
METAL:                                                                 C                        H   E              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NYFLHSGHLHAKGKEEKMSKSLKNYITIKDFLKTFSPDVFRFFCLRSSYRSAIDYSDSAMLQAQQLLLGLGSFLEDARAYMKGQLACGSVREAMLWERLS 400
BenignSAV:                                                                                  C                      
gnomAD_SAV:      V R #R  T S G  #P A   F          F N  P    QN  C   G NG PLH*V       V S GV#CT V   VV SFL KV     F 
Conservation:  3665949583328111756666354434333302133324623343223333321312230142115022224112411122531111111111462251
SS_PSIPRED:    EEEEE   EEE             EEEHHHHHHH  HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEEEEEEE    E  E     EEEHHHHHHH  HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHE   EE        H HHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                          K                                                                                
MOTIF:                         KMSKS                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STKRAVKAALADDFDTPRVVDAILGLAHHGNGQLRASLKEPEGPRSPAVFGAIISYFEQFFETVGISLANQQYVSGDGSEATLHGVVDELVRFRQKVRQF 500
BenignSAV:                                            K                                          W             I   
gnomAD_SAV:      EKTM VV       R  A VN  R Y#RS *  VF  QTQ#L  ST  D T  *  #L   A  Y #H *DI   S#V  MRD   K AQLQH AW  
Conservation:  0231141223322332224213221731144221121111112143214323221442235231132211120012010021413331332155115512
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH   E  HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                        DDDDDDDDDD                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                     DDDDDDD                                                           

                       10        20        30        40        50        60    
AA:            ALAMPEATGDARRQQLLERQPLLEACDTLRRGLTAHGINIKDRSSTTSTWELLDQRTKDQKSAG 564
BenignSAV:               TQ                               R          P     E   
gnomAD_SAV:     PVT K M  TGQ*      #  #G EN HWD    S  V   R I  M*#M  PTA GRE V 
Conservation:  3211111002241121144124323331231242113203323111114111110200111111
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHH HHHHHHHHH  EEEEE      EEEEE HHH       
SS_SPIDER3:    HH   HHHHHHHHHHHHH    H   HHHHHHHHH   EEEE    EEEEEE E  E       
SS_PSSPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH HHH  EEE       EEEEE           
DO_DISOPRED3:                                                        DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                             DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DD     DDDDD                     D             DDDDDDD   DDDD